Gene
Gene Model ID | aug_v2a.11525 |
---|---|
Locus | scaf4498 : 78 ... 10686 : + |
To GenomeBrowser | scaf4498:78..10686 |
Genes list of scaffold | scaf4498 |
Manual annotation
Transcript
Transcript ID | aug_v2a.11525.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.11525.t1 aagacaaacagccaccacagctcgagttcgagctgcaaaagactggtgatgttctattatctactgaaacgtggagtgat gatcatctgccaattgatattttactattgactgccgagggctgtgatttcttgagctgtttctccttcctggatcaacc tttcaaaagttacaagtttgggcttggtcatgtgtactttggatatatgggagatgccaggaaccaagaaaagttaaagg ttgcattggggaattgcgctaaaggagctgcagccccagggggctctttgacagttggtctgaaggcagttagagtcttg aggcctaaggctgtaatttcagtgggaacttgcatcagtttaggcttggaaaaggccagaattggagatgtagtcatacc ctcgaggctaatcacagagagttgcaaaactcctgccagtccacatcttggcagtcttgctcgaaatgctccctatgggt ggaaggctccgttgaaacatccagatggatgtgagattaaagtacattgcaatggtgatatcctgagccaatcactgata gcgatgtgtcaaattgtgaatatttgtgagcgacatcctggggcaattgcaattgagacagaaggcgaaggtatattatt actaaaaataggttaatattcagtttccctggagacttgatggtaagacacgttacaacagagaacgtaaaaacattatc cagtcatttcttacatatgtagttaagcagcaggactccagtgacaaacattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnncggtgaagagcggtggatatatacctcgacgcttcgcgtctcggtatatatccaccacta ttcacctccccttcgggggatagttgtatactataacaaaaatttcgcagttagactcgctttgaaagagagaccgaagg gaacttggaaatggcctgttgtttataccacatttctacaaagggtagatagcagcagcattgttggaagaggaaatcat ataccagctgatatgccctgccaaacccaaattgatttgttgacaggggcttcattcatccagtgggttgtgctatgtac ccacccttttaattagttgtgtctgaataaaaaaaactgctttaaaaggaaagaagccatatgatctattgtattcatgg taccttagatcaaggtgctttatcattgaaaagcaatcatttgacttgtctccttcgcagctgtcgttcgggatgtcaca caacgctccccttcctttcggggaagcgttgtgtgacatcccgaaagacggctgcgaaggagactattatttggcctctg atatggattcacactccagaactaaaggtacttgtattgtttttgtaagttgttgatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnng ttattggttgcaatgatctacaaagggccgatagagttgctgattgcagacatcgaattggagttgatgtactctgttgt tccctttgagtcattgaatattttttaattgctagatactgctttgccttttgggatttagagagaccagacattcctgt agtttatgcgcaattctgtttcccaggcttgataggagagagacattaccatatgcagaattctaacttcttaatttctt caatgcagtaaaatcatgaaaagaggtccattcatcccttgggaacctcaaatccaaaaagacaacgacagaatgcagcc ttccctgaaagtaaggcatcatttgtagttaaagaagtgaaaaaacgtttaaaagggaatgtcaatcagagtaggtgttc tttacagaaccaaagtatttacgcgatcccgttcaggcctgaatttcccttgtgcttaagtagcatagcaaaactaggaa gatcattaacattaaaattaaagtatttatgcggtaaatccagtttcggtaaaaaaaaaacaatttttttttcttggttg attttttaattgtttgtttggatgtgtgctagcaagtgaaagaaatgaaatgacaaaaaagcataggacattttttcact tgcatggcctggattaacttctataattttataagttgtctttgaagaaaagatctcattggcctgtgagatgcatttac gtagaagctgtctttaaaacgctgctatctgcataataattaaaagagacgttacaaagaaagaaaaaaattcacaaggc accttgggaaatggaagggtgcagcaggaaatggctgactcgtgacagcaggaaatggctgactcgtgaaaatcatttcc cttactgactgtgtttagtttgcagttatcctaaattttttaagtattcgtgtttcaatagaaagttgtagaagcgtagg