Gene
| Gene Model ID | habu1_s2069_g07561 |
|---|---|
| Locus | habu1_scaffold2069 : 181584 ... 190145 : - |
| To GenomeBrowser | habu1_scaffold2069:181584..190145 |
| Genes list of scaffold | habu1_scaffold2069 |
Annotation by Blast2GO
| Annotation | GO |
|---|---|
| band -like protein 3 | GO:0007399 GO:0008092 GO:0016020 GO:0032989 GO:0034613 GO:0044304 GO:0044424 |
Hmmer Search for Pfam
| query | Total | ID | Target | From | To | Eval | Score | cEval | iEval | Score |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| habu1_s2069_g07561.t2 | 1 | 1 | 4_1_CTD | 1 | 77 | 0.0 | 158.7 | 0.0 | 0.0 | 158.6 |
Blast Hit to nr / sp
| query | Subject ID | Subject Name | evalue |
|---|---|---|---|
| habu1_s2069_g07561.t2 | gi|675614797|ref|XP_008936258.1| | PREDICTED: band 4.1-like protein 3, partial [Merops nubicus] | 0.0 |
| habu1_s2069_g07561.t2 | gi|511944665|ref|XP_004790875.1| | 0.0 | |
| habu1_s2069_g07561.t2 | gi|156230762|gb|AAI52369.1| | Epb4.1l3 protein, partial [Mus musculus] | 0.0 |
| habu1_s2069_g07561.t2 | gi|193787759|dbj|BAG52962.1| | unnamed protein product [Homo sapiens] | 0.0 |
| habu1_s2069_g07561.t2 | gi|221040120|dbj|BAH11823.1| | unnamed protein product [Homo sapiens] | 0.0 |
Expression profile
| Libraries | FPKM |
|---|---|
| >Adult | |
| Venom fang forming tissue | 2.4 |
| Venom grand-1 | 13.9 |
| Pit, infrared sensing | 3.2 |
| Nose | 1.8 |
| Brain-1 | 21.3 |
| Eye | 8.7 |
| fetal fibroblast | 12.7 |
| venom gland-2 | 13.9 |
| Brain-2 | 41.0 |
| Spleen | 4.7 |
| Lung | 2.2 |
| Liver | 16.8 |
| Kidney | 2.3 |
| Pancreas | 13.5 |
| Small intestine | 101.6 |
| Large intestine | 2.1 |
| Stomach | 9.5 |
| heart | 63.3 |
| ovary | 8.1 |
| cheek muscle | 2.7 |
Transcript
| Transcript ID | habu1_s2069_g07561.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>habu1_s2069_g07561.t1 gacaacagccaacccagcttttttattatttcttcatgatttaaatcaattaacacaatacaaagctgacattaggcatt taaactaaagatcagtcttactgaaatgtagtatgctgctattgcttgtttttgaagagaaaataatgctttacaagacc accagaaccctagtcctaaccacttgcttgtgtagattactacttatattcggtacagacttgtgctaatttattttcca ttattttctctttgtaaccctgccacatttcctcctctcctttgtctttgtgtcaattaacataaactttgtgtgtgtct gtctgtttcgctttctgtgtccatatgcctatgactatatatttctctgtctgtttagacaaaacaactctccgatgaaa aatctttggatggttctggtatcttcacattaatagaatctgcaagaaaaccaactgagttcataggaggggttacaact acttcacatagctgggcacaggtggccatctgattaatctttagattttaatgattatcccttgatgggtcatggtatta ttttatagtaacattgagtttacctttattattttgcacataagtatctttaggaacggtatggaaaacattaatgcata tgctgagtactttttcttcctaaagttgtacatttaaacttgaagaaattcagaaatgggaggtagtagtcagtttgtta ttcttgagatagaatttaagtgtatgaaatataaaattggacttcatatttattagcgatatgcagatatccagatttaa