Protobothrops flavoviridis ver. 1.0

OIST Marine Genomics Unit since 2008

Gene
Gene Model IDhabu1_s186_g01020
Locus habu1_scaffold186 : 86197 ... 137695 : -
To GenomeBrowser habu1_scaffold186:86197..137695
Genes list of scaffold habu1_scaffold186

Annotation by Blast2GO
Annotation GO
gpi inositol-deacylase GO:0006505 GO:0006886 GO:0007605 GO:0009880 GO:0009948 GO:0016788 GO:0021871

Hmmer Search for Pfam
query Total ID Target From To Eval Score cEval iEval Score
habu1_s186_g01020.t2 1 1 PGAP1 82 300 0.0 245.4 0.0 0.0 244.8

Blast Hit to nr / sp
query Subject ID Subject Name evalue
habu1_s186_g01020.t2 gi|591355422|ref|XP_007072016.1| PREDICTED: GPI inositol-deacylase, partial [Chelonia mydas] 0.0

Expression profile
Libraries FPKM
>Adult
Venom fang forming tissue 0.2
Venom grand-1 0.0
Pit, infrared sensing 0.1
Nose 0.1
Brain-1 0.7
Eye 0.0
fetal fibroblast 0.8
venom gland-2 0.4
Brain-2 0.3
Spleen 0.0
Lung 0.0
Liver 0.0
Kidney 0.2
Pancreas 0.1
Small intestine 1.3
Large intestine 0.1
Stomach 0.5
heart 0.0
ovary 0.2
cheek muscle 0.1

Transcript
Transcript IDhabu1_s186_g01020.t1
Definition-
>habu1_s186_g01020.t1
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Transcript IDhabu1_s186_g01020.t2
Definition-
>habu1_s186_g01020.t2
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Protein
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Definition-
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KLKSSLSSLITPSTNKLYLYLQSA

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