Gene
| Gene Model ID | habu1_s2447_g08976 |
|---|---|
| Locus | habu1_scaffold2447 : 1174247 ... 1200635 : + |
| To GenomeBrowser | habu1_scaffold2447:1174247..1200635 |
| Genes list of scaffold | habu1_scaffold2447 |
Annotation by Blast2GO
| Annotation | GO |
|---|---|
| solute carrier family 7 member 13 isoform x4 | GO:0003333 GO:0015171 GO:0016021 |
Hmmer Search for Pfam
| query | Total | ID | Target | From | To | Eval | Score | cEval | iEval | Score |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| habu1_s2447_g08976.t3 | 1 | 1 | AA_permease_2 | 13 | 320 | 1.3e-36 | 126.0 | 2.4e-40 | 1.8e-36 | 125.6 |
| habu1_s2447_g08976.t3 | 1 | 1 | AA_permease | 24 | 311 | 4.1e-18 | 64.9 | 7.0e-22 | 5.2e-18 | 64.6 |
Expression profile
| Libraries | FPKM |
|---|---|
| >Adult | |
| Venom fang forming tissue | 0.1 |
| Venom grand-1 | 0.0 |
| Pit, infrared sensing | 0.1 |
| Nose | 0.6 |
| Brain-1 | 3.7 |
| Eye | 0.8 |
| fetal fibroblast | 0.0 |
| venom gland-2 | 0.0 |
| Brain-2 | 2.8 |
| Spleen | 0.4 |
| Lung | 0.0 |
| Liver | 0.0 |
| Kidney | 10.7 |
| Pancreas | 1.1 |
| Small intestine | 0.0 |
| Large intestine | 0.0 |
| Stomach | 0.0 |
| heart | 0.2 |
| ovary | 0.0 |
| cheek muscle | 0.0 |
Transcript
| Transcript ID | habu1_s2447_g08976.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>habu1_s2447_g08976.t1 gaaggaactgcggttggaagacggacgtaggaaaaaatttcgatatcccgtcatttctccaggggtggaagtgagaaaaa ttccctagaaagtttagaacaagggttctcaaccttggcaactttaagacttgtggacttcaactcccagaattcctcag ccagctttgctggctgaggagttctgggagttgaagtccacaagtcttaaagttgccaaggttgagaacccctggtttag aaagtgatttgcagttgtgaacgcatgataggaaagaagttaatcacagcactgccattttcaggaggggaatacagtta cataaaaagagcccttggctctccactggcttttatctttttatggacagccatgtttaatagaccagcctcgaatgctg ctcgagccttgttgttttccgaatatgccattcaacctttttatggacagtgcccagctcctgagatggcaaagaaaagt ttggcattggctgttctctggttccttgggattctcaatgggcgaagtgtcaagatggctgcctgggtgcagaccgtttt cacctttctcaagatgatggctctctccattattgcaattggtggaatagttctgttgatcagaggaaacaaaaagaaca cagctagatttgaaaatgctttcagttcagagattccagatgctgtgcagatctcagaagcatttttccaagggttgtat gcatatggtggctggtggtcactcagctacttggcagaggagattaaaaatccaagcagaaacattctttggactgtgat gactgcacttcctttaatcattattttctatttgctagttaacatttcatatctgacagttctcacaccacaggaaattg tttcctcagatctaattgctttaatgaattattttggattctccatttggcttatgactggactaacatgtgctagtgtc attgtcctccgatatcgagagcctgatctacacaggccatacaaggtttgtttaccagttgcctttggaatggtggccat ttctttgttcttagttttggttcctataatttggtctccgaaagtgcagtatttatatgctttccttttcatgatttcac tctttttcttaaattgtgctttcatgtaaacttaattcatcataaggagttcatgccaagagatggagccaaaaagacta catagtacaaagatgttgaggcctagtatgacttagataatagaatgatctctacatctttaacatttttatttgaaata agttacccaatctgttcaatatttctgggtttggtttttttgggtgaacagaaagttaaattttgagatcctaacacaat taaaagtcacaacaaatcacaccttaagccaggctcagtttctgaagagaaaatggttttattatctattgcactgtgag