Gene
| Gene Model ID | habu1_s3002_g10677 |
|---|---|
| Locus | habu1_scaffold3002 : 545928 ... 577196 : + |
| To GenomeBrowser | habu1_scaffold3002:545928..577196 |
| Genes list of scaffold | habu1_scaffold3002 |
Annotation by Blast2GO
| Annotation | GO |
|---|---|
| arf-gap domain and fg repeat-containing protein 1 isoform x8 | GO:0044464 GO:1902589 |
Hmmer Search for Pfam
| query | Total | ID | Target | From | To | Eval | Score | cEval | iEval | Score |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| habu1_s3002_g10677.t3 | 1 | 1 | ArfGap | 16 | 127 | 8.0e-29 | 99.7 | 2.6e-32 | 2.0e-28 | 98.5 |
Blast Hit to nr / sp
| query | Subject ID | Subject Name | evalue |
|---|---|---|---|
| habu1_s3002_g10677.t3 | gi|602627122|ref|XP_007420510.1| | PREDICTED: arf-GAP domain and FG repeat-containing protein 1 isoform X5 [Python bivittatus] | 0.0 |
| habu1_s3002_g10677.t3 | gi|637276964|ref|XP_008104446.1| | PREDICTED: arf-GAP domain and FG repeat-containing protein 1 isoform X3 [Anolis carolinensis] | 0.0 |
| habu1_s3002_g10677.t3 | gi|637276960|ref|XP_008104445.1| | PREDICTED: arf-GAP domain and FG repeat-containing protein 1 isoform X2 [Anolis carolinensis] | 0.0 |
Expression profile
| Libraries | FPKM |
|---|---|
| >Adult | |
| Venom fang forming tissue | 3.4 |
| Venom grand-1 | 2.7 |
| Pit, infrared sensing | 3.7 |
| Nose | 3.4 |
| Brain-1 | 2.6 |
| Eye | 3.3 |
| fetal fibroblast | 8.4 |
| venom gland-2 | 4.5 |
| Brain-2 | 2.9 |
| Spleen | 2.8 |
| Lung | 5.4 |
| Liver | 4.1 |
| Kidney | 1.9 |
| Pancreas | 2.0 |
| Small intestine | 3.4 |
| Large intestine | 2.4 |
| Stomach | 3.5 |
| heart | 4.4 |
| ovary | 22.7 |
| cheek muscle | 6.6 |
Transcript
| Transcript ID | habu1_s3002_g10677.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
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| Transcript ID | habu1_s3002_g10677.t2 |
| Definition | - |
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|
| Transcript ID | habu1_s3002_g10677.t3 |
| Definition | - |
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|
Protein
| Protein ID | habu1_s3002_g10677.t1 |
|---|---|
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| Protein ID | habu1_s3002_g10677.t2 |
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| Protein ID | habu1_s3002_g10677.t3 |
| Definition | - |
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