Gene
Gene Model ID | aug_v2a.12962 |
---|---|
Locus | scaf5212 : 145 ... 6312 : + |
To GenomeBrowser | scaf5212:145..6312 |
Genes list of scaffold | scaf5212 |
Manual annotation
Study field | IP3 pathway |
---|---|
Gene name | Adi-p90-RPS6KA3 |
Description | Named thus because this protein shows similarity with Homo sapiens ribosomal protein S6 kinase alpha-3 by the BLASTP search. |
mRNA evidence |
Annotation by Blast2GO
Annotation | GO |
---|---|
ribosomal protein s6 kinase alpha-2- partial | GO:0000166 GO:0002755 GO:0004711 GO:0004712 GO:0005515 GO:0005654 GO:0005829 GO:0006468 GO:0007268 GO:0007411 GO:0030307 GO:0034134 GO:0034138 GO:0034142 GO:0034146 GO:0034162 GO:0034166 GO:0035666 GO:0038123 GO:0038124 GO:0043027 GO:0043154 GO:0043555 GO:0043620 GO:0045597 GO:0045944 GO:0046872 GO:0048011 GO:0051403 GO:2000491 |
Blast Hit to nr / sp
query | Subject ID | Subject Name | evalue |
---|---|---|---|
aug_v2a.12962.t1 | gi|701323362|ref|XP_009990726.1| | PREDICTED: ribosomal protein S6 kinase alpha-3-like, partial [Tauraco erythrolophus] | 2.0e-35 |
aug_v2a.12962.t1 | gi|723123941|ref|XP_010294202.1| | PREDICTED: ribosomal protein S6 kinase alpha-2-like, partial [Phaethon lepturus] | 2.0e-35 |
aug_v2a.12962.t1 | gi|701331224|ref|XP_009978099.1| | PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: ribosomal protein S6 kinase 2 alpha-like [Tauraco erythrolophus] | 5.0e-35 |
aug_v2a.12962.t1 | gi|700423209|ref|XP_009949950.1| | PREDICTED: ribosomal protein S6 kinase alpha-2-like, partial [Leptosomus discolor] | 6.0e-35 |
aug_v2a.12962.t1 | gi|118150568|ref|NP_001071243.1| | ribosomal protein S6 kinase a, polypeptide 1 [Danio rerio] | 1.0e-34 |
Transcript
Transcript ID | aug_v2a.12962.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.12962.t1 attcacctgccattcctccaagtgcaacctgccatcaactcttcaggggatttagttttgtggacccaatacttgttgag gtaggtgaacgtacaatcagattggtgatcagtgaaaatggaaaattgtcacattcattttgttcaaactctcataattc tctaatcctctagctaggtgagaaaaaaattaattattagaatttgcaaatgaaatcattcctcatagtaaactacaggt gacgatattatcctcataagaggtgggagttcttaatatttctcattgtcataaacttggcaacgttgtttgttgacatg tgaaatgtaagttaaggtgggaatttcgtgccaaaataaaatactcattaatatttttcatgcgtgctaacataaataat atcgatttttggggagtttaaccacaaattgttgaaataaaatgtacctagtgtcacagagcattaaaatgatagtttat cttgttaagaaaagaatgtgaacttggcataaattaaattttgttttagaacaaaatgaggtgttgaacacctgctatag aaaagatatttaaatggtttcctgtagctttttttcctccaaggtgtaaaatgctttacatcattaattttgaatttctt gatccaagactcttagtctaagtgtaagactcttagtctaagtgaacattcagactttatctgagactttttcaccatga aaatctagttgttggtttatctgtcataaaggatccaagattatcttagtcaacaatcatcatgttctgaaacagagaat tctttcctttctgagggaaaaatatttgagaaggtcacatccaacaggttatcaccaggtgtaattctctaatttcttct ctgaagccagtcataagttttcttgcaccctgagctcacaagtattcaaatttgaagtactgtatttctgagagtttgtt gttgccttaagttcaggtacagagctgggtgaaagtattaattttatttaaacttgtaaattgcttttcattttcacagg