Gene
| Gene Model ID | habu1_s1233_g04272 |
|---|---|
| Locus | habu1_scaffold1233 : 986137 ... 995028 : - |
| To GenomeBrowser | habu1_scaffold1233:986137..995028 |
| Genes list of scaffold | habu1_scaffold1233 |
Annotation by Blast2GO
| Annotation | GO |
|---|---|
| low quality protein: alpha-n-acetylgalactosaminidase | EC:3.2.1.49 GO:0001575 GO:0008456 GO:0016052 GO:0019377 GO:0042803 GO:0070062 |
Hmmer Search for Pfam
| query | Total | ID | Target | From | To | Eval | Score | cEval | iEval | Score |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| habu1_s1233_g04272.t3 | 1 | 1 | Melibiase | 23 | 131 | 2.3e-13 | 49.6 | 1.2e-16 | 8.8e-13 | 47.7 |
Expression profile
| Libraries | FPKM |
|---|---|
| >Adult | |
| Venom fang forming tissue | 8.8 |
| Venom grand-1 | 7.0 |
| Pit, infrared sensing | 9.6 |
| Nose | 7.8 |
| Brain-1 | 2.3 |
| Eye | 4.3 |
| fetal fibroblast | 10.2 |
| venom gland-2 | 6.4 |
| Brain-2 | 2.5 |
| Spleen | 8.0 |
| Lung | 10.4 |
| Liver | 11.4 |
| Kidney | 10.9 |
| Pancreas | 9.5 |
| Small intestine | 11.7 |
| Large intestine | 11.6 |
| Stomach | 20.8 |
| heart | 5.4 |
| ovary | 1.0 |
| cheek muscle | 4.1 |
Transcript
| Transcript ID | habu1_s1233_g04272.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>habu1_s1233_g04272.t1 tgcttcctcttttcctcgggacaaaagcgagggcggtggtggagttgacaggacgctgagatcagcaccttatcggctct actattgagcaatccaagggatcagctgatcggtggaaggaagcgagcacgtgattagcagccctgtgcaggaaagcgat cgacttgcaggctttcgattgtcgctggtgtagtactggttgcagcttaatgtctgatagttggtcatcccccaatccct tgtcatgaaatgtgttgtcttccttcttctactccatgccttctctctggctttggagaatggacttatgagaacgcccc ccatggggtggcttgcttgggagcgctttcgttgtaatgttgattgcaagaaagatccccataattgtatcagtgagact ctctttatggaaatggcggactgtctggcaatggatggttggagggagctgggctacgagtacgtgaatattgatgactg ctggatggcaaagaagcggaatatgacgggacatctgattccggatccagagaggtttcccagagggatcaaagccttgg cagactatgttcattcacggggtctgaaacttggcatttatggtgatctaggcacccatacttgtgcaggtttcccgggt actacattaaattgtattgaacaagatgctttaacgtttgcacaatggggagtggatatgctgaaactagatggttgcta ctcatcagcagatgaacaggcccaaggttatcctagaatgtccaaggctctgaatgcaacaggtcatcccattgcttatt cctgcagctggccagcctatcgagggggactcccaccttcagtgaattatactcttttagcaaatatatgtaacctctgg agaaactttgatgacatacaagactcttgggaaagtgttctctctattgtggaatggttctcaaagaatcaggatgtact tcagccagcggctggccctggccattggaatgaccctgacatgctaatcattggaaactttgggctgagccttgaagaat ccaagtcccagatggccttatggacaattatggctgctcctcttttcatgtccacagacctccgtgttatttctgaaagt gccaaggagattctacaaaacaaattgatgatcacaattaaccaagatcccctgggaattcaaggtcgtagaatccttca ggagaaatctcaaattgaagtatttctgcggcctctttcccactcagccagtgctctggttttctttagtcagaggacag acatgccatatcactacacaacttcccttgcacagctcaattttacagagaatgctgtctatgaagcacaggatgtgtac accagtgaaataatcagtgacctgaagattgctaccaacttcacagtggtgattaatccctctggagtagttatgtggta