Protobothrops flavoviridis ver. 1.0

OIST Marine Genomics Unit since 2008

Gene
Gene Model IDhabu1_s2598_g09411
Locus habu1_scaffold2598 : 2994125 ... 3077153 : -
To GenomeBrowser habu1_scaffold2598:2994125..3077153
Genes list of scaffold habu1_scaffold2598

Annotation by Blast2GO
Annotation GO
arylsulfatase g isoform x1 EC:3.1.6.0 GO:0005615 GO:0005764 GO:0005783 GO:0006790 GO:0008484

Hmmer Search for Pfam
query Total ID Target From To Eval Score cEval iEval Score
habu1_s2598_g09411.t3 1 1 Sulfatase 39 380 0.0 208.3 0.0 0.0 208.0
habu1_s2598_g09411.t3 1 1 Sulfatase_C 406 525 4.0e-18 65.9 1.6e-21 8.0e-18 65.0

Expression profile
Libraries FPKM
>Adult
Venom fang forming tissue 7.5
Venom grand-1 8.6
Pit, infrared sensing 6.7
Nose 7.2
Brain-1 3.4
Eye 5.1
fetal fibroblast 9.1
venom gland-2 17.0
Brain-2 3.2
Spleen 5.1
Lung 7.2
Liver 6.6
Kidney 8.0
Pancreas 8.1
Small intestine 5.7
Large intestine 4.6
Stomach 5.3
heart 3.3
ovary 10.2
cheek muscle 3.1

Transcript
Transcript IDhabu1_s2598_g09411.t1
Definition-
>habu1_s2598_g09411.t1
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Definition-
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Protein
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