ccatacttggaacaaccactcttaaattcaaatggacattggtgattttacattttcaatgaagttctaaaatctgcaga gctgtacaataacctaaagaaagacatcatctaataatcttttttaagaggtaaggagtacacactgacaaataaacaac agcacaagattccctccccccctttgttttcagttgggaattagtaagccttgctaatgtatggcacaaataactgtcaa cagacttggactttctcttgcctctgacagctctaaactagtctttcacaaatgcctatcacaagaaaggtcatgctagc aagaaatcacaggagtcatggcctgccttgagagcaccaacgggagaaggcactctaaattcataccatagtatttcttg actgggtttgcagatttcactatataacaatatttttttaacattgccctactgtgttgtgttaaacaagccccattgtt ttgcaaaccatagtttattaattattaaatgactctgaacagctccccatatgcaaaaggacagcaatttcataaaagca aaccaacacacatctataaaacaataacctttcaaagaaaaagaagcattcatccctacctgactccaatttaaagaggc aattcatcttaatccatatcctgggaaagagccaggttttggtggccaaggtgaatctcaacagtgacaggtggaacaat agagatgtctacctccaagggcttcttggatgatgttgcttaatgaatgggacctaaagcaaaccaactttgttggaagg tacaggatgggagataagccatcctaagtagctaggcttacacaatagggatatgatgggatctgtatattcaggaaatt atggttaattcaatttatgcatgcttataataaagcagagtttagcaaagttagtgcatttctttcttttatacagacca ttacataatcatgaaaaacttaaaagattcccagataaaccataaatgaacactgcagtgctcatatgagccctaacata gatgaattattttagatttaaaaaaataatgtaattaaaataatatatttagtgggctggaataacagaaaatggtcaaa tatcacaagattataatgttactaactgaaaatttgcaagggatcaaaatgtttaacattaaaaaaaagaagtacctgtg ctagaaataggcaatattaaccctcccccccatccccagatcagtggagatatttagagtacaaacttggcacagtatgt aaacctagccatttttttttctttaatcagtctcttccactgaaatgctacactggatattttattgctccaatttttca gctaagtcttgctcagaacagcaccaaataattgcaactccggctgctatacgatactctgctagctcaattttttactg atgtcaaagtttgctagatgaaacaaagcaaataattaatattatttgcaacaattctttatattgtgaaaataactcca caaatctgttctccatctttgctctaggtacgagatagcaactatatactgtacatttcaattttttttgtttcactttg gcattagaatgactcattctgcctgaatggattgcatttttttaaaaattgctgttcaggagctggtgaactttccatct aacaaactattagatagaattttcttgtcaaaaccatccatgtacaattacatggctacttttcttccatctcatttctt ctagagttattgatctgctgctcttatataccatgttagaaatccagggtcaccaaaagcaaagctcctaataaatttgc ccacaagaccagaatca |
|
| Transcript ID | habu1_s2447_g08976.t2 |
| Definition | - |
>habu1_s2447_g08976.t2 gaaggaactgcggttggaagacggacgtaggaaaaaatttcgatatcccgtcatttctccaggggtggaagtgagaaaaa ttccctagaaagtttagaacaagggttctcaaccttggcaactttaagacttgtggacttcaactcccagaattcctcag ccagctttgctggctgaggagttctgggagttgaagtccacaagtcttaaagttgccaaggttgagaacccctggtttag aaagtgatttgcagttgtgaacgcatgataggaaagaagttaatcacagcactgccattttcaggaggggaatacagtta cataaaaagagcccttggctctccactggcttttatctttttatggacagccatgtttaatagaccagcctcgaatgctg ctcgagccttgttgttttccgaatatgccattcaacctttttatggacagtgcccagctcctgagatggcaaagaaaagt ttggcattggctgttctctggttccttgggattctcaatgggcgaagtgtcaagatggctgcctgggtgcagaccgtttt cacctttctcaagatgatggctctctccattattgcaattggtggaatagttctgttgatcagaggaaacaaaaagaaca cagctagatttgaaaatgctttcagttcagagattccagatgctgtgcagatctcagaagcatttttccaagggttgtat gcatatggtggctggtggtcactcagctacttggcagaggagattaaaaatccaagcagaaacattctttggactgtgat