tctgtacccagcaatgtacctggggcagccttctaacttcataaagcagcaggtgaaagcaaataaattcagtcccttta atctgtgatagccagcagttgaataacattttggaaagctgctaaggattcaccactccctattggtacacttgtggtac ttcaacagagaaaaaaaaagattgtgtaggttggcagttttacacaagtaacatacaaattgagatctacctttacacac aatggagatgctattacagtagttcactagtatgcagtccaatatttctaagtacagtagacataaataagtagacatgt attcttatttatatagattagactgctaatgatggtcacatgctttgagataatcaactagaagctggttgcctatacat aagcataaccatgggaaaaatttatattttgtacaaggaatttcctatagatcactgaattgtaaatttcctggattcca aaactgaactggaattgtcctttaatgcacagaatttctattgcactataggtgtttgtaataatatcagctatttcagt agctgaaataattgcaaaagttctttttgttaagggttctagcatttcttttattgtcgcttatctgactggcttaattt tccaggatttttattttttttattcttttgttgtaaacaactctttagggactattttttcatcgtatgttcagatgttt atatttttaaataagtttttgaataaagattattgtttcagaaatgatttgattaaaaagccatataaaatgaataaatt ttcaaagtgtttgctaattc |
|
| Transcript ID | habu1_s1233_g04272.t2 |
| Definition | - |
>habu1_s1233_g04272.t2 ctaacacatttccagcatagtgaatggctgtgctgaataaggatgataggatttaaagccaacatatctgaaaaacatta gattggaaaaggaagggctggccatttggtaaaaaaatcaacaatgaaacataccttttaactttttttccccatctgac atcgtcttatgcaatggtgggcagaagcataatttgaaccggccattcagtcagcagaaatatttgtattcacataaaat ggggaaaatgctaccacatactaaatattgatgtttcagtgttttatctagtttgcgtttgtatctttccattggtggaa acataattttacatactacaaagtaagtgttcatcctcggggagtttgtttgggtaactagttattcttagttttaacac tctactcattagatatctactcttacaataagcaatttcaatttaagtcaacattgttgagatattctgcaaataaagaa gaagaggagaagatggtggattagcttttgaggaagtgattaaaaatagatgctcactaacaccaacaataacaatgttt gtactgtttcctccatcatgtagattcttcataggtcttctttcttgatctcacaagtcatgacatattttggcaggttc attcacggggtctgaaacttggcatttatggtgatctaggcacccatacttgtgcaggtttcccgggtactacattaaat tgtattgaacaagatgctttaacgtttgcacaatggggagtggatatgctgaaactagatggttgctactcatcagcaga tgaacaggcccaaggttatcctagaatgtccaaggctctgaatgcaacaggtcatcccattgcttattcctgcagctggc cagcctatcgagggggactcccaccttcagtgaattatactcttttagcaaatatatgtaacctctggagaaactttgat gacatacaagactcttgggaaagtgttctctctattgtggaatggttctcaaagaatcaggatgtacttcagccagcggc tggccctggccattggaatgaccctgacatggtaatgttgagcagaagaggatcataggaaagctaaatgaatgagagag gctctctttggaattctaaagctagaaaaaagctaatgaagctaatcattggaaactttgggctgagccttgaagaatcc aagtcccagatggccttatggacaattatggctgctcctcttttcatgtccacagacctccgtgttatttctgaaagtgc caaggagattctacaaaacaaattgatgatcacaattaaccaagatcccctgggaattcaaggtcgtagaatccttcagg agaaatctcaaattgaagtatttctgcggcctctttcccactcagccagtgctctggttttctttagtcagaggacagac atgccatatcactacacaacttcccttgcacagctcaattttacagagaatgctgtctatgaagcacaggatgtgtacac cagtgaaataatcagtgacctgaagattgctaccaacttcacagtggtgattaatccctctggagtagttatgtggtatc tgtacccagcaatgtacctggggcagccttctaacttcataaagcagcaggtgaaagcaaataaattcagtccctttaat ctgtgatagccagcagttgaataacattttggaaagctgctaaggattcaccactccctattggtacacttgtggtactt