Gene
| Gene Model ID | habu1_s3695_g12423 |
|---|---|
| Locus | habu1_scaffold3695 : 104646 ... 138191 : + |
| To GenomeBrowser | habu1_scaffold3695:104646..138191 |
| Genes list of scaffold | habu1_scaffold3695 |
Hmmer Search for Pfam
| query | Total | ID | Target | From | To | Eval | Score | cEval | iEval | Score |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| habu1_s3695_g12423.t4 | 1 | 1 | Foie-gras_1 | 247 | 505 | 0.0 | 253.5 | 0.0 | 0.0 | 252.8 |
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| habu1_s3695_g12423.t4 | 1 | 1 | Gryzun-like | 1019 | 1079 | 1.4e-25 | 88.8 | 2.7e-28 | 6.7e-25 | 86.6 |
Expression profile
| Libraries | FPKM |
|---|---|
| >Adult | |
| Venom fang forming tissue | 7.8 |
| Venom grand-1 | 13.3 |
| Pit, infrared sensing | 7.4 |
| Nose | 7.6 |
| Brain-1 | 12.1 |
| Eye | 8.4 |
| fetal fibroblast | 12.4 |
| venom gland-2 | 25.2 |
| Brain-2 | 11.7 |
| Spleen | 7.8 |
| Lung | 7.4 |
| Liver | 11.8 |
| Kidney | 8.4 |
| Pancreas | 10.1 |
| Small intestine | 7.2 |
| Large intestine | 7.0 |
| Stomach | 7.3 |
| heart | 14.8 |
| ovary | 23.2 |
| cheek muscle | 12.3 |
Transcript
| Transcript ID | habu1_s3695_g12423.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
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| Transcript ID | habu1_s3695_g12423.t2 |
| Definition | - |
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| Transcript ID | habu1_s3695_g12423.t4 |
| Definition | - |
>habu1_s3695_g12423.t4 acttgaagattttaataaaagcgtttcagactatatttggaaccatcaatatgagcccttcacagtgggattttccagtg gaattatgttgccgaccaatggcctttgttacactcactggtttggatgttgtatataatgctgttcatcgagctgtctg ggatgccttttgtgcaaataggagagcagacagagtaccaatttcttttaaagtacttcccggtgatcatgaatatccca aatgcagagtaaagagattgtcatatgaatggtacattccaaaaggtatcctgaaaacaggttggatgaacaaacatctg aatttggttcctgcgcttgttgtggtattttatgaactagattgggatgagccacagtggaaagaaaaacaatcagaatg tgctactagagttgaaattgtcaggcagagtttgcagggccgaaacacaaaagttgctgtagttttaattcagaagaaaa cccccttacctccaggagaagatgttattgcttcagaaagggcagcagctttatgtaatgcttgtgacctctctggaaag tccctgtttgttttgccacacactgatcatcttgtaggttacattataaggttagaaaatgctttctatgaacatgctca gacctattactacacagaaatacgaagagtaaaatctcataaagaatatttgaacaaaacaacacatcagcttttgtttg ttagacaccagttcaaaatagcattcttcagtgagttgaagcaagacacattaaatgctctaaaaaactacaaaactgcc tttaatcttgtacatgaattgagagctcatgaaacaaacatgctggaaatcaaaactatggcaggatttataaattacaa gatctgtcgcctgtgttttcagcataatacacccctggatgcaattgaacagtttaggaaacatatagatctatgcaaga aaaaaataggaagtgcagagttggcttttgagcatgctgcctggatgtcaaaacaatttcaggcttttggagatctattt gatgaagctattaagctagggttgacagctattcaaacacaaaacccaggtttctattatcagcaggcagcatattatgc