gactgcacttcctttaatcattattttctatttgctagttaacatttcatatctgacagttctcacaccacaggaaattg tttcctcagttgttgtagcagtcatatgggctgagagagtaatcccttcatttgcttggataattcctgtatctgtggct atttctatttttggtgccctcaacggcagcgtgttcactcttggacggttgagctatgctgcgagtcagtctggacactt gcccattatagtatccatgcttaatatccaccactctactccagcacccgccatgattttgtccaccattattgcaactg cttttctcatttcatcagatctaattgctttaatgaattattttggattctccatttggcttatgactggactaacatgt gctagtgtcattgtcctccgatatcgagagcctgatctacacaggccatacaaggtttgtttaccagttgcctttggaat ggtggccatttctttgttcttagttttggttcctataatttggtctccgaaagtgcagtatttatatgctttccttttca tgatttcactctttttcttaaattgtgctttcatgtaaacttaattcatcataaggagttcatgccaagagatggagcca aaaagactacatagtacaaagatgttgaggcctagtatgacttagataatagaatgatctctacatctttaacattttta tttgaaataagttacccaatctgttcaatatttctgggtttggtttttttgggtgaacagaaagttaaattttgagatcc taacacaattaaaagtcacaacaaatcacaccttaagccaggctcagtttctgaagagaaaatggttttattatctattg cactgtgagccatacttggaacaaccactcttaaattcaaatggacattggtgattttacattttcaatgaagttctaaa atctgcagagctgtacaataacctaaagaaagacatcatctaataatcttttttaagaggtaaggagtacacactgacaa ataaacaacagcacaagattccctccccccctttgttttcagttgggaattagtaagccttgctaatgtatggcacaaat aactgtcaacagacttggactttctcttgcctctgacagctctaaactagtctttcacaaatgcctatcacaagaaaggt catgctagcaagaaatcacaggagtcatggcctgccttgagagcaccaacgggagaaggcactctaaattcataccatag tatttcttgactgggtttgcagatttcactatataacaatatttttttaacattgccctactgtgttgtgttaaacaagc cccattgttttgcaaaccatagtttattaattattaaatgactctgaacagctccccatatgcaaaaggacagcaatttc ataaaagcaaaccaacacacatctataaaacaataacctttcaaagaaaaagaagcattcatccctacctgactccaatt taaagaggcaattcatcttaatccatatcctgggaaagagccaggttttggtggccaaggtgaatctcaacagtgacagg tggaacaatagagatgtctacctccaagggcttcttggatgatgttgcttaatgaatgggacctaaagcaaaccaacttt gttggaaggtacaggatgggagataagccatcctaagtagctaggcttacacaatagggatatgatgggatctgtatatt caggaaattatggttaattcaatttatgcatgcttataataaagcagagtttagcaaagttagtgcatttctttctttta tacagaccattacataatcatgaaaaacttaaaagattcccagataaaccataaatgaacactgcagtgctcatatgagc cctaacatagatgaattattttagatttaaaaaaataatgtaattaaaataatatatttagtgggctggaataacagaaa atggtcaaatatcacaagattataatgttactaactgaaaatttgcaagggatcaaaatgtttaacattaaaaaaaagaa gtacctgtgctagaaataggcaatattaaccctcccccccatccccagatcagtggagatatttagagtacaaacttggc acagtatgtaaacctagccatttttttttctttaatcagtctcttccactgaaatgctacactggatattttattgctcc aatttttcagctaagtcttgctcagaacagcaccaaataattgcaactccggctgctatacgatactctgctagctcaat tttttactgatgtcaaagtttgctagatgaaacaaagcaaataattaatattatttgcaacaattctttatattgtgaaa ataactccacaaatctgttctccatctttgctctaggtacgagatagcaactatatactgtacatttcaattttttttgt ttcactttggcattagaatgactcattctgcctgaatggattgcatttttttaaaaattgctgttcaggagctggtgaac tttccatctaacaaactattagatagaattttcttgtcaaaaccatccatgtacaattacatggctacttttcttccatc tcatttcttctagagttattgatctgctgctcttatataccatgttagaaatccagggtcaccaaaagcaaagctcctaa taaatttgcccacaagaccagaatca |
