Genome browser

OIST Marine Genomics Unit since 2008

Gene
Gene Model IDaug_v2a.12137
Locus scaf4788 : 4056 ... 12650 : +
To GenomeBrowser scaf4788:4056..12650
Genes list of scaffold scaf4788

Manual annotation
Blast Hit to nr / sp
query Subject ID Subject Name evalue
aug_v2a.12137.t1 gi|585642098|ref|XP_006811130.1| PREDICTED: coiled-coil domain-containing protein 62-like [Saccoglossus kowalevskii] 4.0e-07

Transcript
Transcript IDaug_v2a.12137.t1
Definition-
>aug_v2a.12137.t1
gttactttttataggatcaatggagcgatttgctgcatctttgcctgtgaaaggctacagcggtgaattttctggaaaaa
agcgagttcagttgccttcggagcgcgaaaaaggtgcgagtgtttttnnnnntttaactttggttacttctacccgtgcc
ataaattgtgtttaatagcgcaatttaagaccttagctatggacagagatcactaagtatctttagccaagctcattaaa
tttactggtttcaagtggcttattctgtaagcttctagatttagaataagtgcagctgtttatattaatttgtttggatc
cagttccatttgtgaaacgagtgcaaacgatatttttcgaacacgtttctttgtgtttccacgttctgtttaattttaaa
caataaacatttaagattaagttctaattgaagatcaatttatacgaactgtaacagaacaaaatcgaagccgttctctt
tgttttaaatttattatggaaaacatttttttgagtggggtgcttggagtaatatactttggataaaatctattttgtct
aatggaaaacccataactatggacaaattcgattatgaggatactagaatttttcaacgtgcaattcatttgtgaaaaaa
aattgcagtttgtaagggtgttaagttgctattttcttgaaaaacaacttgaatgaacgcaaggaaattattgcggaatt
gatagtagttgaattatattttgaaagcaaattatggatggtggtttactgtgcaacctgtcagatgagattttgttagc
caatcaggatcctgttaactcagtatgcgtagttgtgaaatgtgagccttgctgcatggtttagttacattgattcatgt
gaatacagtagctgactgtctgttttctctttcaatttaggttatagttcatccagtaatttatatcacagtacacccaa
aactaaggtaaatctggataatttattttaagtgtaaaggggcagtccaaaataccatcatttttctcatgtcacctcat
gccaaaacttctgcactttgcggcccatttgcaccatttaaagcaacgttcagtttaagggtaaggcaagctgaagattt
acattgcttagcataattattgcaaaagtgatttgcaaaaagtgacccattcattgcatccggtcacttcacatgttcaa
aagttagatagcactagtaattcctttggatgaacactgggtgagatttatttgctggacagtagcttgtgtgctgcata
acatcattgcacctttgtattgggacggcaggctgtattttcattcactttatctggcacacnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnngcatttagtgtgtttatttgacaacatcatgtacattagcttgagtttattgattttcaactctactcta
ctgtcagagagtttttttccataggtaactcagttaccccatttcccgctaaactaactttaatcttagatcaaaatctt
aataaatattattgtgaatgttattattattgtaacagttatattatggttatatttcagcctgtagtttcaccttttgt
atcaacatcaccaagttataaatccagagctaataacacaagctatcaggcaggggtcagtccagtgagaaattcaagga
gtaaatctcccttgcacagtacaagccctgtgcgtcaggctgttagtccaagacttcataacagctcgctatcgcccact
agtaaacaggtttgtaaatgtatgtacctcgtaaaagttgtttcattgttgttttttcaaatgattgaacaggtattttt
caccaaagttttacggtgagtactcttgttagagctgtgatttaacaatgatttctcagagaaacttggaaagaaaatac
aaatacttttaaccaggaatcagggctcaaagtttatttttggtgcgcggtagactccatcgccgagaaacacgtgttcg
aaaaaccgaaaagggtcggggagaaaaaaggaactgggagggaccacagggtaaagcgacaacgctgattcaatgaaaat
gatgttataactattgtttggagcctgattgtgtcatacagtacctacaattgaatttattatatgaagcttctgtttct
tgtataactagttgaaatacataaggatattcatgtgagaaagcagagttgagtgacgacaagcttagtcgcactaaatt
ccggccggatttttagtcgcacaataaaatgtgcgaccagcgggtcgttaactttgagtcctgggagtctggagccgatg
gaattctgatttaccattgaactagaggggaatcaattgggagaaagtcattaaactgtcataggttcatgtgattcatt
cttttaaggactaaaattgttgaatctaatttaaacacttggaagaatgtttcagatttcaactattccagtccaagcag
tatggttggacagcaataactattattattgtaaatatataaacccaggttaatgaccccacaagtctccctatagcggt
ggtgcaattggaaagttgtctcctatttccgatcattgagacttttttttctgagtttccctgagaaaaaattgaggaat
tgcatctctacatgaattcctatgagtgtcaaagcttaacatcatctcaaataaattacaaaaccatcagagttattatt
aagcaactgaataatatagataccacatttgatgttactgaactctcacctgtgggcttgtaatgtgctgaaattgatcg
