Gene
| Gene Model ID | aug_v2a.16814 |
|---|---|
| Locus | scaf8058 : 900 ... 4835 : - |
| To GenomeBrowser | scaf8058:900..4835 |
| Genes list of scaffold | scaf8058 |
Manual annotation
| Study field | Transcription Factor |
|---|---|
| Gene name | Adi-peridot |
| Description | Named thus based on BLAST results and molecular phylogenetic analyses (NJ and ML). Peridot is a novel orthologous family, which is obtained from Cephalochordata and Hemichordata in addition to Cnidaria. |
| mRNA evidence |
Annotation by Blast2GO
| Annotation | GO |
|---|---|
| transcription factor 15-like | GO:0005634 GO:0006351 GO:0007519 GO:0009653 GO:0030154 GO:0030324 GO:0046983 GO:0050794 |
Blast Hit to nr / sp
| query | Subject ID | Subject Name | evalue |
|---|---|---|---|
| aug_v2a.16814.t1 | gi|260823593|ref|XP_002606165.1| | hypothetical protein BRAFLDRAFT_126491 [Branchiostoma floridae] | 1.0e-12 |
| aug_v2a.16814.t1 | gi|573897284|ref|XP_006636379.1| | PREDICTED: transcription factor 15-like [Lepisosteus oculatus] | 4.0e-11 |
Transcript
| Transcript ID | aug_v2a.16814.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>aug_v2a.16814.t1 gctgttcatttatcccatttgccgtaacagtcacatagtcgtattgactgacccaaatgcattggtcattgcctgttgta ttgttattcgtctgcttaccagcggcgatgacagaggtgtcactttacacaagatgctctattacttaaggcgttttaaa cccaccgatgcttctgcagacttcagacacgcttggtcgtagagtgcaacttaagcgccgtcagatgtcggcaggaaatt taaagaaccattcctgctcttggtcaggcgaggaggatgtggctagcactgattctccttgttctgatcaaatgcaaaat tctccaagtacttcccaatcttcgactcaatgtgaaggacatttggacaacacgtgtaacccaaagactcagcatggtag gcgtaaaatgaaaaggcgaagaaagcgtatgctaacaggagttagtcgacaacgtcgggcagctaatgaacgagagcgac gaaggatacaaggcgtgaaccgtgcgtttgtggaattgaaaaatgccctgcccttgggaaagagcgtggatatatctaaa atagatatcctgagagttgcaactacgtggattgaccacttaagtaaactgttagaccaggataaaaagttctgtctcgc gaaactcccggaatgtccacttacagatgagccacagctttatgaaattctgggtgaagagttttcagtgatcgatcacg aattacaggatgacagttttcttctagggcaaggtaggtcatttcatataaatatcagtgttatttaagttctttgttct taactaaggaaggggtataaattctatatatatctccactctcctgtttgcagctagctaagcaaaaaccctcccaagtt cccgaaaggtgcttattgtttagaaagttttcaaggaaggctgtcctgttccgaaagcgacacttggataaagccataca tgtttttaacagagagggacggaaattaatgaacttgattttagtagagtttatttttcgattacaagataatctttcaa ttccgcgctattgacctccaaccacaaaagtgagcaaaatactaagatatctattgcatttttttatttcacgcaaacta gattttcaaaatttgggtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnatgtttagcgcagattttgttttacacggaaaggtcgcaacattgcattttgagtcactctatggtgattttc aaccagttttagtcatacagcgaagatgtgttcgtgtttccgtgtgtgcggcacaagactaacagtatcgattataacat tgcggtgctgtgttttggcaaaccgtttaaagctaattaacgttggttatcgaagtccttgaactttacaccaaataatc tctctacttagctttaattaatgatgttttagtctgtgtgtttaaacagattaacctacgcgacgctgccattcaaattt tatctaaggcctcggaaattcaatgacctttctgataatagccttagttatcacaaaaaaagctttaccctgaatctatc ccctatattcattttttttctcgtttgtttaaggctcggaatcctccgtttgctttcaaaattagttttaaattttagga gaaagttttctttttccctctaggtaccattggaagaccatgattacttctttatagggagctaacgggaggcgtgatta aagcgcattatttgtc |
|
Protein
| Protein ID | aug_v2a.16814.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>aug_v2a.16814.t1 MLLQTSDTLGRRVQLKRRQMSAGNLKNHSCSWSGEEDVASTDSPCSDQMQNSPSTSQSSTQCEGHLDNTCNPKTQHGRRK MKRRRKRMLTGVSRQRRAANERERRRIQGVNRAFVELKNALPLGKSVDISKIDILRVATTWIDHLSKLLDQDKKFCLAKL PECPLTDEPQLYEILGEEFSVIDHELQDDSFLLGQGTIGRP* |
|