|
| Transcript ID | habu1_s2447_g08976.t3 |
| Definition | - |
>habu1_s2447_g08976.t3 gaaggaactgcggttggaagacggacgtaggaaaaaatttcgatatcccgtcatttctccaggggtggaagtgagaaaaa ttccctagaaagtttagaacaagggttctcaaccttggcaactttaagacttgtggacttcaactcccagaattcctcag ccagctttgctggctgaggagttctgggagttgaagtccacaagtcttaaagttgccaaggttgagaacccctggtttag aaagtgatttgcagttgtgaacgcatgataggaaagaagttaatcacagcactgccattttcaggaggggaatacagtta cataaaaagagcccttggctctccactggcttttatctttttatggacagccatgtttaatagaccagcctcgaatgctg ctcgagccttgttgttttccgaatatgccattcaacctttttatggacagtgcccagctcctgagatggcaaagaaaagt ttggcattggctgttctctggttccttgggattctcaatgggcgaagtgtcaagatggctgcctgggtgcagaccgtttt cacctttctcaagatgatggctctctccattattgcaattggtggaatagttctgttgatcagaggaaacaaaaagaaca cagctagatttgaaaatgctttcagttcagagattccagatgctgtgcagatctcagaagcatttttccaagggttgtat gcatatggtggctggtggtcactcagctacttggcagaggagattaaaaatccaagcagaaacattctttggactgtgat gactgcacttcctttaatcattattttctatttgctagttaacatttcatatctgacagttctcacaccacaggaaattg tttcctcagttgttgtagcagtcatatgggctgagagagtaatcccttcatttgcttggataattcctgtatctgtggct atttctatttttggtgccctcaacggcagcgtgttcactcttggacggttgagctatgctgcgagtcagtctggacactt gcccattatagtatccatgcttaatatccaccactctactccagcacccgccatgattttgtccaccattattgcaactg cttttctcatttcatcagatctaattgctttaatgaattattttggattctccatttggcttatgactggactaacatgt gctagtgtcattgtcctccgatatcgagagcctgatctacacaggccatacaaggtttgtttaccagttgcctttggaat ggtggccatttctttgttcttagttttggttcctataatttggtctccgaaagtgcagtatttatatgctttccttttca tgatttcactctttttcttaaattgtgctttcatgtaaacttaattcatcataaggagttcatgccaagagatggagcca aaaagactacatagtacaaagatgttgaggcctagtatgacttagataatagaatgatctctacatctttaacattttta tttgaaataagttacccaatctgttcaatatttctgggtttggtttttttgggtgaacagaaagttaaattttgagatcc taacacaattaaaagtcacaacaaatcacaccttaagccaggctcagtttctgaagagaaaatggttttattatctattg cactgtgagccatacttggaacaaccactcttaaattcaaatggacattggtgattttacattttcaatgaagttctaaa atctgcagagctgtacaataacctaaagaaagacatcatctaataatcttttttaagaggtaaggagtacacactgacaa ataaacaacagcacaagattccctccccccctttgttttcagttgggaattagtaagccttgctaatgtatggcacaaat aactgtcaacagacttggactttctcttgcctctgacagctctaaactagtctttcacaaatgcctatcacaagaaaggt catgctagcaagaaatcacaggagtcatggcctgccttgagagcaccaacgggagaaggcactctaaattcataccatag tatttcttgactgggtttgcagatttcactatataacaatatttttttaacattgccctactgtgttgtgttaaacaagc cccattgttttgcaaaccatagtttattaattattaaatgactctgaacagctccccatatgcaaaaggacagcaatttc ataaaagcaaaccaacacacatctataaaacaataacctttcaaagaaaaagaagcattcatccctacctgactccaatt taaagaggcaattcatcttaatccatatcctgggaaagagccaggttttggtggccaaggtgaatctcaacagtgacagg tggaacaatagagatgtctacctccaagggcttcttggatgatgttgcttaatgaatgggacctaaagcaaaccaacttt gttggaaggtacaggatgggagataagccatcctaagtagctaggcttacacaatagggatatgatgggatctgtatatt caggaaattatggttaattcaatttatgcatgcttataataaagcagagtttagcaaagttagtgcatttctttctttta