Gene
| Gene Model ID | habu1_s1506_g05591 |
|---|---|
| Locus | habu1_scaffold1506 : 136401 ... 154375 : - |
| To GenomeBrowser | habu1_scaffold1506:136401..154375 |
| Genes list of scaffold | habu1_scaffold1506 |
Hmmer Search for Pfam
| query | Total | ID | Target | From | To | Eval | Score | cEval | iEval | Score |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| habu1_s1506_g05591.t4 | 1 | 1 | Cyclin_N | 58 | 145 | 2.0e-08 | 33.8 | 5.0e-12 | 2.5e-08 | 33.5 |
Blast Hit to nr / sp
| query | Subject ID | Subject Name | evalue |
|---|---|---|---|
| habu1_s1506_g05591.t4 | gi|133778031|gb|AAI17817.1| | Ccnl1 protein, partial [Mus musculus] | 0.0 |
| habu1_s1506_g05591.t4 | gi|296491164|tpg|DAA33237.1| | TPA: cyclin L1 [Bos taurus] | 0.0 |
| habu1_s1506_g05591.t4 | gi|20385179|gb|AAM21205.1|AF367477_1 | 0.0 |
Expression profile
| Libraries | FPKM |
|---|---|
| >Adult | |
| Venom fang forming tissue | 45.2 |
| Venom grand-1 | 85.1 |
| Pit, infrared sensing | 52.7 |
| Nose | 63.8 |
| Brain-1 | 30.5 |
| Eye | 41.5 |
| fetal fibroblast | 54.0 |
| venom gland-2 | 87.4 |
| Brain-2 | 19.2 |
| Spleen | 51.7 |
| Lung | 47.7 |
| Liver | 31.6 |
| Kidney | 27.5 |
| Pancreas | 45.4 |
| Small intestine | 48.2 |
| Large intestine | 46.8 |
| Stomach | 40.4 |
| heart | 40.2 |
| ovary | 20.3 |
| cheek muscle | 18.9 |
Transcript
| Transcript ID | habu1_s1506_g05591.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
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|
| Transcript ID | habu1_s1506_g05591.t2 |
| Definition | - |
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|
| Transcript ID | habu1_s1506_g05591.t3 |
| Definition | - |
>habu1_s1506_g05591.t3 ttacaaactgtaggactccaagcccattgatacttgatcagaactacataaacaccaaaaatcaagtaatcaaagcagaa aggagggtgctgaaggaattgggattttgtgttcatgtcaagcatccacataagatcattgttatgtacttgcaagtctt agaatgtgaacgtaatcaaactctcgtccagacagcctggaattacatgaatgacagtcttcgaaacaatgtatttgttc gatttcaagcagaaacaatagcttgtgcttgtatctatcttgctgctagagctcttcaaattcctttacctaaccgtcct cattggtttttgctttttggagctactgaagaagacattcaggagatatgtttaacaacacttaagctttacactaggaa gaagcctaattatgaattgcttgataaggaagtagaaaaaagaaaaatggctctacaggaagctaaattaaaagccaaag gattaaatccagatggaactccagctctttcgacattgggaggcttttcacctgcttctaagccctcatctccaagagaa ataaaaatagaagaaaaatctccagtatgtattaatgcaaaaactatcaaaaaggagccagaagacaggcagattgcttc caagagtccttataatggtatgagaaaagagagcaagcgaagcagaagcagcagaagtggtagccgatcaaagtcgagaa caaaatcgcgatctaggtctcactctccaaggagacattacaacaataggcggagtctctcgggaacctacagctcaaga tccagaagcagatcacgtagtcacagtggcagccctcgaagacaccacaatcatggatccccccatctaaagccaaagca cagcagagaagaattgaaaggagtaaatagacatagtcacaagcgaaaaaagtctcggtcacgttctcagagcaaatcta gggatcattcagaactcgttaagaaacatagacacgagcgaggacaccacagggacaggcgagaaaggtctcgttcattt gagagatcccataaaagcaagcaccacagtgctggtcgttcaggacatagcaggcacaggcgctgaatgtgggtgcgttg cttattacctttgtttggatgttctacaaggtatgggactgtttgaaacttgaagtcaattaggatttaatttgaagccc agtatgtccagaatgtaagacacgtttaaaaaaaaatgttgacgttttgcacataaaataccttagcagtatcatataat ttgaaacaataatcaggttaaattgtatgtgtttaggattgtggtatcaatatgaaaactggagatctgtttctgtacaa atgtatcttatttttatacgaacatattgcagacatttctatttaagtatagttatttgtttaagataatggtgggtact ttcttacactggttttagtctgcatgtgtaaattttttttacaaaaaaataaaatatacaactttttactaccctgctga atacctcattaaacaatcttttgtcaaattctgatgttttcttaacaagtcattatttcctcctagtttctcttcagata gcatggagagacatcttctaaagtaccatttaaacattacagaaacttcccaataagataatgaatgttgaaactagcaa aacttgttttctgttcagaatcagattaaatagtgaatcagatgaaaggtcattattaaaattcaagtcttcaattcaaa ct |
|
| Transcript ID | habu1_s1506_g05591.t4 |
| Definition | - |
