Gene
Gene Model ID | aug_v2a.23372 |
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Locus | scaf16720 : 34647 ... 45115 : - |
To GenomeBrowser | scaf16720:34647..45115 |
Genes list of scaffold | scaf16720 |
Manual annotation
Study field | Retrovirus |
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Gene name | Adi-Retrovirus-related 2-10 |
Description | DNA sequence of this gene model showed similarity with that of Adi-Retrovirus-related 2-1. This gene model contains Glycos_transf_1, NB-ARC, NACHT and Chromo domains. |
mRNA evidence |
Annotation by Blast2GO
Annotation | GO |
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nod3 protein | GO:0000166 GO:0016772 |
Transcript
Transcript ID | aug_v2a.23372.t1 |
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Definition | - |
>aug_v2a.23372.t1 ttggttgtgtgtctccacagaaaaagaacattaggaatgatcgctagcaatcaacaagcgagcaagtttccagtgtggat gccgtgataatctgccttgtgcagttgacggtatgtgaaatgaaatcgtctaggaaatctaaagattattagactttaca aacatacttattatttatccgttatttgcatgtgtgtatttgagcttcacttaagtcaatttttaatttaaacaaagggt aagaataagcatgtgagattgcttccacttccgttcaagggtcacttctatttccatctacactccacaacttcattcca caatatttgcctcactgtgaaagtgtattaacaagaaaaagcaataatatttcatatcctcttcatcatttcttgagaga catttaataattcaatgcattcttttttttttttaggattttgagcaccattactgattgacatggttcatgatggcatc taatgtgtgcctgcctgaagaacatgatgcagttcatggctccagcaaactccaagtcaccattctcgcttctgagtggg gatccagtaaaggagggctctccactttaaacagagagttggccattcaattatccaagtttccttttgtagacgtcacc ttctttttgcccagatgctctcatgaggacaagaaagcagctgctaaccatggtgtttccattgtaaaggcagagagacg acctggttaccatgaagaactggactggctcagctttccgccagagaatttaaggacagatgtggttgttggacatggag taaaacttggtcgccaggcccaatttatccgcaactctcacaaatgcaagtgggttcaaattgttcacactgacccagag gaacttggaatgttcaaatgttatgagaatccaatctcagcaggagagcaaaagcttcacgatgagattgagctttgcca 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Protein
Protein ID | aug_v2a.23372.t1 |
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Definition | - |
>aug_v2a.23372.t1 MMASNVCLPEEHDAVHGSSKLQVTILASEWGSSKGGLSTLNRELAIQLSKFPFVDVTFFLPRCSHEDKKAAANHGVSIVK AERRPGYHEELDWLSFPPENLRTDVVVGHGVKLGRQAQFIRNSHKCKWVQIVHTDPEELGMFKCYENPISAGEQKLHDEI ELCQMADFVVAIGPKLTEAFHRYLSWFKKYVFEFTPGVFTDFSSVQQASVKRKWWSVKRKRWSILVFGRGDAEDFELKGF DIAARSVAALSDTRLYFVGAQHGKHEEIAKCFVDWGIPPSRLKVRGYIDSREDLKQLFCEVDLVLMPSRTEGFGLTGLEA LSAGLPVLVSKNSGFGEVLHSLPFGSSFVIDSEDPSTWTAAIKGIWNRDRKSQLDEVNAVRYLYSKRYSWSEQCKHLIEK MFKLVDDRASCSGHVIEAIQQIYKKCESVIFPVPWCDEFNFHIEDIFTRLRIVEKEKKRGIVTTKEVTNMTSIFTPHECC KQPQIVLIEGEPGMGKTTYCQKLAFDWASKGCREWDESFPRIDVLLLLRCRGIKYTIWDAIEDQILPDEIKPEEKAIFFE FLKENPSKVLLVLDGLDEADPKKLDMYLKLLQRKQLRGCNIVLTSRHEAGGKVRPYTDTFLEIVGFTTTDAEFYIGKYFQ HAEHLANDLIDKLNFEENLMELTQNPLNTLLLCVIFEDLDGVLPTNRTQLYVEIVLFILRRYESKNGLSIKGKDLLLVYK KELMILGEAALDCLRKQELYFDDHKGVIKESLLMKFGFLSIQSGGSKRTPCDRYGFFHKSFQEFFSGYFLAFSVIDNVTN FHSVLTSEKYMGELFHVFKFMSGIVALRSDEIAVSIVQSIASIINEIGGTSDRLVSNLNFAHELINECKTCSGDLYRKLV RTFGENLQLVDVVLAGSSCLQNRKLIETFFQVLTFNSTVSSLKLFEWFLKAEVTNLLLEALKVNTSLSSLNLYRNGICDK GADLLAQALRANTSLSALNLYWNNIGNEGADSLAQALTVNTSLCSLDLSRNFIGDDGANSLAQALRVNTSLSSLDLSGNR ISAEGVNSLAQALRVNASLSSFKLHKVNIGAEGANSLAQALRVNTSPSSLQLSKNSIGTRGANSVAQALRVNTCLSILDL RFDSIGAEGAISLAQALRENTSLSSLNLYYNCIGDKGANSLAQALRINTSLSSLNLLYNCIGDEGANSLAQALSVNTSLL SLNLHANSISNEGANSLAQALRVNTSLSSLDLSCNFLGDEEAIGDSPFYCLYGRKPRLPLDAKFLPPAADDLSTSVLDHR KHIVEKVELAEKLARENIQRSQQKMKEYYDRNASQPLFEIGQRVWVYTPKTKKGISKKLLYNWFGPYRIVEQSSPVHYRL RSKSNKKVTFAVHANRMKPFVDPALRPIEPPSNDDPSELYLDESDIPVDSFASSESHNHNSDTSVAVENNTRAQINSQGQ PDAPDQRKDENKFVIDNQTIFAAEKILKRRKRKGRVQYKVKWLNYP* |