agagcagaatataatttggaacatgcaaagatgtgaatgtacgtgtcaggtatacttaaggtggttgcatctttttcctg atcacatgaccatgctacagcgtgatctaatttggtgtaaggtacttctgaagcattttgtattttaacaagtagttgaa gcatgccacgtgtaaatccaaatcacattttgcccttcaaactgaggtctcttcaaaatctttataacagaaatcatatg gaatttctgagcactcggatcacctgtacagaaagtaaaagcatgtaaaacaaaccctcggtcatgtttgatggtcttta attgtagattttacacattagcttttaatattaacttgcctttcctgcagcgaacagaaacacaaactgatcaggaaaag aaagcagaggaacaacagcaggaggccaccaagaaggttgtgcaggaatctttaatagtcaaggagaaacatgtgatgag tttgcatgcaagtgaggatgctgctaagttggctggccttcagctggatgctacagcacagacaatatctcatgtggctt ctagcatcaatgggaaagagggctctgctatcactgagggggctaaagaggaaaaagctgcaatccaacaggaagaaact gctactatttctcatgatctacaagaggagcaaagtaaatcagcccatattttgaatacgcaagaaagcaaacctctttt tgagtcacccattgtgaagactgagacagtcagttttggcagtgcttctacaggtgcagagaaattggaaatttctatga aagaagtacctgttgtccatactgaaacaaaaactattacatatgaatcatctgaggtggattctagtgctgattctgaa ccaggagttctgatgagtgcacagactattacttctgaaactactagtactacaactactacacatatcaccaaaacagt gaaaggaggcatttcagagacaagaattgaaaagcgaattgtgataacgggtgatgcagatattgaccatgatcaggcgc tggctcaggcaattaaagaggccaaagagcagcaccctgacatgtcagtgaccaaagtagtggtacataaagagacagaa atcacaccagaagatggggaggattgactacaggattagagtagctttctatgaacttcatcactgggaatatcagagcc tgtatggagtcttggttctaacccagctgacttgcatctctccagagaaattttcaatgtggaagattttgattttaatt gctaattaaggacactggcagaaattcccccagttacagcaatttgaatcagctttaataatctaataattgcatgaaac aacaaattacaaaaaagcagcatttttattttcctaaatcaactttacatctaaatggcacgttcatcaacagttaaaat aattgtattatgctacacataaaacagctcatgcctttactattattgagagtctaaacacagtttcttggggtgcaaag ttttgtttagggaaaatcaagatcacattacaatactagaagctgtacaggtactatatatatatgttttattacattag atgtgccaataacatactttattcaacaaataacttgaatcatatacttgttataatttggttttattcttgttctataa acaatgctgaatctctaaccttatttaaatgcttataaaatatgctttgtttatctgatttgggacccttaatagctaat gatttttagaattgttaaagttagaaatcctgccgtcacttttctaaagtctcaatctataaatttgcattgtgattatt ttgaagaaaatgtatattttccttagcatctcagatatgttcatcttgaaaacatgatttttcaaaaccaagtcctgtcc actctcagacaaagaagtttcttttgcaagtctagtcagtgttccttacttaggtcagagttaagccttaaaccgtacag aacacttaaaaagcattatttcatttttattatcacatcagtttaaaaggatccaatgttctttatgctgtcagtttcat cacaatacatggcgaatgtatgtttctgcatagtaaaataaaagtggtaaatgcacctaaatttgtactggtctgtgtct aaaaatgtttttgctatacagtatttaaatgttgctactatttgtataaaatcaaaggcatttaatattttaaagagatg ttctttcatacagtttcaatatggtttaggtaggtacaaatagaagggcaaggaaaactgaaggaaattgtaaaaactaa ttctgtctgttcaattttgtacatataacttccctttgatttcttctgtattataaatctatgtaatgtgtttcatgtaa gtttaataaggaccatgattaactaaatatttttgagcattagctttaaaaaatagttttgtattttatattctaaatct acccagaatgctccaaatgctatattggaagaattcaatatgtgttttgtgatcaaccagtgaaatgctgaagtactgtg cctttgatgtttgaatttagttgctcattcacaattcaggcatgatacctttcactgaagagaagatgtaataaacttca