Protobothrops flavoviridis ver. 1.0

OIST Marine Genomics Unit since 2008

Gene
Gene Model IDhabu1_s4907_g14943
Locus habu1_scaffold4907 : 370121 ... 379693 : +
To GenomeBrowser habu1_scaffold4907:370121..379693
Genes list of scaffold habu1_scaffold4907

Annotation by Blast2GO
Annotation GO
heterogeneous nuclear ribonucleoprotein h GO:0000166 GO:0003676 GO:0019013 GO:0030529

Hmmer Search for Pfam
query Total ID Target From To Eval Score cEval iEval Score
habu1_s4907_g14943.t7 1 1 zf-RNPHF 54 82 3.2e-14 52.1 7.1e-17 2.6e-13 49.1
habu1_s4907_g14943.t7 1 1 RRM_6 83 150 6.7e-13 48.4 2.7e-16 1.0e-12 47.8
habu1_s4907_g14943.t7 1 1 RRM_1 85 147 2.9e-09 36.4 1.4e-12 5.0e-09 35.6

Expression profile
Libraries FPKM
>Adult
Venom fang forming tissue 150.4
Venom grand-1 221.9
Pit, infrared sensing 167.6
Nose 151.4
Brain-1 109.3
Eye 158.2
fetal fibroblast 199.5
venom gland-2 259.7
Brain-2 103.0
Spleen 240.8
Lung 209.8
Liver 208.3
Kidney 163.4
Pancreas 194.5
Small intestine 212.6
Large intestine 203.6
Stomach 186.2
heart 173.4
ovary 102.2
cheek muscle 112.1

Transcript
Transcript IDhabu1_s4907_g14943.t1
Definition-
>habu1_s4907_g14943.t1
gatttgagtaaacttccaagtcgccgcccatttctcgaagtgtagttttatagagccgccatttttcccctcgtttttat
actttcgcaattctttttctctggaggataaaaaaaaaatctacctagttttctatataggggataaaagtgctgttctg
ggttttgagcgcagtgttaaaggtacttgaaagtcttaaaatttgttgcgtgtgcttaatagatccgttcggtatttgta
gttgtatgtgaatgtagttgcgaagtctcgagatctgataatttcctattctgagaagttagcgattggcccgagtgtgt
taaaacttgctttaagcggaggttagaataaaaaggtaaatgcagctttgatgaaaggctatggatgcgtttgtttgagc
agcagagagtacccaaaatttgagttttgcgacaggaaaaaaacctggcgggctttgtcctcaagagctgcgcgagtggt
tttccctgtctagcaggctgcacgcagtgggagcgatgatatgattgcaggaacaaatatatgctacaataaggagaagt
aactctagtttaattccgggaagctttatttcgaattatattcagcagggccttctttctcaagtaaaaccgacttcgga
tttgtgctgtggaggttagggtggggcttaaagatggaagggggggaagggaagaaacaaccttcaggacgcatgcgcac
tatgggaggtaatgtacgcgcgtgcgttttgggctccattttcagccacgccgcggccgacttagaagaaggtgagctta
cttttagtttagttattggttggtcgcagactagttcgaaggacttctgaatttgggatccatctcttcagccggttgtt
ctcttcaggttactagcagcagtcgaagcgcgttttttgaggtgaaagcggcactagggcctggccgagcggaaacgcat
tactcgttcgccgccatttcctaagaacgcagcgcgtaccgctacagccgcccggctttctgtgtttggagaggtgaagt
gacaattcaaaccgtctccagtgtcctggacgaggatatcggtcgccatgtgtacgtgggcaacagaaggcgaaactgag
accacactcgcttctagcatgatgttgaacacggaaggcggtgagggttatgtcgtaaaagtgcgcggattgccctggtc
ctgctctgcagatgaagtgcaaagatttttctctgaatgcaaaatactaaatggatcttcaggggtccgttttatttaca
caagagaaggacgaccaagtggagaagcatttgttgaattggaaacggaagaagatgtgaaattggcattgaaaaaagac
agagaaacaatgggacacagatatgttgaagtcttcaagtcaaacaacgttgaaatggattgggttctgaagcatactgg
tcctaacagccctgatactgctaatgatggttttgtacgtcttagaggacttccatttggttgtagcaaagaagaaattg
ttcagtttttctcagggttggaaatcgtgccaaatgggataacattgccggtggacttccaggggaggagtacgggggag
gccttcgtgcagtttgcttcacaggaaatagctgaaaaggctctaaagaaacacaaggaaagaatagggcacaggtgggg
