Gene
Gene Model ID | aug_v2a.10962 |
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Locus | scaf4227 : 26560 ... 36924 : - |
To GenomeBrowser | scaf4227:26560..36924 |
Genes list of scaffold | scaf4227 |
Manual annotation
Study field | Apoptosis |
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Gene name | Caspase5 |
Annotation by Blast2GO
Annotation | GO |
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caspase-7 isoform x1 | GO:0006915 GO:0008233 |
Blast Hit to nr / sp
query | Subject ID | Subject Name | evalue |
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aug_v2a.10962.t1 | gi|530604406|ref|XP_005293940.1| | PREDICTED: caspase-7 [Chrysemys picta bellii] | 4.0e-36 |
Transcript
Transcript ID | aug_v2a.10962.t1 |
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Definition | - |
>aug_v2a.10962.t1 aaaatcaacagctcagctctgataggatgagccgtcctggaatttgcctgctgattaacaacgtgaaggactttactggt gaggagaacttactcacaaaccttttcaattcccttgcgtttaacgttcaggttaggcgagatctctcgatgatgaagat catcgaggtggcccaagaatttgctaagaaagaccacagtaggtacgactcgttcgtcttcatcgtgttgtcggaatgcc gcccaggtgaactaattgttggggtggatgcaaggaaggcgattctgaaagtcatgtccgagtttcgaccatgcaatagc acgtctttgaagaacaagcccaagctgtttttcgttctacggtttgtaaagacccaatccgcggaacgtcgcagtggtgg gactgaattctgcacggacctgaatgatgtgtcgcctcacttatttaacacatccaaagtgtgcccggaacaagctgatt tttttttagcttgtgccacctcaccaattgttaaagggaaaaagataaagccatcgttcaccgaggtaagactgttccac cgtattgttgaacttacacgaggttacgtcattgattagcaatttattctcagacaaccaaatgatgtaacttaactttg cttcaaagaacgcaagaaactaactagaatcattaaacagttttgtctttgtgaaaaactgagtgattcgacacggtgcc tcgagcttccttccacgaacccctcaacgcgcatacgcttaaaatacagactgagaggaaacccagctggatcaaaggct caggagtaacattcaatattggaatgaagataaatttctgcgagtttgattcagccacaaagccacacaatgaaaacaaa caaacaaacaaaacttcgagtctcacttcggattactttgtcaaatcattccattccagactgctaatgctaattatttt 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Protein
Protein ID | aug_v2a.10962.t1 |
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Definition | - |
>aug_v2a.10962.t1 MSRPGICLLINNVKDFTGEENLLTNLFNSLAFNVQVRRDLSMMKIIEVAQEFAKKDHSRYDSFVFIVLSECRPGELIVGV DARKAILKVMSEFRPCNSTSLKNKPKLFFVLRFVKTQSAERRSGGTEFCTDLNDVSPHLFNTSKVCPEQADFFLACATSP IVKGKKIKPSFTEMMVNAVRRYHQTYDLLEMLTLLNLWTDNLHKKNTLSNVMVPYVIHTLRNKVRFDFGQTHEPQISTQS SIPDLPSLSRYEQKTECAGYCVIINNLQFQGNDEADRKGSEQDVEKLRNLFKLLRFEVIIERELERDQIKGVAQEYGGKN HDKFVAFVLIVMSHGDEKDCIFGVDNDSISVRNLMKEFQAEKCPSLKGKPKILIIQACRGSRMSEDEGSDDYVESDIADP TEFGLADNLMDQFSVDSSLSKSVFPPETDFLLAFATVPGYVAFRLPSSGALFIQELVEVIEKDHGSHHLLDMLTEVTRRV VDRQNQAVHPPKYRVQVPAPVHTLTKLLFLEKERVHVAELKAERSLLKQKKALRAAEEDLELELEIVKAEARRKVLEELY RAHNPPLPCASSPPSVAASFTSIVIPSVSAPLPNEVALWPEAFVSTTQTTVTMETQVKAALQGPRISAATGSIVKNSPFN PQAAEFIPTTVADGTSSTPFTGHDLKNSKEIGHGISEI* |