tttaataggctttgaaataatggagtatctaaaatgttatttttgtcaataataacagtatacacgctattcagctcaag gctatttaggatagaataggataagtattttgaaataaaaaagaatctatagagaaaacatatagagtcttttgcatgta tggagccacatgtccagtttatatattcagtgcctcccacctattatattattaaaaaaacaaatgaaaagaattttagt ggctataaatcataacctttcactcacactatattcttattctagaagctttcaattatgacagataagttgctttattg taagtgcaatcaaagccatatagtcaaaaggtcagtgcattgcagaacacaaaaacgaaccgtaattatagtatctattt tctccagagtttaaatcctaggccccttttcttctatctgtttgtattaatggaaatgaggccattctcttcttagcctt gatagtaggagatatataattatatccccctcagagaaccactcaggtgcttatcttaatagcttcagccttaaaagtaa ccactataggtgcattgctataataatctgaagaagtgattttaaaaaggccagactgttataaacattgtggatatttt accattccgaaaattggcatatcttcatagagcttaccaagtcaagtcaaaatgtgcttccatttggcatgttagtagtt ttggccatgttcatgatacttaatatattggaatttgttctgttattattttgtatttactttactttgcctcaaacaac tttggtttggttaaatgtgatatttttcaagagtcccggtggcacagtggttataatgcagtattgcaggcaaacactgc ccacagcctggagttcaatcctgacggagggctcaaagttgacttagccttccattcttccaaagacagtaaaatgagaa ctcatagaccagggg |
|
| Transcript ID | habu1_s2069_g07561.t2 |
| Definition | - |
>habu1_s2069_g07561.t2 gcagaaattctctttcatagtgatttctgctgcttcattttcttccatctctcccaactggtatacatgcagatgttaaa acaaagtttgccttcccctttaactcctgggactctctgcagatcacattgaacattttaaaaattaaccaggaagcaac tcaatgcttcttcacaagcatggcatcttgaagtttattgcaacgttcgtttttacatttatttttttctttttatttac tttttagcatcatatgcactctttaagaagcattttggactaagtaatacagcttaatgctgatactagaacatatttta tcagagcaaagagtgaagtataatctttcatggaaaaatcattacttgtttctttatcttatctactttcaaatctgaaa acacttcccaactggaatgttctaattgtaaactgccatatatgcaatcttttcgtgacttcaaccctgttttaactatt taaaggaaaataagcttatgtaaatttgggctacagcaaaataaatttaagttttaaatgaaaaaatatatatgctattt aaatatgttctcaatttagatctaaataatggtaaaaatgctgtttataagcttatgtacttttaagatacttcttgtta ggcaagggcattcatttacattttactctggattactagaaaattaagcaattttaatgtgtcctacgtttacatttcat tggaacagtcacccattgtgaagactgagacagtcagttttggcagtgcttctacaggtgcagagaaattggaaatttct atgaaagaagtacctgttgtccatactgaaacaaaaactattacatatgaatcatctgaggtggattctagtgctgattc tgaaccaggagttctgatgagtgcacagactattacttctgaaactactagtactacaactactacacatatcaccaaaa cagtgaaaggaggcatttcagagacaagaattgaaaagcgaattgtgataacgggtgatgcagatattgaccatgatcag gcgctggctcaggcaattaaagaggccaaagagcagcaccctgacatgtcagtgaccaaagtagtggtacataaagagac agaaatcacaccagaagatggggaggattgactacaggattagagtagctttctatgaacttcatcactgggaatatcag agcctgtatggagtcttggttctaacccagctgacttgcatctctccagagaaattttcaatgtggaagattttgatttt aattgctaattaaggacactggcagaaattcccccagttacagcaatttgaatcagctttaataatctaataattgcatg aaacaacaaattacaaaaaagcagcatttttattttcctaaatcaactttacatctaaatggcacgttcatcaacagtta aaataattgtattatgctacacataaaacagctcatgcctttactattattgagagtctaaacacagtttcttggggtgc aaagttttgtttagggaaaatcaagatcacattacaatactagaagctgtacaggtactatatatatatgttttattaca