atggatggttggttggatatgtcgctcttcttatggtaaactgttgttaaatccatattctctcttcttaagtgctcact
ttacaatatacactttcatattctaacacctcctttgttttcataaatattactttcttttaattcatatgcagactggc
tgatgtgcttgttttgctcttccctatttcacattaccttgttaattctgatttagtttaaagttatttacggaagttga
gagattatggctttacatttctttaatagcaccaattatgcctctagttctacatacacatagccttttattaccataag
aaaatgtgattactgaacttgttctatacaatgatgtaacattttcttgtgtaattttcacataaaaaaattaacttcca
aaaatgtc
Transcript IDhabu1_s4907_g14943.t2
Definition-
>habu1_s4907_g14943.t2
gatttgagtaaacttccaagtcgccgcccatttctcgaagtgtagttttatagagccgccatttttcccctcgtttttat
actttcgcaattctttttctctggaggataaaaaaaaaatctacctagttttctatataggggataaaagtgctgttctg
ggttttgagcgcagtgttaaaggtacttgaaagtcttaaaatttgttgcgtgtgcttaatagatccgttcggtatttgta
gttgtatgtgaatgtagttgcgaagtctcgagatctgataatttcctattctgagaagttagcgattggcccgagtgtgt
taaaacttgctttaagcggaggttagaataaaaaggtaaatgcagctttgatgaaaggctatggatgcgtttgtttgagc
agcagagagtacccaaaatttgagttttgcgacaggaaaaaaacctggcgggctttgtcctcaagagctgcgcgagtggt
tttccctgtctagcaggctgcacgcagtgggagcgatgatatgattgcaggaacaaatatatgctacaataaggagaagt
aactctagtttaattccgggaagctttatttcgaattatattcagcagggccttctttctcaagtaaaaccgacttcgga
tttgtgctgtggaggttagggtggggcttaaagatggaagggggggaagggaagaaacaaccttcaggacgcatgcgcac
tatgggaggtaatgtacgcgcgtgcgttttgggctccattttcagccacgccgcggccgacttagaagaaggtgagctta
cttttagtttagttattggttggtcgcagactagttcgaaggacttctgaatttgggatccatctcttcagccggttgtt
ctcttcaggttactagcagcagtcgaagcgcgttttttgaggtgaaagcggcactagggcctggccgagcggaaacgcat
tactcgttcgccgccatttcctaagaacgcagcgcgtaccgctacagccgcccggctttctgtgtttggagaggtgaagt
gacaattcaaaccgtctccagtgtcctggacgaggatatcggtcgccatgtgtacgtgggaaggcgaaactgagaccaca
ctcgcttctagcatgatgttgaacacggaaggcggtgagggttatgtcgtaaaagtgcgcggattgccctggtcctgctc
tgcagatgaagtgcaaagatttttctctgaatgcaaaatactaaatggatcttcaggggtccgttttatttacacaagag
aaggacgaccaagtggagaagcatttgttgaattggaaacggaagaagatgtgaaattggcattgaaaaaagacagagaa
acaatgggacacagatatgttgaagtcttcaagtcaaacaacgttgaaatggattgggttctgaagcatactggtcctaa
cagccctgatactgctaatgatggttttgtacgtcttagaggacttccatttggttgtagcaaagaagaaattgttcagt
ttttctcaggtatgtggggtataagtcctagctgtaagtatgggtaaaagattacaatttagtggctctgaaataatgcc
aagtaattagtaataaagcaagccatgaccatgcttaaacttgtaatattgaatggtttttccttttaatgttcaaaaag
gacaaacttgaactataatttgaaatatttactaaaacttagttcttgtttgatgttgatagactggaaggaaaattatt
ttaattgttccactccactaagacaagtgttctaaatgttttttgaaattgacctgaatctctagttaacattaaattaa
aattaaaataatttaaattgttgatttttaaattggctgaaagagtggaaaacgttttagtgcccaagtttgtatgttaa
tatatcagaatatcaaggaatatcgacccatttttcagaagttttaatcaggtgaagtgtttacaatgtgggaggtcggg
agatgggtggagaagtgagaataagacaatatgtagtgtaaacatttgtattaaattttttgatatgataatctctgcta
tgtgctaaagatattgtattactttgcagagctgagtactttgaaatattttaattttgatatagactttgtttacattt
atctactttaaaataaatagaacattttctctgacattaaatatcaatacataaaattattttttctatgtttataaaaa
ggactggtttcatgttttgcaatgtctttatagttgtataaaattgacttaaaagttcatgcatttatatagcaaaaatt