aatcattatattaaattataagtgcagtattttattgtttccaaatagcttgcggatgttgacagtgacaccattcaaag
acaaagacgtgaattgcagttacttataggggaactgaaagacagagataggtaaatgtgtatgtattgtgtagtttaaa
ataaagagaatgtctcctccatgttaaagcaaacacagtctaaacatttccttcaagttcatgttattgtaaacatttga
tttgcaatgcatttttttgatgactcactatcaggatttgaaaactgtctttcttgactctnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaatttgcataaaaatgaagatgtcgaaacgagttt
tggttcgagtctccaattgcttattggttgagttaatcagaatgtcacttataggttcgtctcatagttactggaacgat
ctgattttttcggactttcccctgagtatttgagcatccgaactccgtaatcggatgttcaaagattccgactccggttt
cgggtcactgttttatttccgactattctcgagtaccctttcagccagtggtagagcatccgaacttgtaatcgtaagtt
cagagattccgactactagtgaggaacactcggatttttgcaaagtttgctgagacaactccgaactatgagatctctac
gaataaggcagttgataacctatttttcaatattctcaggcttaaagcttcagaaacagaggaaaaaaacaaagtaaaag
aacttgaaaatacacaggtttgacacgaactttgtcacgggatccgatcgtttgtcgtaaaagcaattatttgatttttg
atggagcgataataaagtctttgctttcacttgtagttacaacttcagcaagtctccgagcatgctaacacttcatttca
tcaagtgcaagaacttgaagtaagacaactgtaataaaaagctaaaatacatcttcagcctcgacgaaagacttgaaatg
gtaaaaagacaattcagggttgaaagacaacgcgggaacgtgaaattttctcattattttgatgtttttacgcgaactta
tatttttaattaaagtgagctttgactgcaaaggtttggcttccttgtacgcgaagacaagaaaatctaaagacactgtt
aagctggaaaaattatctcttgcaacttctgtctcaatttccctgctgtagaaggtcttaatgttgcgagaaaagttgct
tactttgaaactgagtcgttcattccatgatcacatgacaccacaggaacattttaattggttgacgccgtaaaatcgtt
ttgtcacgagctggaatctgttgttagaagtctggcagaaagacgtacaactttctacaacagtttcagcaatttcccgc
tacgttttccgccgttttaaggctaacgtgtgttgcattttggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagcatgac
acataaagccgaaacacggcgtggaggtcgacatggcaatctggtgagtaccctcactttgacacagtgtaaccccccgt
ttgaaaaatcctggctacgcccctggttggatggaaagcactctccggctccaatgcattaatgccgcttctctgaagaa
agttaaaaacaactgaaccgaaagttttaatttttgtagttagggtttcatttcctaaagaaaacaacactttcttactt
tagttacgtttatatctttttcaggaacttaggaaaacagaaagtacactgagggcagaaagagaccagtggagagatca
ggcgacgggaaataaacatgaagtggaaaaactgagaggtacaaacttttttttcaggtagtgaggcaaaacgccgttta
tcgaaaagattgcgtgtgatgatttcgttggttgcacatcagatttgaattagtaaatcaaaatacggcaggtggaaagc
gcgggaaaacgcgcgcgaacaagccacaactttgtttttctcgtaattctaattggctggataatttcatgtagattacc
atgcagattattgcagaatcaatgctcggattgctttttactctgtggatgtcgttttcccttccaggtgatatcagtaa
acaattcagtgatgcagacgaggctcacgctgaacttggaaaggtaaaatgacctgcaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnntcagaagtactaaaaacttactaaaaacataactcttgtctttgatatttacagacaaagcaggaggtgttg
gttttacagaaggagatctttttgtcaggtcattgtcagtgtaaattaatttaatcttggtttctagtatttagtgtgcc
ctggttgggtattggagaccatggacttccgacttttctgcgcaatctcagaaatctaaatctttttgcgtgtaaaattc
ttctttactattctgaaaatcaaatcaattcgaatcaaaccagaaaaagtgctgtacccaaagaaaactccctctgggaa
gcgacggtggagaagcaaccaattcatcccacataattgcggcaggagacgggatttagttgtttatttgtaaatttatc
aggcgagagagaaaaaagaaaagaccagctactgg

Protein
Protein IDaug_v2a.12137.t1
Definition-
>aug_v2a.12137.t1
MERFAASLPVKGYSGEFSGKKRVQLPSEREKGYSSSSNLYHSTPKTKPVVSPFVSTSPSYKSRANNTSYQAGVSPVRNSR
SKSPLHSTSPVRQAVSPRLHNSSLSPTSKQLADVDSDTIQRQRRELQLLIGELKDRDRLKASETEEKNKVKELENTQLQL
QQVSEHANTSFHQVQELEENRKYTEGRKRPVERSGDGK*

  • MGU Home
  • Genome Projects
  • Information
  • Genome Browser
  • Blast Search
  • Keyword Search
  • Downloads

Gene ID:



Keyword:



  • Login

copyright © Marine Genomics Unit 2015
Okinawa Institute of Science and Technology
1919-1 Tancha, Onna-son, Kunigami-gun, Okinawa, Japan 904-0495