Gene
| Gene Model ID | aug_v2a.22162 |
|---|---|
| Locus | scaf14960 : 4229 ... 11595 : - |
| To GenomeBrowser | scaf14960:4229..11595 |
| Genes list of scaffold | scaf14960 |
Manual annotation
| Study field | Retrovirus |
|---|---|
| Gene name | Adi-Retrovirus-related 8-2 |
| Description | DNA sequence of this gene model showed similarity with that of Adi-Retrovirus-related 8-1. This gene model contains MAM and Trypsin domains. |
| mRNA evidence |
Annotation by Blast2GO
| Annotation | GO |
|---|---|
| protein | GO:0008233 |
Blast Hit to nr / sp
| query | Subject ID | Subject Name | evalue |
|---|---|---|---|
| aug_v2a.22162.t1 | gi|156365955|ref|XP_001626907.1| | predicted protein [Nematostella vectensis] | 2.8026e-45 |
| aug_v2a.22162.t1 | gi|156372645|ref|XP_001629147.1| | predicted protein [Nematostella vectensis] | 4.99997e-41 |
| aug_v2a.22162.t1 | gi|156380836|ref|XP_001631973.1| | predicted protein [Nematostella vectensis] | 2.0e-32 |
Transcript
| Transcript ID | aug_v2a.22162.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>aug_v2a.22162.t1 attccatgtttgtcacgttgtcacaaataagcgaagtgtattttcacctgactggaacgaacggttttttatttaaagga ggagaatggaaaattttctactgtgggctcatgttgtcgtcagaatctcaaatttcacgtcgttatttgacagactacat caaaaaattgcagcaaaatgcgtgccgcacggtcagcaaccaatcatgttccttgtctgtgatgttgtctctgccgttgc tgtcgtcgtttcttaataaaactctcttttaactcccctattgacatttggcgaaccctttccactgccacataacgtca tcataactcagatttctcttgtttattattcttatttcatttaaattagggcagtgcagtacccaagtcccagctccccc accacctgcgacaacgcaaccaccacaacccgactcaggtaagtattaaattgttttccgttggcttacannnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn 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tttgataaacaatgctgaccgaaaacaatatggctcaaattggccaaaaatcttttgaaacagaactcaaatgatttcct ccgatatactagctttaataatgcataatgattccaggatctaatcgaagctggtgaaaaaaagaataaacctccaagga ttgtgtgcagccttgcaaaatactcaggattccagattctacttaaaagtatttctgaactcagaaatcctcatcattaa gcgtcgttactcgcggcgatggaagcttagcagggaaagtaagttcataggcatagatttctttgtttcctctaggccac caagttcttactctattcgagtaggagaccataaccgacaattaaatgaaggaacagaagagactgtacaagggaaagaa gttatatctcacccggagtataacaaaccatctctcataaacaatgacatcgcactcattcgcttggtaagaccagtcaa gttgggtccacgagttggaacagtgtgtctccctgctcaaggtgaaagtgttccagtatcagcgacatgttacattacag gtatgaaaacctaatttgccacactttaaaatgctgaaatatgtcttcgcatcaatgaaaactcaaaaataatgatgttg tttgttt |
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Protein
| Protein ID | aug_v2a.22162.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>aug_v2a.22162.t1 MENFLLWAHVVVRISNFTSLFDRLHQKIAAKCVPHGQCSTQVPAPPPPATTQPPQPDSDPSCDFENDLCGWTQSKSDNFD WKRQQRRTPSSSTGPSSGQGNTGAFTPKFRPPAPVTCGVSPMTRVIGGVDAKPGNWPWQIALLRGGRFICGGSLIAPDWI VTAAHCVASSRPPSSYSIRVGDHNRQLNEGTEETVQGKEVISHPEYNKPSLINNDIALIRLVRPVKLGPRVGTVCLPAQG ESVPVSATCYITGMKT* |
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