Gene
Gene Model ID | aug_v2a.12032 |
---|---|
Locus | scaf4743 : 11406 ... 15878 : + |
To GenomeBrowser | scaf4743:11406..15878 |
Genes list of scaffold | scaf4743 |
Manual annotation
Study field | Retrovirus |
---|---|
Gene name | Adi-Retrovirus-related 69 |
Description | This gene model contains dUTPase domain. |
mRNA evidence |
Annotation by Blast2GO
Annotation | GO |
---|---|
deoxyuridine 5 -triphosphate nucleotidohydrolase | GO:0004170 GO:0046080 |
Blast Hit to nr / sp
query | Subject ID | Subject Name | evalue |
---|---|---|---|
aug_v2a.12032.t1 | gi|156399732|ref|XP_001638655.1| | predicted protein [Nematostella vectensis] | 0.0 |
aug_v2a.12032.t1 | gi|470309959|ref|XP_004364204.1| | deoxyuridine triphosphatase [Capsaspora owczarzaki ATCC 30864] | 0.0 |
aug_v2a.12032.t1 | gi|198419421|ref|XP_002130085.1| | PREDICTED: deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase-like isoform X1 [Ciona intestinalis] | 0.0 |
aug_v2a.12032.t1 | gi|302844211|ref|XP_002953646.1| | hypothetical protein VOLCADRAFT_109897 [Volvox carteri f. nagariensis] | 0.0 |
aug_v2a.12032.t1 | gi|514694508|ref|XP_004994825.1| | deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase [Salpingoeca rosetta] | 0.0 |
Transcript
Transcript ID | aug_v2a.12032.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.12032.t1 gcgccaagtttaagatactaagctttcatcctagtgaaatacaactttatttcacagcgagaatgggtcaattagtctcc accgccctcacatatctaaagccttttcttcatgaacggcaggaaaaagtattctttaaaaaactcagtgatagggcaac cacaccaagcagaggttcggatttggctgcaggatacgacctttctagcgccgaagacatgacgatacctaagcaaggca aagcattagtaaagacggacatcgctatttcgctgcccgaggggtgttacggacgtgttgcgccgaggtaagagcagaaa tttaacatttcgtgtttactagctggagaaaatttatccaaaagccccgatgcttgaagtgcacatgtatagtgctgtat tgtgcgcgggaatgtagcgatgcatgaattattcagcgtattaaatctagacacaatggcttgcaagtttgttgtagacg taaaaaattccataaaatttccatggaattggcgaataatagtctagatcattaactaattgctgttggcgggaagaaga gtgagttatgtattatatatatatatttatcatcgaaattgtactctctcgtgtaaaggcccatgcactagttgataaag tttgtggtatcttttattgttttagttttggcggtcacctcgcatgacagccttaggcttcgatttttgatctaacaagc atatacttaagagatttaccactttgcctttagtgaaaccatttttaacacgaggtggatggcatgaattgaattgtgtg ttaggtttcagtacgtttgtagtgagttttgatgtccaaaatggatttgtttctgaatctttctcctttgaacatcactg tgttgaggaaagtatatttgatcgataaatattaaatcatttacgttgtcagtcttttcttttgtatattttttccagac ataatggatttattttgtttcttgtccaccacattgtgaaagcacgtattatccaatgagaatgctcagaacaaactctt caaaaacaagatttgagcattgcctttgcgaaattcaaacaacacctgagaacacatggctatccgaaaacaatcataga aaggtctctttcaagggacaactttgcccctcacgcacgcacacataggaaaaggcgttaacaagaggatttttcctttt gtaactgaggattcatttgtcaagcattgtaaactccctctacacctgtggcaaattggctcccccatgaatgatcaccc aatccaaacccatgcttccacccacaccgtgagacagccccatcccatacagatagctacagccaaaagcaaaaagaaaa gtctgcagtcaaagcattgcacctgaaactgctggcaaaaatgcacatctcgaaacagtgggaatttttaatacaaaaga agttggttgcttggaagcctctgatgaaagccccaattaaattccatttttcaacttcttggggtcctcgtgctacggcg aattgtgattctgaggtaattctttaatgtgcgctcacattttgaaaattctacccctggaataaacaaagtggccacaa catcttttcctcagaatctctttaattctaagaaatatggctcaaaaaacaaaggaaactctcatagttttccctctgtc agacagattcctgatttaaaattgccaattctagtggcgtgacgtacatgacaggaggatgagtgtctttgatcttctag