Gene
Gene Model ID | aug_v2a.16488 |
---|---|
Locus | scaf7750 : 1668 ... 7885 : - |
To GenomeBrowser | scaf7750:1668..7885 |
Genes list of scaffold | scaf7750 |
Manual annotation
Study field | Photoreceptors / Circadian |
---|---|
Gene name | Adi-Cry4 |
Annotation by Blast2GO
Annotation | GO |
---|---|
cryptochrome 3 | GO:0050896 |
Blast Hit to nr / sp
query | Subject ID | Subject Name | evalue |
---|---|---|---|
aug_v2a.16488.t1 | gi|742142383|ref|XP_010879200.1| | PREDICTED: cryptochrome-1-like [Esox lucius] | 0.0 |
aug_v2a.16488.t1 | gi|657596853|ref|XP_008303150.1| | PREDICTED: cryptochrome-2-like [Stegastes partitus] | 0.0 |
aug_v2a.16488.t1 | gi|658856297|ref|XP_008410797.1| | PREDICTED: cryptochrome-2-like [Poecilia reticulata] | 0.0 |
Transcript
Transcript ID | aug_v2a.16488.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.16488.t1 tcggtgtcgtccgttgatttcccttgtttacaacttaagttttttacttacttgttgtaaaaagagggtttttcggcggc tattttctttaaaaccgtgagatctactggtaagtaaatatagtggaattattagtgaaagtaacagagtgttttaagga attattttaatgaaaacaacagcgcacgtctattattaattatttggggcgccacaagacgccaacagcggcaagatttt tagaaaatacttttatcaaagatctgtttgtaaagggaatcaacttcggtcattgattgaagatttagaatgttggaaga aacttctgtccttattaaataaccaagatcacgtagttaatgcttttgacgtgctcctgtcttgtgggtttgctcatagc tactaattttggtttgcttagaatccatacaaggagttggggttatgaaatgtaaccctggtcacagtacaaagtgtaaa tttacttgaaattccaaaaattttacattataaaacatttgatggcaaccatattgacctctgatctcaaaatttgtttg gtgtttatcgatgaatgctcgaatgcacgttcttgcgttttgcataaaagcgttcgtattttatgggtacaattgaatag tcttgcttggaaacattcacaaatttactacttaaattgaaacaagtaacatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn gttagctgaaattcttgtaatgaaattcaacaagcaaggagtgcttgagagttatataagaattaaatatcatggactta aggctgttgagatccttatataatgaggcaaattgtttttagtcacaagcactgcatgcttcctagtcagttagtcaggt aatttgctgatgacaagtctcatgcaaatgtggacctatgtttgttcagtaattctgttgtcatctcgcttacagtggta aaaacagcacagtcttgcctggtaacttgtaagaattgttttgtttgtggatcacaaatactaagactcgctgttaatta aggagggtaattcatagttaatcagaaaggaaattgatgcatgaaattgttgtgttagggactttggccgctctaggaaa agaactgtttgttcaatatcttgccaatggtcgttgtgagcaatgataatcattttgatctaataagaatactagtggca ttctggacataataaccaatgtcgttctacacatcttgcacagaaataataattcatgtccatttagtcaggcagaaacg agacagaaatccccctagtcacagctgagttaagaccaaagtacatctttgatttgaatggcaaaggtggtcttaatcat ctgtttctgttgtccaaggttgaatgtagtttgttgtttgtcttagtatcattccaagatcttcaaagtttcccaaagac cacatagaaattcacattgaaatgtgaaattactgtacatgtggatttggagtagtgggctaagattaatgtcaacttct tgtagacccaccgagtgcttctccaccaaccggcctgtattatcggtgatgaatttattaattttaacaactattatctt tcaattgcaaagtacttttaaaaatactgagtttcgcaaaatgttttttgttcacagaattataatggaggataagaaac caagaacatcccttcactggtttcgtaaaaatctgcgtcttcatgacaacccagccttgtgtgaggccattaaggaaagt gatgattttttggctctttatattcttccaccctctgtccccgatggaaacatagcagcgaaccgatggaattttctgat