caacagagaaaaaaaaagattgtgtaggttggcagttttacacaagtaacatacaaattgagatctacctttacacacaa tggagatgctattacagtagttcactagtatgcagtccaatatttctaagtacagtagacataaataagtagacatgtat tcttatttatatagattagactgctaatgatggtcacatgctttgagataatcaactagaagctggttgcctatacataa gcataaccatgggaaaaatttatattttgtacaaggaatttcctatagatcactgaattgtaaatttcctggattccaaa actgaactggaattgtcctttaatgcacagaatttctattgcactataggtgtttgtaataatatcagctatttcagtag ctgaaataattgcaaaagttctttttgttaagggttctagcatttcttttattgtcgcttatctgactggcttaattttc caggatttttattttttttattcttttgttgtaaacaactctttagggactattttttcatcgtatgttcagatgtttat atttttaaataagtttttgaataaagattattgtttcagaaatgatttgattaaaaagccatataaaatgaataaatttt caaagtgtttgctaattc |
|
| Transcript ID | habu1_s1233_g04272.t3 |
| Definition | - |
>habu1_s1233_g04272.t3 tgcttcctcttttcctcgggacaaaagcgagggcggtggtggagttgacaggacgctgagatcagcaccttatcggctct actattgagcaatccaagggatcagctgatcggtggaaggaagcgagcacgtgattagcagccctgtgcaggaaagcgat cgacttgcaggctttcgattgtcgctggtgtagtactggttgcagcttaatgtctgatagtgtaagtgtcctgatgtgtc ttgaagtttggatgggtgatatacgtgaacggtcgggatggggaatagtcttttttttttttcttttgtctgatcaaaga tcgcagtatatgaaaatgaacagaaaaacgaacgattgttccagagtacctactgattacgattacagttgtagatttga attaatttaggccgtttgtgccctcagtgaaatacgttttcattaaatgaaaaataccgattttgcacaattatttcacc attgtcttgatgcagtctaaagaaggtttctttgtaaatgcggaaactggcttgcagcagccacggggaggggggaggcg gatggatgcctgggattttaatggacacagcgatagatttggcaacagtttgcaagaagttttctattgcctttcttcat gattttttaacttagatcagctcaccttaatggtttcccattcagatacaaataggtcccgctgggccagatgctgcaat tctgtttcatcccaaacaagtacattgtgcgtaatgaaactttttgccaagttggaaacagaaccaggcattgatcctat ggctgattctgtatctgcacatctcagaaaattaaattattcatatgaagctactttcgctaagtacataagatttatct tagagaaaactatgattgaaagtagctctccagagaccttgcaaaagatttcctctggtgtgctgcctgagattcattca tagcacatgtcagataatgaacctgggaattgctatatgctattatcttgccacaagccaactttccttacttgatgccc ttcaaagtgcggggctgtgtcatttcgtgaattctacactacacttcatttagtggacctgtggaattaacatattcttt atgaaagtgtagtataatagatactggtcaggaatgctgtgtctgtaattttgcttccgtcactgtgtgtgcttcaggat cctgctctaacagcagcatgagtcccagaatgcaacactgggaacttgtgtgtgtggtgtaaaacagggaaggtggtcat cccccaatcccttgtcatgaaatgtgttgtcttccttcttctactccatgccttctctctggctttggagaatggactta tgagaacgccccccatggggtggcttgcttgggagcgctttcgttgtaatgttgattgcaagaaagatccccataattgt atcagtgagactctctttatggaaatggcggactgtctggcaatggatggttggagggagctgggctacgagtacgtgaa tattgatgactgctggatggcaaagaagcggaatatgacgggacatctgattccggatccagagaggtttcccagaggga tcaaagccttggcagactatgttcattcacggggtctgaaacttggcatttatggtgatctaggcacccatacttgtgca ggtttcccgggtactacattaaattgtattgaacaagatgctttaacgtttgcacaatggggagtggatatgctgaaact agatggttgctactcatcagcagatgaacaggcccaaggttatcctagaatgtccaaggctctgaatgcaacaggtcatc ccattgcttattcctgcagctggccagcctatcgagggggactcccaccttcagtgaattatactcttttagcaaatata tgtaacctctggagaaactttgatgacatacaagactcttgggaaagtgttctctctattgtggaatggttctcaaagaa