Protobothrops flavoviridis ver. 1.0

OIST Marine Genomics Unit since 2008

Gene
Gene Model IDhabu1_s3103_g10901
Locus habu1_scaffold3103 : 303249 ... 326315 : -
To GenomeBrowser habu1_scaffold3103:303249..326315
Genes list of scaffold habu1_scaffold3103

Annotation by Blast2GO
Annotation GO
m7 -mrna hydrolase isoform x1 GO:0000956 GO:0005488 GO:0016787 GO:0030529 GO:0043229

Hmmer Search for Pfam
query Total ID Target From To Eval Score cEval iEval Score
habu1_s3103_g10901.t3 1 1 NUDIX 26 131 1.8e-15 56.8 2.4e-19 3.6e-15 55.7

Expression profile
Libraries FPKM
>Adult
Venom fang forming tissue 6.5
Venom grand-1 2.8
Pit, infrared sensing 5.2
Nose 3.5
Brain-1 15.6
Eye 6.0
fetal fibroblast 12.0
venom gland-2 3.4
Brain-2 11.9
Spleen 5.5
Lung 2.4
Liver 5.0
Kidney 2.2
Pancreas 2.8
Small intestine 3.8
Large intestine 3.2
Stomach 4.0
heart 7.2
ovary 32.1
cheek muscle 5.5

Transcript
Transcript IDhabu1_s3103_g10901.t1
Definition-
>habu1_s3103_g10901.t1
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Definition-
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Transcript IDhabu1_s3103_g10901.t3
Definition-
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Protein
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Definition-
>habu1_s3103_g10901.t1
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CEKKHSRKLQDNFETETAYDLCCLSEDQQLDRGQSVSCNGHCKFSFSSRAFLSFKFDHDAIMKNFDF
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Definition-
>habu1_s3103_g10901.t2
MTCAGEDVQKVLDEWKEYKMGVPTYGAIILDETLDNVLLVQGYLAKSGWGFPKGKVNKEEAPHDCAAREVFEETGFDIKD
YINKDDYIELRINDQLARLYIIPGIPKDTKFNPKTRREIRNIEWFSIDKLPCHRNDMTPKSKLGLAPNKFFMTIPFIRPL
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Definition-
>habu1_s3103_g10901.t3
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