tgattcgcttgacattggctagtaataattaatttaaagtaattacacaattggtttaacacttttacttttcattggct agttattacttcatgaattctgcatccattcttggttagctgaaaatgataattattgcatgcgcttatgattgcctctg tatttgctttggttttgactttttgacagtcacttgaaaaccgctctatctctaagatttaaatattgtgattacagcga aacctctttttagcgggtacctgcaggaaagagctcaccagactgcttacttgaggttggctgtttaaaagaggtttcca aaatgtagtatgtaatatctatttaaaaatggaactaatatatgcatactttattgcctaacaacaacaatagcacaaaa tatgagaaaataatcaagttattgcaagttcatgaaagtttaccctaaaagttccaacgtttgtaaggcaatcatttttg ttgaaacctcattaataaggtacagttttgcctttcaacatggagtgaaaaaaaaaaaatcagttgttaatccaagcgaa actattcttatgttgattatatgtatatcacattgtgtttgatgagctgttaaaagaaagcggacatggttcgcgcatcg ttgtgtcaaaacattgctttttaattgactaggtgactgcttaatagatgcaaaatgcaataaaattatccatttgggaa ttctaaattaattgtgactgtttctgctcaatagagatgactgcttaatcaaggtcaaatttacagcaaatgaagggacc aatttttatttttatcctgacaactgcctgttgaatagagggtgacctcttaatggatggatgtctgcataatagagttt gactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttaatagatccagtctgtcttggaagtatcatattgatgttggtgcaggt gtggtggatcgtgattacaggggaaatgttggtgtggtgctttttaatttgtcaaatactgattatgaggttcatcaggg tgaccgtattgctcaacttattgttgaaagaataagtaccccagcccttgtggaagttgaggtgagaaataacacaactg tcagtaggccagattcaagaatccaaattttttcagggggggttgttagagtcaaaaaggatttttagtcaatttaagga cttttggacagtaatgtatagaaaaatacagccagttctagtattttgccagttaaaagtagtcgtcttgtttttagccc ttgcaatgtcacatgaaatgttaaggtctgttaactgtgtattatctttactgtttgcttgaatgaaaaaaatgtaagga gtttgaaccacttacattgtataaaaagtataagtaaatgatcattttgaatcttatagaaaaaaattaatttttggaga caacattaggatttagacattttttggagaatttcaggtagagctttaggccttttttttgaggatttttgtatcaaggc ctaagtgtatgttaaaaataaagacagtgcaacataactgttgcaactagaagcaacgtaacagacaaagttactactag actagctttttcttatttcttgtaccctctcttttgtaggagctggatgatacgacacgtgggacggctgggtatggatc aactggaaagtagaaattatattggttacttggctagagttcagagacatcatcaatttagttgttgttggtgttttttg tgcagtttattctaccatgcactgaattcacgtgtaataatctatttttgtccttgtataaaacattgttgcatatgttt tttatgccatttatatttccttatgtaatgaaaaatttctctctcaagtttcatgttttttcacaaggcttatattacaa taatattgttactattattgtttagctcctatggagatttcttggtaacaaaaatgacagatatttctgatcagttgcct tctgctgtttagaaagacgtctgtcatgcaaacctaagatttagttcattttttttttcttagtgcagtattggtaatgc acattccaaaggaagagttaaaaacaacaacccttaccttgtggactaccccacagactatactgtggaaaaccttaagg gctaccccattgctttaagggcaaaaaatacatgtacacatctccccgtaaaacagtcttcttgttacgatcaatttcag gcaccatcttggtaatcgccatttttggacttttcctttcttgctgactgggttttccttggtgcaatagcgtagttagt tttctttgttttcttagtgtttactgtggtctgtcttatcacttagcctttgtttgctctgctgaaggtactacctcctt taagggcttttgagcgaaggagacctcacagtcacacacaagttcttctatcaaggtgaatacacctgttaaacttttga tgaactttctcaactaacgcagcaagagtaataggaatgacggtaacaagatggtgccgaaaggtgatcgtgaatgcaag tatacagtatctccattccgaaaggaatggcaaagtttaacagtacattagaagtctatttataaaacgtaatggtcatt aagttttgttatattttttaaaaagaaaaacattttgttacaggtttgtagagaataaatcttcagttttgtt |
Protein
Protein ID | aug_v2a.12032.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.12032.t1 MGQLVSTALTYLKPFLHERQEKVFFKKLSDRATTPSRGSDLAAGYDLSSAEDMTIPKQGKALVKTDIAISLPEGCYGRVA PRSSLSWKYHIDVGAGVVDRDYRGNVGVVLFNLSNTDYEVHQGDRIAQLIVERISTPALVEVEELDDTTRGTAGYGSTGK * |