tgggaactcttccattttctactaaagtgatttagttttgtttctctggtttggctcccacctggaatccaatactcgtt tcctccattttacgtacaactgcaaattaccttcagcataacactcctctaaaaccttaattctcaataactggcgggga aaatacgacacgcatgagaaaaaactcaactcggtacttttcactcgtgatgcactaaggattgaaatgtctggcagtaa gtgtcttaaatagtctaaacattaatcatttaccagtacgctaaaaaaaagaacatatgattttaattacgtctaatgct tctttcagccgatagggaaatctctaatgtggttgagttcctgaaaaaagagtataaccgacgagctgatttcagtccgc ttcagtggagcaaaggcatgaagttacaacttaaagaagtctatacaaagcttagagttgtatnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnntatttagcggcgtcacacatcgcccataaatttcgaagaagcgaatttcagatgttgaagcaaatgctatttcc tgtgaccgcgaggtcgaaatttaaacaagtatttgtatttgtgtgtggaatactgcgcgaggaagcaaatattgtctttg aacagattggactgaatttgctgcagaaacattgggactggttaaaatgcgacatgtccaccgcgatttttttcttggac agttgggaagaaactggaaacgctgaccgaatgtctaaaactctgtggtcattcttgccctttccacgccctctacacgt atggagtcgcaatcaatgggatgtcctttgctatgttctagagaagtgcacagaattttccgaggaactgacggtcgccg cgcctcaagttcacttttcaccacgtcttgtacctctttcatccatcctttacggaaagcttcctgatttgacatctttc atcttttatggagtctccatggctgatcctgcgttcgtttatgaaaatttgcggaagtggagcgtccgagaaaagtttac gtttgctttgtttgcagattatggagggagcgtgtctgaactccctgattttggattttcatctgtttgtcttaggattt gtggttcattggactcatcctcattgcatgatgttgagaatttgttgctacacaaatgtctgtcctctctttctattact gtatgtggagatgtacaggaatcgctggttgaggcgctcgcaaaaggccttgcaggagaaagtgttgtcaaattccttga tttgtgcgtcaatggaaattttagtttccgtggagcttatttattggaggagggtattataagaaatcgatcactgacaa atgttaagatttctgtcaacggggaacctacagaaaattggcaggttgttgcaaagaatcttcgcgcacaatttgcggag aaggcgatcctttcagaaatttatccaaacgcattcagcaaagtgaaagacaatcgggtgacacatttgaatccgttttt gtcaaagactgatttaaagcaacgaactgttactctaaatgtttggggtgagttgtgtggtgatggttgcaaagcagtgt gtgaggtcttactgcataccccggtgtctcacttgacgttaaatatccacggacaattgaccgatgaaattcttcgttac gtagcaagatgtgttgaacaacaggaaaagctctcgccaataaccatcaacgcttgggttgaaatgactgaaaaggaaaa cgagcttattaaagaacttggattggacaaaaatccattattttcattaaatgtgtgtggaaccagtgcacctttaaagg aatcaagtgatagcaaagttgtctctagtgacgagccacaatctctcattgcgctctttgagaaagcaactaaaggccnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaacacggtcttgg cgaagggttagcaggaaacacctctctgaaatcacttacactcgaactttactcctcttgtacctcttacgatgaatggg taattgctaagggtcttgcaagaaacacctccatagaatcactcacaatcaaaatgaggattgcttttcccgtgggtaat caatggaaacacggtcttggcgaagggttagcaggaaacgcctctctgaaatcacttatactggaaattgccttagagtc tacaggtgacaataaatggggacgttgtcttggtgagagtcttgcaagaaacacctcgctggaatcattcacaatcaaaa taatcaaggcttatgtcgagagcagtgaatggctccacggtcttggcgaagggttagcaggggacacctctctgaaatca cttacactggaaatttaccagcatcgttgtaggacattgatgcgtggtcttcgtaagggtggtaacatcgatgaatgggg aagcagtctagcaagaaacacctcgctggaatcactcagaatcaaagtaatcaagtctagtttcgtgagcgatgaatggg tatacggtcctggcaaagggttagcaggaaacacctctctgaaatcacttacactggaaattgacaacttttatccttgt atcgacccttcatggagatacgatcttggtgagggtctagcaagaaacacctcgctggaatcactcacattggcgattaa