tcaggatgtacttcagccagcggctggccctggccattggaatgaccctgacatgctaatcattggaaactttgggctga gccttgaagaatccaagtcccagatggccttatggacaattatggctgctcctcttttcatgtccacagacctccgtgtt atttctgaaagtgccaaggagattctacaaaacaaattgatgatcacaattaaccaagatcccctgggaattcaaggtcg tagaatccttcaggagaaatctcaaattgaagtatttctgcggcctctttcccactcagccagtgctctggttttcttta gtcagaggacagacatgccatatcactacacaacttcccttgcacagctcaattttacagagaatgctgtctatgaagca caggatgtgtacaccagtgaaataatcagtgacctgaagattgctaccaacttcacagtggtgattaatccctctggagt agttatgtggtatctgtacccagcaatgtacctggggcagccttctaacttcataaagcagcaggtgaaagcaaataaat tcagtccctttaatctgtgatagccagcagttgaataacattttggaaagctgctaaggattcaccactccctattggta cacttgtggtacttcaacagagaaaaaaaaagattgtgtaggttggcagttttacacaagtaacatacaaattgagatct acctttacacacaatggagatgctattacagtagttcactagtatgcagtccaatatttctaagtacagtagacataaat aagtagacatgtattcttatttatatagattagactgctaatgatggtcacatgctttgagataatcaactagaagctgg ttgcctatacataagcataaccatgggaaaaatttatattttgtacaaggaatttcctatagatcactgaattgtaaatt tcctggattccaaaactgaactggaattgtcctttaatgcacagaatttctattgcactataggtgtttgtaataatatc agctatttcagtagctgaaataattgcaaaagttctttttgttaagggttctagcatttcttttattgtcgcttatctga ctggcttaattttccaggatttttattttttttattcttttgttgtaaacaactctttagggactattttttcatcgtat gttcagatgtttatatttttaaataagtttttgaataaagattattgtttcagaaatgatttgattaaaaagccatataa aatgaataaattttcaaagtgtttgctaattc |
|
Protein
| Protein ID | habu1_s1233_g04272.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>habu1_s1233_g04272.t1 MKCVVFLLLLHAFSLALENGLMRTPPMGWLAWERFRCNVDCKKDPHNCISETLFMEMADCLAMDGWRELGYEYVNIDDCW MAKKRNMTGHLIPDPERFPRGIKALADYVHSRGLKLGIYGDLGTHTCAGFPGTTLNCIEQDALTFAQWGVDMLKLDGCYS SADEQAQGYPRMSKALNATGHPIAYSCSWPAYRGGLPPSVNYTLLANICNLWRNFDDIQDSWESVLSIVEWFSKNQDVLQ PAAGPGHWNDPDMLIIGNFGLSLEESKSQMALWTIMAAPLFMSTDLRVISESAKEILQNKLMITINQDPLGIQGRRILQE KSQIEVFLRPLSHSASALVFFSQRTDMPYHYTTSLAQLNFTENAVYEAQDVYTSEIISDLKIATNFTVVINPSGVVMWYL YPAMYLGQPSNFIKQQVKANKFSPFNL |
|
| Protein ID | habu1_s1233_g04272.t2 |
| Definition | - |
>habu1_s1233_g04272.t2 MNERGSLWNSKARKKLMKLIIGNFGLSLEESKSQMALWTIMAAPLFMSTDLRVISESAKEILQNKLMITINQDPLGIQGR RILQEKSQIEVFLRPLSHSASALVFFSQRTDMPYHYTTSLAQLNFTENAVYEAQDVYTSEIISDLKIATNFTVVINPSGV VMWYLYPAMYLGQPSNFIKQQVKANKFSPFNL |
|
| Protein ID | habu1_s1233_g04272.t3 |
| Definition | - |
>habu1_s1233_g04272.t3 MKCVVFLLLLHAFSLALENGLMRTPPMGWLAWERFRCNVDCKKDPHNCISETLFMEMADCLAMDGWRELGYEYVNIDDCW MAKKRNMTGHLIPDPERFPRGIKALADYVHSRGLKLGIYGDLGTHTCAGFPGTTLNCIEQDALTFAQWGVDMLKLDGCYS SADEQAQGYPRMSKALNATGHPIAYSCSWPAYRGGLPPSVNYTLLANICNLWRNFDDIQDSWESVLSIVEWFSKNQDVLQ PAAGPGHWNDPDMLIIGNFGLSLEESKSQMALWTIMAAPLFMSTDLRVISESAKEILQNKLMITINQDPLGIQGRRILQE KSQIEVFLRPLSHSASALVFFSQRTDMPYHYTTSLAQLNFTENAVYEAQDVYTSEIISDLKIATNFTVVINPSGVVMWYL YPAMYLGQPSNFIKQQVKANKFSPFNL |
|