>habu1_s1506_g05591.t4 agtctctgcgtggccggctccgggtgcggtcgacgtgcgttcagttccgcgattattcgtcatggcctctgctgggactc acgtctctcctgccgccgcgggcgccccgctgccctcagcgccgccgccgccgccccctctccctctccccgtcgggatt ctgatcggggaccgattgtactcggaggtgtcgctgactatcgaccactcgctcatccccgaggagcggctctcgccgac tccttccatgcaggacgggctggacttgcagagtgaaaccgacctccggattctgggctgcgagctcatccaggccgcgg gcatactcctgcgtctgccacaggtggcgatggcaaccgggcaggtgctgttccatcgtttcttctactccaagtccttt gtcaagcacagtttcgagattgtggctatggcctgcattaatcttgcttccaaaatagaagaagctcctcgtcggataag agatgtgatcaatgttttccatcacctacgccaactaagaataaaacgcgaccagctacatttaccaaagcctgggtgat gtggagtggttcatagagatgaagctgtcgtcatggcaacaggtcagttatgcaacaaatacaggcatgcagcaaaatgt gcctttgggcatgtacatgtgtgtatgtatatgtatacacaagtgcaaatttaaaattaaatacagaacatcaatttaga ttgagaatgagagatactgacttgataatttgatccccgtttatgtgttcaggacaatatttcaaattgtaatgctttac agttttacaaaaataattatggtagatactaaacagacttgcagactcatttgtatttacttacaagataatccagcttt acaatttgcttccaatgaaatgtatttaatttaaattctgatttgactaaatgtattacagttgggtgcatcatttttat tctaatgccggacctattggaagcagttgagcaattgtttcatatcatatatccctctaaaatgagtgtgctttagctgt tctcagtattcaactaacatatttctcaaatataaaatatgtaaaaattatcttgttttttatactctggtgaattaatc tattccagagaaaggaaatataaaaagtatttctattcaaatttctaggtactacagtattaaatattgagccttttaat cttgaaatacatttcacatccaagtagctgatatcttatgtacaaatttgtccaaaaacttacagaatattctatttccc tctatgccctgcaaggggtattcagtttggcatgtttcaaaggatgaatggaatgttctggagttgttcagttactcctt atcagtactttctcataacataacaattacaaactgcttcttttataagtgaaattcacttacggattttttaaatgaat atggtcaattgccaagtgctacactaatagagattttaaatctgattacagataagtttgatatttcttaagtatttgga aaagttttattgtttgccttaaaaaacaacgtgcataattttatagactttcggaaaaaaagtttgagatttaactgagg ttattaaaatgaatgtttgtgtcataagcagtttaataaaattggaaaaatacatgcattttcaggaattaaataacatt aagtataaaattgaagatgagatttgcttgtttataatgataatgtgaatttggggaaagactctggtaaaaaaaaattc ctaggacaaataactacaggcaccagaataagtaacatttgcctgtttaggttgcacaccagcaagataattgaaacatc ataaagacatatacttctccatattttttttatttctcagatgtcctgtggctctaaactatcttggatatgcaatcaaa tatgggatttgaatcaaacagtacttatagaaatgtaatctgatatgtcatttggctctgcataactaactaaaacagga atatgatttgcttttctctctgtccaattaaaaatggtaacattcagaatattatgctattaacagcttacatgcctata acaaaggaaagaggttgacacattttctgagtctgtgatgcttattttttgcagttcggtggagaaaatatattttcccc aagttttttgttgaatatgaaatgtgctagaattcagagtaaagtggaatgcctaatgttctaagatgtgaaaatacata tctttatccaatgaagctgaccatctaaatgtcagggatatagtggaaattgtagtaatatgcaaggctgcataatataa gctaaacattttgttttgtgcattatgtacaatatatactttaaggcttgaataagcttatcaaggaaaatatattttaa atggacaacttttaaatatttctcttgtactcaataatttattttttagtttgttaaaaagtgagaatttcccaaaatca tagtctgtcctcaaaatgtagagatacagaaatgtatacgatttcttatttgtcattgctttttaaacaagaaatatatt tttaaattcaaatcggacataatggaagaaattgtgtgcatgtatctatacagatacatgcacacatatgtcctcacttt ggatatgcatggaaaaaatattacaaggtttcatttacttatactgtgcataacagatttattttacagagttgaaagtg gcggcagaaatttaaatatatatgccagtaagttccttttcagataatgaaaactttccctgagaaactgttgggactct ttgtcttgtagctcaaactgtcttttttaatgaagtatctttcaaatgtctcatttcaaatattgacagtaaatgaaatt ttaggtaatgacttttagttaacttggacagcacaagattaaagcttaaacttgtttgcaggagt |
|
Protein
| Protein ID | habu1_s1506_g05591.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
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| Protein ID | habu1_s1506_g05591.t2 |
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| Protein ID | habu1_s1506_g05591.t3 |
| Definition | - |
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| Protein ID | habu1_s1506_g05591.t4 |
| Definition | - |
>habu1_s1506_g05591.t4 MASAGTHVSPAAAGAPLPSAPPPPPPLPLPVGILIGDRLYSEVSLTIDHSLIPEERLSPTPSMQDGLDLQSETDLRILGC ELIQAAGILLRLPQVAMATGQVLFHRFFYSKSFVKHSFEIVAMACINLASKIEEAPRRIRDVINVFHHLRQLRIKRDQLH LPKPG |
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