Gene
| Gene Model ID | aug_v2a.15062 |
|---|---|
| Locus | scaf6350 : 897 ... 11231 : + |
| To GenomeBrowser | scaf6350:897..11231 |
| Genes list of scaffold | scaf6350 |
Manual annotation
Annotation by Blast2GO
| Annotation | GO |
|---|---|
| receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta- partial | GO:0004725 GO:0035335 |
Blast Hit to nr / sp
| query | Subject ID | Subject Name | evalue |
|---|---|---|---|
| aug_v2a.15062.t1 | gi|705677323|ref|XP_010117327.1| | PREDICTED: receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta-like, partial [Chlamydotis macqueenii] | 0.0 |
| aug_v2a.15062.t1 | gi|704281106|ref|XP_010156679.1| | PREDICTED: receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta-like, partial [Eurypyga helias] | 0.0 |
| aug_v2a.15062.t1 | gi|701298069|ref|XP_010009353.1| | PREDICTED: receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta-like, partial [Nestor notabilis] | 0.0 |
Transcript
| Transcript ID | aug_v2a.15062.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>aug_v2a.15062.t1 aacggcaacctgttcctatcgacgactttgagagacatgttagtcgaatgcatatggatggcgaccatggattctcggaa gagtattcggtaagatcaggaggacaacatgctcagacgacaggggcgaaaagaagatcatttgtcgttttggctattgt attttgatgtcaccacgctgctacatttatttccaaatcagttaactcttagacgctgataagtagccttgaggcagaaa catatcattgtgaggatatgaatgttgatgttttcgttaatattgtcctccaggttttgtgctgggttactaactcgttt tttttttcttgtccacagcttgttcaacctgatgaggaattttcctttcaacaattcttgaaccctgcaaacaagtataa aaacagatatgccaacatcgtggcatgtaagtagacttcgcgaactcaaagtacgaaaagctaaatagcagaaaaacaaa acagagtttagggctattctcctagccaaattactcccgaaatcattaatttaaccttttgaaccaacaggatcattttg ttgcattgcgaatattttcgttggcgttgccattggccttataaagcgcttttcaaacgactttcgaaacaccaatacca aagtaattacttgaccaatcgcatcaggagcaagcagcacgatgaaccaatagaattcctagcaattacctattacttgc tcaaagcgcggggtaaaaatcgtgtgtacaaggtgcgccggattggttttgcttaccactgtttgaaacacttgcgcgag gttaggccaatcgctgaacctagcaatcattcgaaaactgctcaatagagctctttagcttgtacattttgttttcccat ttcagaccacgtgatgccctcatgggaatttgccttttgttttttcattagtaatgcatacatttgcacgtgcataagac 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|
Protein
| Protein ID | aug_v2a.15062.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>aug_v2a.15062.t1 MHMDGDHGFSEEYSFPDDDRLIKQFHFTAWPDHGVPSHPTPLLSLVRHSYNANRQSVGPMVVHCSAGVGRTGTFITLDVM LQRISQEDSIDVFGFVRQMRYQRNFMVQTEAQYVFIHDAVLEAITCGVTEVEAKDLSFRIRELRQFDPETGYTYMENEFS RLAKEENHPIAFKSATLNCNAAKNRYANILPFESTRVHLKMRPGEMGSDYINANFIDGYCQPRAYIATQAPIPDTFEDFW RTVRFLLHDASRILGFFRFIRQFSITNFQ* |
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