aggaaatggcacaattgaattccaacggatcagaaaaaatggagatagatcacaaagtaagaattacgtaatgtaggaaa ctcttgctatccataacttcctaaccataagtgtgacattgaattgaatgactgttaatttttttcccctgtaaaagctg aaggtaaaacaatgcttgtacctggttattaaaattacttaccaaaaagatggtcaaaatctttctgttgtgttcacacc ttcgccttaagaatggaaggtacagtgatgcgttgtaatgttggtgaggaagcgaagcaaaagagttgaatgactatggc aacaagatttgtctcttttgaaaatattactttggtcttagctttgtagtaaggcgtggataattttaatccataccaac ttgtttgacaccaaatttttgtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnngacagtccttgctggctgcgtccggattaagaattttgagaccactccctaagtgttatgagacataaagt tatataacaaatgtattatttgctattagacaaacaccatttgcggttggtccagaagattcatcatctgtcattttgtc aagaattggagaaggaaagtattccctggtcggaggagcctgggacagcatatcagacgttgccaaggtaactattcctt tagagcttcactcccctggttgattattttgggatcttttgcagtgtttctcttttgttttgaggggttttttttcctaa tggtctcggcactggatttcttttctcaggacttggtgagacaaatgcttcatgtaaacccaagactccgtctcacagcg aagcaggtaacaggatttcatttccgtcaatcaatgttaattaaggttattacagttgagcccgcagacaaaatttcttt tgtttacaactgcatgtaaacgaggcttaggggtcagtacaatgggaaatgacccattagtctcgtttgtgtgtcaagac cgctggtaactgtaataacagctattcttgttgggcatgatcagcaaatggaagggtaaccatctgagaatgcctagaga gatcaggctggtgaatgggtcaaccccatgggctgagtgtcattcgatgtcaagtgggaacctagatttcctcgctcgtg aaaatcatgtcccgccttgtccggaagtgttcaaataaagtaaacaacaaaacagctacttgtagtcttgttttgtttgt tattgtggtgttccgatggctgaatattgactgtcctgtgcttgtgaactttttagattcttcaacatccctgggtagtg agtcgttaccaacttcctcagcacagactccatcaagtcagtagcgtgtcaagaatcaaggaagccgtcaaggccacatt ctctgctctctcctcccctgagagcaaaagactcaaaccagtccatgcttcacttctagcgcagaggaggacaacgaaga attcaaagacagccaaggcgtaaaagctagtattttcctatcctttgtatctgaatgtttatattttagatcgtgattgt tctggtaaaatcgttcgttagtgtgctagagtagcttaggcacggaggacaaaccgtcgtagattgtatttgttgtcgtt gccaacgcaacgctgtcaatgtgaagtgtctgtcaaagttagcggacagaaaggcgactcattcaaacgaatattcattc cattcgcacaagaactaaagcgagccctctatttcgtgtttttgcccaatcttcgagcggtcaggatgtagaagataaaa atcccaaacccttgccattcgtgggagtttgcttgaggttacacacttttgtaaaataaaatctctataattggatattc cttaggcgcaaacgcgtgtttggaaaacaaaaacaatagtgacaacaacaaaaaaagcatcggtgtattcaagcttaaaa ttcgggttcccgttgacaccaagagaaccactttttgtagctcatgtacatagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccctaaatagacgcatgccacaaagttagttct tttctagttgtttacccgttgtagctgtcaaagcttgaactcaacattcttctatttttgctcgaaacgtttggacgtgg ttagaggtgttataaagcgatgtcgtctgcaagtggttgaaattgttataaatagttttgtttcttttactgagggttac tgctagaaatgatatcagattttcaagctagtacactttttcacaaccgaaataccagttggtcgccaatttttgccggt ctaattgatttgaatatccactcaaatgtcacttggtttggtatcgaggtttaatatcactgtgggatttctgtgggtgg attgagcatcactgccaacgaattaattataaatttgttgtctcacaaagcagatgtgaactgatgtaaataataaagct tctttcct |
Protein
Protein ID | aug_v2a.12962.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.12962.t1 SPAIPPSATCHQLFRGFSFVDPILVEEEMAQLNSNGSEKMEIDHKVRITQTPFAVGPEDSSSVILSRIGEGKYSLVGGAW DSISDVAKDLVRQMLHVNPRLRLTAKQILQHPWVVSRYQLPQHRLHQVSSVSRIKEAVKATFSALSSPESKRLKPVHASL LAQRRTTKNSKTAKA* |