tacagaccattacataatcatgaaaaacttaaaagattcccagataaaccataaatgaacactgcagtgctcatatgagc cctaacatagatgaattattttagatttaaaaaaataatgtaattaaaataatatatttagtgggctggaataacagaaa atggtcaaatatcacaagattataatgttactaactgaaaatttgcaagggatcaaaatgtttaacattaaaaaaaagaa gtacctgtgctagaaataggcaatattaaccctcccccccatccccagatcagtggagatatttagagtacaaacttggc acagtatgtaaacctagccatttttttttctttaatcagtctcttccactgaaatgctacactggatattttattgctcc aatttttcagctaagtcttgctcagaacagcaccaaataattgcaactccggctgctatacgatactctgctagctcaat tttttactgatgtcaaagtttgctagatgaaacaaagcaaataattaatattatttgcaacaattctttatattgtgaaa ataactccacaaatctgttctccatctttgctctaggtacgagatagcaactatatactgtacatttcaattttttttgt ttcactttggcattagaatgactcattctgcctgaatggattgcatttttttaaaaattgctgttcaggagctggtgaac tttccatctaacaaactattagatagaattttcttgtcaaaaccatccatgtacaattacatggctacttttcttccatc tcatttcttctagagttattgatctgctgctcttatataccatgttagaaatccagggtcaccaaaagcaaagctcctaa taaatttgcccacaagaccagaatcaaaatggtgacaagggagatatgccacttttctgcatggtggattttgtatttaa aaagaaagtgaaaatttgacataaatgtgcagataatcagaggagctagtctaaaaggtgatccgtgcttgaaatcagtg taattgattttatcaagtttgctttcaaaacctaacctggatttccaatactttccaaaatgcttccttaaataacaatg cttgctggacctaccatcttcttgatatggtacattgatgttaagattcattaatctgaaatatctatatctatatatca tttgtttcttatgcagaatgtgaaaaatatgtaatcaatttgaagcattatatcacagtgagaaattactgctgcaactg tgcaacattttggcctcagtggctaaaagatattttgcagctatcagatcaggagacatgaatgttgtatctctctgcaa cttccaaaagcagctgtgattttcctagaattttgtaattctagtagaatttggctagaatttaggcttacactaataaa gccttttaaactgttttaatta |
|
Protein
| Protein ID | habu1_s2447_g08976.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>habu1_s2447_g08976.t1 MFNRPASNAARALLFSEYAIQPFYGQCPAPEMAKKSLALAVLWFLGILNGRSVKMAAWVQTVFTFLKMMALSIIAIGGIV LLIRGNKKNTARFENAFSSEIPDAVQISEAFFQGLYAYGGWWSLSYLAEEIKNPSRNILWTVMTALPLIIIFYLLVNISY LTVLTPQEIVSSDLIALMNYFGFSIWLMTGLTCASVIVLRYREPDLHRPYKVCLPVAFGMVAISLFLVLVPIIWSPKVQY LYAFLFMISLFFLNCAFM |
|
| Protein ID | habu1_s2447_g08976.t2 |
| Definition | - |
>habu1_s2447_g08976.t2 MFNRPASNAARALLFSEYAIQPFYGQCPAPEMAKKSLALAVLWFLGILNGRSVKMAAWVQTVFTFLKMMALSIIAIGGIV LLIRGNKKNTARFENAFSSEIPDAVQISEAFFQGLYAYGGWWSLSYLAEEIKNPSRNILWTVMTALPLIIIFYLLVNISY LTVLTPQEIVSSVVVAVIWAERVIPSFAWIIPVSVAISIFGALNGSVFTLGRLSYAASQSGHLPIIVSMLNIHHSTPAPA MILSTIIATAFLISSDLIALMNYFGFSIWLMTGLTCASVIVLRYREPDLHRPYKVCLPVAFGMVAISLFLVLVPIIWSPK VQYLYAFLFMISLFFLNCAFM |
|
| Protein ID | habu1_s2447_g08976.t3 |
| Definition | - |
>habu1_s2447_g08976.t3 MFNRPASNAARALLFSEYAIQPFYGQCPAPEMAKKSLALAVLWFLGILNGRSVKMAAWVQTVFTFLKMMALSIIAIGGIV LLIRGNKKNTARFENAFSSEIPDAVQISEAFFQGLYAYGGWWSLSYLAEEIKNPSRNILWTVMTALPLIIIFYLLVNISY LTVLTPQEIVSSVVVAVIWAERVIPSFAWIIPVSVAISIFGALNGSVFTLGRLSYAASQSGHLPIIVSMLNIHHSTPAPA MILSTIIATAFLISSDLIALMNYFGFSIWLMTGLTCASVIVLRYREPDLHRPYKVCLPVAFGMVAISLFLVLVPIIWSPK VQYLYAFLFMISLFFLNCAFM |
|