caactgtaatggcccgaacaatgaatggggacacgttcttcgcgagaatttagccaaaatcaactctctgaattcactga cactgacaattaacaacgtttcttacataagcgatgaatggggtgtcgcacttgccgagggtctagaaaaaaccgcatct ctgaagtcgattacattgacaatgaacaactatttttacgtgagcggtgtatggggcctcggtcttttcgagggttcagc aagaaacacgtctctgaaatcaatcacgctgtcaattaacaattatggtaccatgaagggagaacggagacacgatatta tcgagggtttagcaacacactcgtctctgacgtcagtcacactagcaattaataactatggtgacatgaagggagaatgg ggacattgtcttttcgagggttttgcaagaaacacctcgctgaattcactgacactgacagccaacaactatggtgacat gaacgaagaatggggatgcgctcttcgcgagagtttgagaaagagcaagtctttgactgaatgtaatttgatagtcgaca tttgtggtaaatgctgacttgtatcaagattacggttcacgcagcaaccaggtgggcactcgagactatattgggctaac agtcgtcaacttataatacactcatgtatttgaactgcagactgaaaagaattttcagtctatgatcctcgcagttatgc gctctcgttaagtagaagcgagaaaggcctgaactgaacattcctttcagtccgcagttcaaacaaacacctgaagtcca tgtattaacatcttacatgtagatttatatccatcatgcctgggctttggagcgatccgtataacgatcatctcctagtt ggaaacttcaagggggactgggtcgaggtatgcggagtgagtagacgtgtctttttgccgttccccaacgtttcactttt gagcaatgattttcggctgataattcgtatgaattctaaaagaaaagccaggaatagcagtgactcaagtacctgtggta gttcaccagtggagaaaagagcgagggagattttattaagctcaaactcctcgcccgaacgtttggtagttgggaattcg gaggttgtcgaggtcgtcgaaatgccagaaaatttagagtcgaaagttgacctcattcttgcgagactagagactatgga taaaaagctcgagaatattaataccgcagtgtcaaatctggagagtaaattcaacaaattggaagacagagttgtgaagc tcgaagacgctcaatcgaccacgaggaacacctttagagagatggaagaatttaatacacgagttaatgaagctaaagca accggtgagaaaataaaagaactttgtgtgaataaatgtaaagaattggaaaacaaattattgtatgctgaagtctatca gaggagagaaaatttgcgtttctacggaattgaggagactgatggaaacgaaaattcactgaaggtccttcaatccttct tggagcggcagtgtggaatcgaaccaggcatagaatttcagcgcgttcatagaattagaaatcctcgcagagatggaagc cctagagcgatcattgctcggttccttcgatatggagatagagaattgattttttcaaatgcaaaaatgctaaaggatac cgagtacaggatctctgccgacctgccgaaagaaatcgtacatcgaagg |
Protein
Protein ID | aug_v2a.11525.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.11525.t1 MGDARNQEKLKVALGNCAKGAAAPGGSLTVGLKAVRVLRPKAVISVGTCISLGLEKARIGDVVIPSRLITESCKTPASPH LGSLARNAPYGWKAPLKHPDGCEIKVHCNGDILSQSLIAMCQIVNICERHPGAIAIETEGEDQGALSLKSNHLTCLLRSC RSGCHTTLPFLSGKRCVTSRKTAAKETIIWPLIWIHTPELKVLVLFFKIMKRGPFIPWEPQIQKDNDRMQPSLKPIGKSL MCWEETGNADRMSKTLWSFLPFPRPLHVWSRNQWDVLCYVLEKCTEFSEELTVAAPQVHFSPRLVPLSSILYGKLPDLTS FIFYGVSMADPAFVYENLRKWSVREKFTFALFADYGGSVSELPDFGFSSVCLRICGSLDSSSLHDVENLLLHKCLSSLSI TVCGDVQESLVEALAKGLAGESVVKFLDLCVNGNFSFRGAYLLEEGIIRNRSLTNVKISVNGEPTENWQVVAKNLRAQFA EKAILSEIYPNAFSKVKDNRVTHLNPFLSKTDLKQRTVTLNVWGLAGNTSLKSLTLELYSSCTSYDEWVIAKGLARNTSI ESLTIKMRIAFPVGNQWKHGLGEGLAGNASLKSLILEIALESTGDNKWGRCLGESLARNTSLESFTIKIIKAYVESSEWL HGLGEGLAGDTSLKSLTLEIYQHRCRTLMRGLRKGGNIDEWGSSLARNTSLESLRIKVIKSSFVSDEWVYGPGKGLAGNT SLKSLTLEIDNFYPCIDPSWRYDLGEGLARNTSLESLTLAINNCNGPNNEWGHVLRENLAKINSLNSLTLTINNVSYISD EWGVALAEGLEKTASLKSITLTMNNYFYVSGVWGLGLFEGSARNTSLKSITLSINNYGTMKGERRHDIIEGLATHSSLTS VTLAINNYGDMKGEWGHCLFEGFARNTSLNSLTLTANNYGDMNEEWGCALRESLRKSKSLTECNLIVDICGKC* |