Gene
Gene Model ID | aug_v2a.23990 |
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Locus | scaf17640 : 262 ... 7591 : + |
To GenomeBrowser | scaf17640:262..7591 |
Genes list of scaffold | scaf17640 |
Manual annotation
Study field | Flagellum |
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Gene name | Adi-DHC-f7-46-63 |
Description | Named thus because a bi-directional best hit result was obtained by BLASTP searches. See chlamydomonas DHC-alpha (AAA57316) and DHC-gamma (AAA50455). This is probably a fragmented gene model. AAA7 and AAA8 domains were found by Pfam search. |
mRNA evidence |
Annotation by Blast2GO
Annotation | GO |
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dynein heavy chain axonemal-like | GO:0001539 GO:0003777 GO:0005524 GO:0005858 GO:0005874 GO:0007018 GO:0008152 GO:0016887 |
Blast Hit to nr / sp
query | Subject ID | Subject Name | evalue |
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aug_v2a.23990.t1 | gi|156356375|ref|XP_001623900.1| | predicted protein [Nematostella vectensis] | 0.0 |
aug_v2a.23990.t1 | gi|736303073|ref|XP_010793818.1| | PREDICTED: dynein heavy chain 6, axonemal-like [Notothenia coriiceps] | 0.0 |
aug_v2a.23990.t1 | gi|557016763|ref|XP_006008807.1| | PREDICTED: dynein heavy chain 6, axonemal-like, partial [Latimeria chalumnae] | 0.0 |
aug_v2a.23990.t1 | gi|71891707|dbj|BAB21788.2| | KIAA1697 protein [Homo sapiens] | 0.0 |
Transcript
Transcript ID | aug_v2a.23990.t1 |
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Definition | - |
>aug_v2a.23990.t1 agcttcctggctcaggtgacctcttcagctacttcgtggattttgacactcgtcggcttgagccttgggaaaagatcatt ccttctttcaagtacagtgctgacatcccctactttgacttacttgtaccaactgttgatacggtcagatatggattcat gatggaaaaattgctggctattaacagatctgtgatgtttactgggaccactggagttggaaaggtgcgtagacaatctg ttaattcttaccctttggtttgtttgtttctttttgtgttttgttggttcactgcatcacttacctatgtagtaaatgag acatttttgccaggcattgattctgtcaatcaatgcattcattctgaaagtcagttactctttaaacagttaactttcac actgtattaattgtccctttgtgagccactcagtcagttggtcataagtgtagtaatgattgtgaagccagtaatttagt cattattaatttttgttaaactattagactaggtatgtctgtcatcttgtaacatatataatagttggaattagttgttg gttgatgagtgatatcaaacggttgcagcatcattagtaataacttattatttgtctctgagactaaccctaacactcac aaaaaccacctacaacccacagtagttattcctcgatttgctctgacaaaggggtgaggtttttgaaacacttttatgaa ctcatttaataaaaccaaattttacatgtttcactctcctactgattcagcattgtacagtagtttctttagaaactaga ggtttgcaacacagggtgggttagatcttaaatatgtagccttaaaactggttcaatttttattttcttttgttgtgtat tcattaccataatctggaacaagggcaagtaaaattgaaaccagttcaaaaaacattaaaccaagtataaatttaaacca 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Protein
Protein ID | aug_v2a.23990.t1 |
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Definition | - |
>aug_v2a.23990.t1 MMEKLLAINRSVMFTGTTGVGKSVVAKGLLTDISEKANYVPIMMNFSAQTSSQRTQEMIEVKLEKKRKNILGAPAGKRMI IFVDDLNMPKLDTYGAQPPIELLRQYQDFRGFYDREKLFWKEIHDMTICAACAPPGGGRNPVTPRFLRHFSMFSIPSSAE HTLKHIFKSIVTGFLVDFPQDVRNCADAIVGASVEIYERMSTDLLPTPAKSHYVFNLRDLSKCIQGVLQADSGVIRDGSQ IFRLFCHEAQRVFHDRLINKEDKRYFNTILSEMAQKHFSQNVEAEKFETTPILFGDFMKMGADPGDRIYEDLVDITKVKT LLADYLDDYNMNSSKEMKLVFFMDAIEHVSRIARMVRQPRGNALLVGVGGTGKQSLTRLACHMSGYLCFQIELTRGYDYS AFREDLKKLYMSAGVQGKNTVFLFTDTQIVVEEFLEDINNILNSGEVPNLFEPEEYEQVLNGTRPFAKEAGVPEGDRDAV FNYFISRVRNNLHVVLCMSPVGDAFRTRCRMFPSLVNCCTIDWFTEWPRLVQ* |