aaaacaaatataaaaataagctttacatttaaatgttctaaatgcactcagtagtccaaagaatcttaaatgtatttctg
aaatatgagatcaacttgcattaacttcagtttttattgaaaaatgtctccttaagatcttcctacaaaccttaaatgtt
tacatttttacttacttgaaatatacaaattgtcattttagaactgaaatattttgcatagatatctttgaaatcttacg
atatgttctttgtagaattattattgctgtattttaattttaattgaaaaattgaatttgtttatataaaaatggattat
atattgcttttcttagcatatcctgtgttaatttgaaagagtattgttattaaagctgcagaaatgtggctgtatgcaag
caggataagttaagaatctcgtatttgctgcatttatattgacatgtttctgttatagagttaatagtacggtatactga
ttctaaatataaagtataaattctggtatattttttaaagctataagaaaatcatgattgggcttgtgatgttaatatta
ccccctactggggttatttgtccttgggttgaagggttggaaatcgtgccaaatgggataacattgccggtggacttcca
ggggaggagtacgggggaggccttcgtgcagtttgcttcacaggaaatagctgaaaaggctctaaagaaacacaaggaaa
gaatagggcacaggtggggatggatggttggttggatatgtcgctcttcttatggtaaactgttgttaaatccatattct
ctcttcttaagtgctcactttacaatatacactttcatattctaacacctcctttgttttcataaatattactttctttt
aattcatatgcagactggctgatgtgcttgttttgctcttccctatttcacattaccttgttaattctgatttagtttaa
agttatttacggaagttgagagattatggctttacatttctttaatagcaccaattatgcctctagttctacatacacat
agccttttattaccataagaaaatgtgattactgaacttgttctatacaatgatgtaacattttcttgtgtaattttcac
ataaaaaaattaacttccaaaaatgtc
Transcript IDhabu1_s4907_g14943.t3
Definition-
>habu1_s4907_g14943.t3
gatttgagtaaacttccaagtcgccgcccatttctcgaagtgtagttttatagagccgccatttttcccctcgtttttat
actttcgcaattctttttctctggaggataaaaaaaaaatctacctagttttctatataggggataaaagtgctgttctg
ggttttgagcgcagtgttaaaggtacttgaaagtcttaaaatttgttgcgtgtgcttaatagatccgttcggtatttgta
gttgtatgtgaatgtagttgcgaagtctcgagatctgataatttcctattctgagaagttagcgattggcccgagtgtgt
taaaacttgctttaagcggaggttagaataaaaaggtaaatgcagctttgatgaaaggctatggatgcgtttgtttgagc
agcagagagtacccaaaatttgagttttgcgacaggaaaaaaacctggcgggctttgtcctcaagagctgcgcgagtggt
tttccctgtctagcaggctgcacgcagtgggagcgatgatatgattgcaggaacaaatatatgctacaataaggagaagt
aactctagtttaattccgggaagctttatttcgaattatattcagcagggccttctttctcaagtaaaaccgacttcgga
tttgtgctgtggaggttagggtggggcttaaagatggaagggggggaagggaagaaacaaccttcaggacgcatgcgcac
tatgggaggtaatgtacgcgcgtgcgttttgggctccattttcagccacgccgcggccgacttagaagaaggtgagctta
cttttagtttagttattggttggtcgcagactagttcgaaggacttctgaatttgggatccatctcttcagccggttgtt
ctcttcaggttactagcagcagtcgaagcgcgttttttgaggtgaaagcggcactagggcctggccgagcggaaacgcat
tactcgttcgccgccatttcctaagaacgcagcgcgtaccgctacagccgcccggctttctgtgtttggagaggtgaagt
gacaattcaaaccgtctccagtgtcctggacgaggatatcggtcgccatgtgtacgtgggcaacagaaggcgaaactgag
accacactcgcttctagcatgatgttgaacacggaaggcggtgagggttatgtcgtaaaagtgcgcggattgccctggtc
ctgctctgcagatgaagtgcaaagatttttctctgaatgcaaaatactaaatggatcttcaggggtccgttttatttaca
caagagaaggacgaccaagtggagaagcatttgttgaattggaaacggaagaagatgtgaaattggcattgaaaaaagac
agagaaacaatgggacacagatatgttgaagtcttcaagtcaaacaacgttgaaatggattgggttctgaagcatactgg
tcctaacagccctgatactgctaatgatggttttgtacgtcttagaggacttccatttggttgtagcaaagaagaaattg
