Gene
Gene Model ID | aug_v2a.16938 |
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Locus | scaf8180 : 860 ... 8975 : - |
To GenomeBrowser | scaf8180:860..8975 |
Genes list of scaffold | scaf8180 |
Manual annotation
Study field | Flagellum |
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Gene name | Adi-DHC-f53 |
Description | Named thus because a bi-directional best hit result was obtained by BLASTP searches. See chlamydomonas DHC-alpha (AAA57316) and DHC-gamma (AAA50455). This is probably a fragmented gene model. This gene model has a AAA9 domain. |
mRNA evidence |
Annotation by Blast2GO
Annotation | GO |
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dynein heavy chain axonemal- partial | GO:0003341 GO:0003777 GO:0005524 GO:0005858 GO:0008152 GO:0016887 |
Blast Hit to nr / sp
query | Subject ID | Subject Name | evalue |
---|---|---|---|
aug_v2a.16938.t1 | gi|156388807|ref|XP_001634684.1| | predicted protein [Nematostella vectensis] | 0.0 |
aug_v2a.16938.t1 | gi|395518199|ref|XP_003763252.1| | 0.0 | |
aug_v2a.16938.t1 | gi|688577803|ref|XP_009304459.1| | PREDICTED: dynein heavy chain 1, axonemal, partial [Danio rerio] | 0.0 |
aug_v2a.16938.t1 | gi|742148933|ref|XP_010880135.1| | PREDICTED: dynein heavy chain 1, axonemal [Esox lucius] | 0.0 |
Transcript
Transcript ID | aug_v2a.16938.t1 |
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Definition | - |
>aug_v2a.16938.t1 tcgtaagggagacaaagaaatggctgccattcaagacttggtcctcatgcacttctgtcccaagaggcgttgcgaaccac aaaggaagctgaagctcttgatgcctgtattcttatgttaaaggtaagaaaaaatgattgaatatatgtaatacagatgt gcccaagcgcactctttcatctgaattagtccatcggcaagaaatatatgaactcttttgaactgatgtacttatcagat aattcgatgcgtatgagccaaaaatccgttcttatgtctgggacttgtattactaacggtaacactgaaatggaacaatt atgtctggtatgaaatttgaattcttacgacgttattaacggtatcctgtgtgtggtcttcttcagctctaaaacctgaa attagtctttcctgatatacgaattagtctttcctgaaatctgtgcgcttatgtgtcggacttgtattactaacgaaaca ctgaaatgggtcaatgatgtcttacgacatcattaattgtatcctgatgttcgatcttcttcaactctaaacctgaaatt ggtctttcttcaatgatgtgtctacagaaggcttttttctgcataatcagattttgcacttaataatacttcattatctt tgaatctatcccatcatggcagcctactaggcgaaaagattaatgtaatatctgctttcaagtttcatatgtaaataatt cgtagtagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn 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gagactcgtagtcagtacattcctgttgccgtcagaacacagattctgttcttttgtacttacgatctggtatgtagact attaacgtttgactgaggcagtggctcctctggtcgcgattaactttctcacccgtttaggcgaggtcacttttcgaacc tctcgtgaaagaggaaacttctcgttttggtttcaaatctattaatattcgttaagaggatttaatagtaatggaagagg tatttctaacctttaaattgatcgttcaactttgaaggggactaaacattcgagacattttttgtgacattttttgtgac tgtgaaaaaggatggtgttcctttctttcaggcaaacatagaccccatgtaccagtactctctggaatggttcattggta ttttcttaaacagcatcgccaatgcagaagcttcag |
Protein
Protein ID | aug_v2a.16938.t1 |
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Definition | - |
>aug_v2a.16938.t1 MVEEWLTELRGLEIPHSDNCNLVATLGDPVKIRNWQIAGLPRDTLSVENGVIVQFTQRWPLFIDPQGQANKWIKSLEKDA GLDVIKLSDRDFLRSLENAVRFGKPCLLENVGEELDPALEPILLKQAKVVVAEQTEKDIDETRSQYIPVAVRTQILFFCT YDLANIDPMYQYSLEWFIGIFLNSIANAEAS |