tgaatgcctggaggatttgaaccgtagtctggcaagcgttggttctcgtctgcttgttgtccaaggatacccagcccagg tgattccaaagttgctaaaacgtctgcatgtcaccaagttgacatttgaaagtgaaagtgagccattcagtaaacaacgg gatgctgtgatcacccatcttgctgagagcatgggagttgaggtggtttcttgtacttcacacactttgtatgatgtggg caaagtcctggaggcaaacaacaatgtaacaccaatgctatttgacagcttccttgatgttgtagctaccttgggtccac cagaacctcctacacaaacagttagccaggatatgatgtcttcgcttttgcacaaagcaaacatgtttggggactgtgac ataccagctgtagaggatcttggcattgacagggccaaggttacatgtcaagaaatttggtgtgggggtgaatctgaggc cttacaaaaactccatgccttccttaaagaggtacaccacatattaagtgaagttttacagaggttttagtgttttttct ttctgccggcaaaaacgtcttgcttgcatgatagatgcatgccaaccatgaaccaagggtgcaatgtatttgacacaaca gataaggataacagatctctctgtcaatatgtcgcctgggatgttttttgaattatttataaacgatttgtgaagaagtt gaatttatagacttatgtcttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttctggaacctag ataatctaaaactactgtaataaccaatcttataaaagaacctatttagtctaacttagaaaatctaggttcttatatgt gggtgtttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctcatcaacgcccccccctccctttgattttaactttattgcaggcaa aaaagcagtatcccccgcagtcactgttcttctcattgttgtggagggatttctattttgtacttggtagcagtaatcca actctaaaccaaatggaaaataatccattgtgcttgcaaatcaactgggaccagaatgtcgttgctttggaaaaatggaa aatggtaggtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnngcctgatgatacttctgtcgtgccataaggtccataattgaatactcataccagttgtttcacagttgtg tcccctgttacctgtctgatgagatcgagcgcattcagcgatgtgccatgtgcatcatttttccagatgtgaagtgtagt agtgctctgagagaagcagggattcaaacggtttatgataggagagagaaactgttatgtgatcttttcaaaggcatgat gtataataaggaacaataagctggcaagtctgctaccacccaagaatatcaataattattgcagacatttaaaatcagta agaactttaaacactcctgtgtgtaaaacagattggtttaagaaatctttcatgattagccatagtcttaaaatgtagac cataaaattattcttcagatatttcattttaaatctaagttatatatttaattcttaatagttttttgtatttaatagaa ttgtagttattatatttattgtgatgtattatagtgttttatatattatcgtgtaattcagtcttgggagtgagaggata ttttatctaatgaatattttatcgatcttgtcataatcatcattagaggaaaacaagtcatcattatataacagtatcgg tggtaaatgtgaatctgaaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncagtattaatatagcaagaacacaaaatgttagcttatt ggagaaggcatggtcagggcttaatgtccctgtagcttgaaatctatctttctagttcaaaaatggtcgtttttacttct acaggttgcattgtttgctgattgtggatatgaacaagaagttaacattttgatttctcttaatagatctttggggagtt gcagctggatgccgagtggagcctcagtgcaggcagttggttgtcgatttctggaagttcttttgatcaaaaccgactgg ctcttttttgtcctgtagagactgccaagaagttggatccaatgggagagtacatcag |
Protein
Protein ID | aug_v2a.16488.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.16488.t1 MEDKKPRTSLHWFRKNLRLHDNPALCEAIKESDDFLALYILPPSVPDGNIAANRWNFLIECLEDLNRSLASVGSRLLVVQ GYPAQVIPKLLKRLHVTKLTFESESEPFSKQRDAVITHLAESMGVEVVSCTSHTLYDVGKVLEANNNVTPMLFDSFLDVV ATLGPPEPPTQTVSQDMMSSLLHKANMFGDCDIPAVEDLGIDRAKVTCQEIWCGGESEALQKLHAFLKEAKKQYPPQSLF FSLLWRDFYFVLGSSNPTLNQMENNPLCLQINWDQNVVALEKWKMIFGELQLDAEWSLSAGSWLSISGSSFDQNRLALFC PVETAKKLDPMGEYI |