Gene
Gene Model ID | aug_v2a.11692 |
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Locus | scaf4585 : 25566 ... 28516 : + |
To GenomeBrowser | scaf4585:25566..28516 |
Genes list of scaffold | scaf4585 |
Manual annotation
Blast Hit to nr / sp
query | Subject ID | Subject Name | evalue |
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aug_v2a.11692.t1 | gi|156371489|ref|XP_001628796.1| | predicted protein [Nematostella vectensis] | 2.0e-22 |
aug_v2a.11692.t1 | gi|291224602|ref|XP_002732294.1| | PREDICTED: nudC domain-containing protein 1-like, partial [Saccoglossus kowalevskii] | 5.0e-11 |
aug_v2a.11692.t1 | gi|524888468|ref|XP_005100805.1| | PREDICTED: nudC domain-containing protein 1-like [Aplysia californica] | 9.0e-08 |
aug_v2a.11692.t1 | gi|390369171|ref|XP_793135.3| | 4.0e-07 | |
aug_v2a.11692.t1 | gi|597733964|ref|XP_007229289.1| | PREDICTED: nudC domain-containing protein 1 [Astyanax mexicanus] | 1.0e-06 |
Transcript
Transcript ID | aug_v2a.11692.t1 |
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Definition | - |
>aug_v2a.11692.t1 nnnnnnnnngctgattctttgaatgtttctgtgggccaaaatgtcttgttaagtggagaactgtttgcaaaggtcaactc caaagaaagtacttggacatgtgatggaagcaggtactaaaaataacctgcaacagaggtattaatggtacacttgtcag gttgttgtatttttattacagtttgaagtttctcttctcagattcatctttgactgaagatttctgtcttagtaatacca aattcaaccctactcctttttgtaaagaatgcctgttaaattcctaaatgctgcagttattataatattaatatttcctc aacagttccagaagtttcagctgcttttagatattattgtgtacaaataaaggttctttgatttaacttcataaatgtca taaatgtcagaacttttgcaattgtcattttctttcactgaggtgaccttttgtcctcaggcagtctttattagccaaaa gaaaaacaagtgattgaggctcctggaaatccttagtaattgattgatgttttctatttattataggtatttctaagatg accttgtcactaaaatttgctcagtgcttttgaaactagcacttttgtccacagaaatgttaaattttatcctccaaatg accttcatgtggttttttaacccatattctctcagccatatttcctctttctaaggttgttctagcattaggatcaacca attaaaccacataccagctaaggtggaagagggtccaatttccacttcagtcgaaatttctacctagggaaatggtcatt gccaatggatctttgtctggactggctaaaaatgctgctaagaatgtgattaattattgtttagggagctttagccaagt tcaccagtagctcagagttcttcttatcaggcggtaaccggtaaaatttaccggctcaagcaacagttcttataataatt accgcctgcaacctcttgaaggtttactaaaactatataagttcttctaaaaaataccagtcaggaattgtcccttacct gctgagctaaaacttagggagaacactggtagctggtggaagactttgaccagtgaagtcaaacgaaattggttttctcc caattgaacatgaacgattacagtaacttaactagccttgccaactgaaaaaaggtggatgtatttagattacatttctg cctcaaatgatttgtgataatattgtgaatttgttttagcgtggaagtggtgcttatgaaacagactcaagagcatcact ggagcagcgttgttagaggagatgaaagagggacatatgaactggttggagaagatgcagagagagtgaaagaaattcac aataggctggagcatcttacgtctgacaaaccagtgagtctgttgttgccgcttttaatgtgaaaaaggcaaattgctgc attgttacaaagccttgcggtatgaatcattcaattccatgcagctctgaccatggctgatacaatcgttctcaggatta attttgttgtttatcaaaataacctccccatatacatatcagttcatggtgaatttattaagttataaaggatttggagg aaatggaaattatgaataaaaattggatgaatttattttagctgaattttatttttgcttgtgcacagcaaccagaacag tggcaattgaaccagtgaaaacttaacgctctaactatttgctcaggggtttcaataatagccaggtagtgggtagatct agtaacaattttagcaacaaattcttgttaaaaaattttgcaaaaaattattttaagtcctgtgttgtaggaaagaaaag gaaagataaaagaaaggacattgtagcatgaatcttgccttttggaccacaaaaggtgaagcaaaggccaaaccaacagt taataaacgtttcaaaatgaagcaaaaaaatgtgcaatggaccagctgaaattgacaggaaactggatgaatactaatag ctcccaagaggtggtggctattagcatgttttgctccagcgtcacaacaaaagagatccaaggataaccattcttctgaa cagtgcttgagaacattgaaagggccaaatttttgtggttaaactttgatattatgctcctttttgtgttgataaatagt gcattgttctggaattaatttgagcagatgttcagtttttttttcctccaaattttcaaattggttgatttctaagagca aaaaagcaaagtaaaaataaacctcaaaataaaggataatgtgtctgcgagagtctaggatttcaaaatttcctgggggg ggcgggggcatgcccccagacctcctagaaaggagggccttccaaaataatgcctgcctgttatgctgaactgctccctt gtgccaaaatttattgaaacctctgtaatgcccaatattattatcgtgacttgtaaagagctgccatatacaagggagtt agaaaaagtggaccttgacccttaaaataatgtaattctttcacccatcccattgagggaaaaggtttgagatgcattat atctacaacgcccttgttaaaaatcactttttcaggtagccagtagtacattgtaaaaggattttttcacattacaatgt gttcttgtaaggatctgttaagttggcaagcaaatatgaagttaattctgacaaaatacctttaggttggtgacctcaga ggaaatactgtatcattttctgaccaacaatttgaagaatgtgacgctctgccagaggagatcaagtatatttttagact agacattgaaacaggggaagtcactcataaggtaactatttttcttttgcggtttgataattaattcaatacagtcctaa aaccttgtggagtagtctttttaaattttgcaatttagggcacatgacttcattaaaggtatgggctgaaa |
Protein
Protein ID | aug_v2a.11692.t1 |
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Definition | - |
>aug_v2a.11692.t1 MKQTQEHHWSSVVRGDERGTYELVGEDAERVKEIHNRLEHLTSDKPVGDLRGNTVSFSDQQFEECDALPEEIKYIFRLDI ETGEVTHKVTIFLLRFDN* |