ttagatgtgccaataacatactttattcaacaaataacttgaatcatatacttgttataatttggttttattcttgttct ataaacaatgctgaatctctaaccttatttaaatgcttataaaatatgctttgtttatctgatttgggacccttaatagc taatgatttttagaattgttaaagttagaaatcctgccgtcacttttctaaagtctcaatctataaatttgcattgtgat tattttgaagaaaatgtatattttccttagcatctcagatatgttcatcttgaaaacatgatttttcaaaaccaagtcct gtccactctcagacaaagaagtttcttttgcaagtctagtcagtgttccttacttaggtcagagttaagccttaaaccgt acagaacacttaaaaagcattatttcatttttattatcacatcagtttaaaaggatccaatgttctttatgctgtcagtt tcatcacaatacatggcgaatgtatgtttctgcatagtaaaataaaagtggtaaatgcacctaaatttgtactggtctgt gtctaaaaatgtttttgctatacagtatttaaatgttgctactatttgtataaaatcaaaggcatttaatattttaaaga gatgttctttcatacagtttcaatatggtttaggtaggtacaaatagaagggcaaggaaaactgaaggaaattgtaaaaa ctaattctgtctgttcaattttgtacatataacttccctttgatttcttctgtattataaatctatgtaatgtgtttcat gtaagtttaataaggaccatgattaactaaatatttttgagcattagctttaaaaaatagttttgtattttatattctaa atctacccagaatgctccaaatgctatattggaagaattcaatatgtgttttgtgatcaaccagtgaaatgctgaagtac tgtgcctttgatgtttgaatttagttgctcattcacaattcaggcatgatacctttcactgaagagaagatgtaataaac ttcatttaataggctttgaaataatggagtatctaaaatgttatttttgtcaataataacagtatacacgctattcagct caaggctatttaggatagaataggataagtattttgaaataaaaaagaatctatagagaaaacatatagagtcttttgca tgtatggagccacatgtccagtttatatattcagtgcctcccacctattatattattaaaaaaacaaatgaaaagaattt tagtggctataaatcataacctttcactcacactatattcttattctagaagctttcaattatgacagataagttgcttt attgtaagtgcaatcaaagccatatagtcaaaaggtcagtgcattgcagaacacaaaaacgaaccgtaattatagtatct attttctccagagtttaaatcctaggccccttttcttctatctgtttgtattaatggaaatgaggccattctcttcttag ccttgatagtaggagatatataattatatccccctcagagaaccactcaggtgcttatcttaatagcttcagccttaaaa gtaaccactataggtgcattgctataataatctgaagaagtgattttaaaaaggccagactgttataaacattgtggata ttttaccattccgaaaattggcatatcttcatagagcttaccaagtcaagtcaaaatgtgcttccatttggcatgttagt agttttggccatgttcatgatacttaatatattggaatttgttctgttattattttgtatttactttactttgcctcaaa caactttggtttggttaaatgtgatatttttcaagagtcccggtggcacagtggttataatgcagtattgcaggcaaaca ctgcccacagcctggagttcaatcctgacggagggctcaaagttgacttagccttccattcttccaaagacagtaaaatg agaactcatagaccagggg |
|
Protein
| Protein ID | habu1_s2069_g07561.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>habu1_s2069_g07561.t1 MVFNCRFYTLAFNINLPFLQRTETQTDQEKKAEEQQQEATKKVVQESLIVKEKHVMSLHASEDAAKLAGLQLDATAQTIS HVASSINGKEGSAITEGAKEEKAAIQQEETATISHDLQEEQSKSAHILNTQESKPLFESPIVKTETVSFGSASTGAEKLE ISMKEVPVVHTETKTITYESSEVDSSADSEPGVLMSAQTITSETTSTTTTTHITKTVKGGISETRIEKRIVITGDADIDH DQALAQAIKEAKEQHPDMSVTKVVVHKETEITPEDGED |
|
| Protein ID | habu1_s2069_g07561.t2 |
| Definition | - |
>habu1_s2069_g07561.t2 MSAQTITSETTSTTTTTHITKTVKGGISETRIEKRIVITGDADIDHDQALAQAIKEAKEQHPDMSVTKVVVHKETEITPE DGED |
|