Gene
Gene Model ID | aug_v2a.16978 |
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Locus | scaf8244 : 17052 ... 22215 : - |
To GenomeBrowser | scaf8244:17052..22215 |
Genes list of scaffold | scaf8244 |
Manual annotation
Study field | Flagellum |
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Gene name | Adi-PF16-2 |
Description | Named thus because a bi-directional best hit result was obtained by BLASTP searches. This is an armadillo repeat protein. Another name is Spag6. See chlamydomonas PF16 (AAC49169). This protein is a component of radial spoke and/or central pair. |
mRNA evidence |
Annotation by Blast2GO
Annotation | GO |
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sperm-associated antigen 6 isoform x4 | GO:0043229 |
Blast Hit to nr / sp
query | Subject ID | Subject Name | evalue |
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aug_v2a.16978.t1 | gi|533144801|ref|XP_005386917.1| | PREDICTED: sperm-associated antigen 6-like isoform X2 [Chinchilla lanigera] | 1.0e-29 |
aug_v2a.16978.t1 | gi|533144799|ref|XP_005386916.1| | PREDICTED: sperm-associated antigen 6-like isoform X1 [Chinchilla lanigera] | 1.0e-29 |
aug_v2a.16978.t1 | gi|507691218|ref|XP_004641951.1| | 1.0e-29 | |
aug_v2a.16978.t1 | gi|533144803|ref|XP_005386918.1| | PREDICTED: sperm-associated antigen 6-like isoform X3 [Chinchilla lanigera] | 1.0e-29 |
aug_v2a.16978.t1 | gi|625234891|ref|XP_007608611.1| | PREDICTED: sperm-associated antigen 6 isoform X5 [Cricetulus griseus] | 2.0e-29 |
Transcript
Transcript ID | aug_v2a.16978.t1 |
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Definition | - |
>aug_v2a.16978.t1 atttttttaaattttagttggctcaaactgtggtggatgcaggggcaattgcccatcttgcgcagatgattcttaatcct gatttcaaattgaaggtattcatttaaccctcattgactattctactgtatttagtttgtttgccttggtcgaaattcag taaggacattgtattgtacatttaccttttcatcttaacaattcccgagtgcttatataactcaacaatgcatgaggaac aagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaccacgaagggacaagaattcatcagacaacaaaaatgagcgcaaat tttaatagatcaacattcattttctctttacatgtgcaagcttaaattctattggttcaaaatttggataacaaccaatg acaagaatcaaaaagaatcgacaagaatcgaaatcatctctaaaagcgaaacacaaagttgaaagaatttcttaaagttc aaacagtttacttttttgcgttttgaagccgattcaaatttatctgcactgaatgtattgtgcaggtgttgaacatgccg ctaaacatttcggcgtgaaattttgtcagattttcgcaaggaacaaaatcactgttgatgtatggtgtgtgcatatgttg atatataatgcacgtgtgacgtaggctgagtgcattgtggagttacaatgaactcggtttgaccaatcacagtgcttgtt taaacgtggttattttataatagtatttaaaatgtaataacagttttggtaaaataaatgtaacattgttgacgtaagct tgcagtcttgtttgtcagtacattaaacaagatgcttgtgggtgtgctgcaaggggaatatttctgtaatatccacctag gagattatcaattctaatattcccttagcttttcagacagttgctaattagaggggttcattcagtataattagcctgga 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Protein
Protein ID | aug_v2a.16978.t1 |
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Definition | - |
>aug_v2a.16978.t1 MMLGYVAAHSETLAWSVVVSKGAIELAAILTENEEDHIKAALAWALGQIGKHTNEHAKAVAVTQALKYLLLCFVNTESSG DLQNKCFVPEKKTRGGHVVATSKERKFKELLISLCPE* |