acaagaacggaagcaactggcaaatgttctctgcgatcatgagtcttctgtgatatatcctaatccggatccattagaaa caccaactggaatgcttgacttctatggacaaagaccatggagacagggaatactaagttttgatcttaatgatcctgaa aaggagaaagtgggaatcttggcactgcaactgaaagagaagaaagttctccattctgagctaataatcaccttgttgag taacgcagttacgcaattcaagagatacaagtgtccgagaatgaaaagtcacttgatggttcagatgggtgaagaatatt attatgctaaagattacaccaaagctttgaagctccttgactatgttttgtgtgattaccgtagtgaaggctggtggact ctcctgacttctatactgtccactgctcttaaatgttcctatctaatggcccaaataaaagattatattacatactcatt agagcttctgggcagagcatctactttgaaagaagatcagaaatctcgaatagaaaagaatctgatcaaagttcttatga atgagaatccagatcctgaatctgactgtgatgctacttctgtaaaaactgcacagaaattgtgggctgatagagtatcc ctgggaggcaacaacatctttacaatagaagtacaagattttgttccttttgtgcagtgtaaagctaaatttcttgctcc aagttttcatgttgatgtaccaattcagtttgatgtatatttgaaagctgactgcctgcatcctctccagttttctaagt tgtgcgtcaatttcagtaatcaggaatacaatcagtattgcacggtggaagaaaactatccaaaatgtgacatcctagaa ccatctacacagggaacattgtgtcttatccctggtaagacaaaaaagttcactttcaaatttgtggcaaaaacagaaga cgtcgggaaaaaaattgagattacctcagtggacttaattctgggtagtgaaaatggcaggtgtgtggtcttgaactggc atggaggagggggtgatgctgctgcttctcgagaagcagttctggcagctcgttccttcaaaagacgacccaaacttcca gataatgaggttcactgggatagccttacaattcaggcaagcactatgatcatttctagagtgcctaacatttctgtcca gctcagtcatgaaccccctgccctaatgaatgaaatgtattgtttgagtgtgacaatcgagtcgcatgagaagacagttg ccaaagatgtaaagctcacagctggcttaaaaccaggccaagatgcaaatttgactcaaaaaacacatgtaactctgaat ggaacagaaatgtgtgatgattcctaccctgccttgcttcctgatatccctctgggagacctgcagccaggtgaaaagtt ggaaaaaattatatatattcattgtggaacagttggtactaggatgtttcttgtgtatgtttcttacctggtgaatgcag tcattgaaagaaaagaaattctttgcaggtgtcacagggatgagacagttactattgagacagtattcccttttgatgta gctgttaaatttgtctcaactaagtttgagcatttagataaagtcttcaccgacgtaccatttttactgatgacagacat cctcagtgcttcaccctgggcccttactattgtaaccagccagttgcagcttgcttcttcagtggttccagtggaccaat tagagtcctgtgtggaaaatgttgttttacagacaggtgaaagtgctagtgaatgcttttgccttcgttgtccaccagtt actactggtcaaggtggagttgctactggatgttatgtaatctcctggaaaaggagctcagctatggagaacatacctgt agttagtactttgatcacgctgccacatgtgatcactgaaggtatcccactccatgttaatgcagatttgccaccatttg gtcgagtcagagaatccttacctgtaaaatttcatctgcggaataagactaatttagtgcaagatgtagaagtaacagtg gaacctagtgatgccttcatgttttctggtcttaagcagataagactgagaatccttcctggcactgaacaagaaatgtt atacaacttctatcctcttatggctggatatcagcagctgccatctctcaacatcagtctgctacgatttccacagttta ctaaccaactgcttagaaaatttataccaacacacatcttcgtcaagccacagggccgtcaattggacgatgcatctatt gctgctgcataactgaagattcatgcacaaaggaagcagttttgcacagaatttatagtagcttttccctccaaactttt gcttgtcttaagctacaagtaaaattgctttatatttagattggttaaaaaatgtggaatgaactaagtgtcctgtggac ttgattgtaataattaaatatataaaatatataaaaaaataagggttttctttatcattgactttcctgaaattaagtga