ttcagtttttctcaggtatgtggggtataagtcctagctgtaagtatgggtaaaagattacaatttagtggctctgaaat
aatgccaagtaattagtaataaagcaagccatgaccatgcttaaacttgtaatattgaatggtttttccttttaatgttc
aaaaaggacaaacttgaactataatttgaaatatttactaaaacttagttcttgtttgatgttgatagactggaaggaaa
attattttaattgttccactccactaagacaagtgttctaaatgttttttgaaattgacctgaatctctagttaacatta
aattaaaattaaaataatttaaattgttgatttttaaattggctgaaagagtggaaaacgttttagtgcccaagtttgta
tgttaatatatcagaatatcaaggaatatcgacccatttttcagaagttttaatcaggtgaagtgtttacaatgtgggag
gtcgggagatgggtggagaagtgagaataagacaatatgtagtgtaaacatttgtattaaattttttgatatgataatct
ctgctatgtgctaaagatattgtattactttgcagagctgagtactttgaaatattttaattttgatatagactttgttt
acatttatctactttaaaataaatagaacattttctctgacattaaatatcaatacataaaattattttttctatgttta
taaaaaggactggtttcatgttttgcaatgtctttatagttgtataaaattgacttaaaagttcatgcatttatatagca
aaaattaaaacaaatataaaaataagctttacatttaaatgttctaaatgcactcagtagtccaaagaatcttaaatgta
tttctgaaatatgagatcaacttgcattaacttcagtttttattgaaaaatgtctccttaagatcttcctacaaacctta
aatgtttacatttttacttacttgaaatatacaaattgtcattttagaactgaaatattttgcatagatatctttgaaat
cttacgatatgttctttgtagaattattattgctgtattttaattttaattgaaaaattgaatttgtttatataaaaatg
gattatatattgcttttcttagcatatcctgtgttaatttgaaagagtattgttattaaagctgcagaaatgtggctgta
tgcaagcaggataagttaagaatctcgtatttgctgcatttatattgacatgtttctgttatagagttaatagtacggta
tactgattctaaatataaagtataaattctggtatattttttaaagctataagaaaatcatgattgggcttgtgatgtta
atattaccccctactggggttatttgtccttgggttgaagggttggaaatcgtgccaaatgggataacattgccggtgga
cttccaggggaggagtacgggggaggccttcgtgcagtttgcttcacaggaaatagctgaaaaggctctaaagaaacaca
aggaaagaatagggcacaggtggggatggatggttggttggatatgtcgctcttcttatggtaaactgttgttaaatcca
tattctctcttcttaagtgctcactttacaatatacactttcatattctaacacctcctttgttttcataaatattactt
tcttttaattcatatgcagactggctgatgtgcttgttttgctcttccctatttcacattaccttgttaattctgattta
gtttaaagttatttacggaagttgagagattatggctttacatttctttaatagcaccaattatgcctctagttctacat
acacatagccttttattaccataagaaaatgtgattactgaacttgttctatacaatgatgtaacattttcttgtgtaat
tttcacataaaaaaattaacttccaaaaatgtc
Transcript IDhabu1_s4907_g14943.t4
Definition-
>habu1_s4907_g14943.t4
gctacagccgcccggctttctgtgtttggagaggtgaagtgacaattcaaaccgtctccagtgtcctggacgaggatatc
ggtcgccatgtgtacgtgggcaacagaaggcgaaactgagaccacactcgcttctagcatgatgttgaacacggaaggcg
gtgagggttatgtcgtaaaagtgcgcggattgccctggtcctgctctgcagatgaagtgcaaagatttttctctgaatgc
aaaatactaaatggatcttcaggggtccgttttatttacacaagagaaggacgaccaagtggagaagcatttgttgaatt
ggaaacggaagaagatgtgaaattggcattgaaaaaagacagagaaacaatgggacacagatatgttgaagtcttcaagt
caaacaacgttgaaatggattgggttctgaagcatactggtcctaacagccctgatactgctaatgatggttttgtacgt
cttagaggacttccatttggttgtagcaaagaagaaattgttcagtttttctcaggtatgtggggtataagtcctagctg
taagtatgggtaaaagattacaatttagtggctctgaaataatgccaagtaattagtaataaagcaagccatgaccatgc
ttaaacttgtaatattgaatggtttttccttttaatgttcaaaaaggacaaacttgaactataatttgaaatatttacta
aaacttagttcttgtttgatgttgatagactggaaggaaaattattttaattgttccactccactaagacaagtgttcta