atggaatattttgataacatgggtgaaattactaaaagaaaatatgaaatgttggcttaaaaaacagaagtctgatgctt ttgttctagtaactgatttcactaccatcacaaatactttagcattgacattttatgcttacagaatccaattttatata atatattatgaatatcaaatatattcatatatttgaaataaataacagtatttatacacattcttccttcttagtaggct ctggctattcatatgatgagttgctatgttaaatcatctgcattgtcattttgtacttttgagaggccagttaatacttg ttggctctgggtgaaactgctttagacacattttctcttccatagttaggaggagggagtgatattatttagtttaaaga aattactccgtaaaatactgagaagcttatggtcctttagaaaaaaaatataataaagtttgccataggaagaaacatat atgttgtcattaaatattgttataaacaacttgtatataagaaatgcttcttgtggaactgtcccattgccattgtagat tttttggagtaggctgaagttgtcaatattttttttaaataatttacagcaagtctaacatggaatgtttcaaaaacggg ctgctaaatatgaattgcaggccattttagaaaaaagctttgtatgctacaggaatatccaccaatcatttagtggtaaa acttttgcttaatcaggacccattcctttattagttttttcaacatgcaattatcagataagaagaattcatcctatcaa tgtggatataacatggtgttcttaatattcatattaaatcatgtaaatacctgttttgtgaatgctcttctattgtttaa taaattaatttaagctttagtttctg |
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Protein
| Protein ID | habu1_s3695_g12423.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
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| Protein ID | habu1_s3695_g12423.t2 |
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| Protein ID | habu1_s3695_g12423.t3 |
| Definition | - |
>habu1_s3695_g12423.t3 MAFVTLTGLDVVYNAVHRAVWDAFCANRRADRVPISFKVLPGDHEYPKCRVKRLSYEWYIPKGILKTGWMNKHLNLVPAL VVVFYELDWDEPQWKEKQSECATRVEIVRQSLQGRNTKVAVVLIQKKTPLPPGEDVIASERAAALCNACDLSGKSLFVLP HTDHLVGYIIRLENAFYEHAQTYYYTEIRRVKSHKEYLNKTTHQLLFVRHQFKIAFFSELKQDTLNALKNYKTAFNLVHE LRAHETNMLEIKTMAGFINYKICRLCFQHNTPLDAIEQFRKHIDLCKKKIGSAELAFEHAAWMSKQFQAFGDLFDEAIKL GLTAIQTQNPGFYYQQAAYYAQERKQLANVLCDHESSVIYPNPDPLETPTGMLDFYGQRPWRQGILSFDLNDPEKEKVGI LALQLKEKKVLHSELIITLLSNAVTQFKRYKCPRMKSHLMVQMGEEYYYAKDYTKALKLLDYVLCDYRSEGWWTLLTSIL STALKCSYLMAQIKDYITYSLELLGRASTLKEDQKSRIEKNLIKVLMNENPDPESDCDATSVKTAQKLWADRVSLGGNNI FTIEVQDFVPFVQCKAKFLAPSFHVDVPIQFDVYLKADCLHPLQFSKLCVNFSNQEYNQYCTVEENYPKCDILEPSTQGT LCLIPGKTKKFTFKFVAKTEDVGKKIEITSVDLILGSENGRCVVLNWHGGGGDAAASREAVLAARSFKRRPKLPDNEVHW DSLTIQASTMIISRVPNISVQLSHEPPALMNEMYCLSVTIESHEKTVAKDVKLTAGLKPGQDANLTQKTHVTLNGTEMCD DSYPALLPDIPLGDLQPGEKLEKIIYIHCGTVGTRMFLVYVSYLVNAVIERKEILCRCHRDETVTIETVFPFDVAVKFVS TKFEHLDKVFTDVPFLLMTDILSASPWALTIVTSQLQLASSVVPVDQLESCVENVVLQTGESASECFCLRCPPVTTGQGG VATGCYVISWKRSSAMENIPVVSTLITLPHVITEGIPLHVNADLPPFGRVRESLPVKFHLRNKTNLVQDVEVTVEPSDAF MFSGLKQIRLRILPGTEQEMLYNFYPLMAGYQQLPSLNISLLRFPQFTNQLLRKFIPTHIFVKPQGRQLDDASIAAA |
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| Protein ID | habu1_s3695_g12423.t4 |
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