aatgttttttgaaattgacctgaatctctagttaacattaaattaaaattaaaataatttaaattgttgatttttaaatt
ggctgaaagagtggaaaacgttttagtgcccaagtttgtatgttaatatatcagaatatcaaggaatatcgacccatttt
tcagaagttttaatcaggtgaagtgtttacaatgtgggaggtcgggagatgggtggagaagtgagaataagacaatatgt
agtgtaaacatttgtattaaattttttgatatgataatctctgctatgtgctaaagatattgtattactttgcagagctg
agtactttgaaatattttaattttgatatagactttgtttacatttatctactttaaaataaatagaacattttctctga
cattaaatatcaatacataaaattattttttctatgtttataaaaaggactggtttcatgttttgcaatgtctttatagt
tgtataaaattgacttaaaagttcatgcatttatatagcaaaaattaaaacaaatataaaaataagctttacatttaaat
gttctaaatgcactcagtagtccaaagaatcttaaatgtatttctgaaatatgagatcaacttgcattaacttcagtttt
tattgaaaaatgtctccttaagatcttcctacaaaccttaaatgtttacatttttacttacttgaaatatacaaattgtc
attttagaactgaaatattttgcatagatatctttgaaatcttacgatatgttctttgtagaattattattgctgtattt
taattttaattgaaaaattgaatttgtttatataaaaatggattatatattgcttttcttagcatatcctgtgttaattt
gaaagagtattgttattaaagctgcagaaatgtggctgtatgcaagcaggataagttaagaatctcgtatttgctgcatt
tatattgacatgtttctgttatagagttaatagtacggtatactgattctaaatataaagtataaattctggtatatttt
ttaaagctataagaaaatcatgattgggcttgtgatgttaatattaccccctactggggttatttgtccttgggttgaag
ggttggaaatcgtgccaaatgggataacattgccggtggacttccaggggaggagtacgggggaggccttcgtgcagttt
gcttcacaggaaatagctgaaaaggctctaaagaaacacaaggaaagaatagggcacaggtggggatggatggttggttg
gatatgtcgctcttcttatggtaaactgttgttaaatccatattctctcttcttaagtgctcactttacaatatacactt
tcatattctaacacctcctttgttttcataaatattactttcttttaattcatatgcagactggctgatgtgcttgtttt
gctcttccctatttcacattaccttgttaattctgatttagtttaaagttatttacggaagttgagagattatggcttta
catttctttaatagcaccaattatgcctctagttctacatacacatagccttttattaccataagaaaatgtgattactg
aacttgttctatacaatgatgtaacattttcttgtgtaattttcacataaaaaaattaacttccaaaaatgtc
Transcript IDhabu1_s4907_g14943.t5
Definition-
>habu1_s4907_g14943.t5
atataaagtataaattctggtatattttttaaagctataagaaaatcatgattgggcttgtgatgttaatattaccccct
actggggttatttgtccttgggttgaagggttggaaatcgtgccaaatgggataacattgccggtggacttccaggggag
gagtacgggggaggccttcgtgcagtttgcttcacaggaaatagctgaaaaggctctaaagaaacacaaggaaagaatag
ggcacaggtacattgaaatcttcaagagtagcagagcagaagtgcgcactcattatgatcctccccgcaaattaatggcc
atgcagcggcctggtccttatgaccggccaggtgtgggaagaggctataacagccttggtagaggcagtggttttgaaag
aatgagacgtggtgcttatggtggaggctatggtggctatgatgaatacaatggatataatgatggctatggctttggat
ctgataggtttggaagagggatgtcagatcatagatatggtgatggaacctctactttccaaagtacaactggtcattgt
gtacatatgagaggattaccttatagagctactgagaatgatatttataatttcttttcgcctcttaatccggtaagagt
acacattgaaattggacctgatggcagagtcactggagaggcagatgttgagtttgctactcatgaggatgctgttgctg
caatgtccaaagacaaagcaaatatgcaacatcgatatgtagaactcttcttgaattctacagctggaggaagtggtggt
gcatatggaagtcaaatgatgggagcaatggttaaggaaaccgaaggggtagttcaagattggaacactaacacattggc
aggaagccaatccagttatggtggtccagctaaccagcagttaagtgggggttatggaggaggctacggtggtcaaagca
gcatgagtggatatgtttggcaaatgccgagtgatcaagatttggatccaatccacatgaaactagttctgacatctcat
ggtaaccagagtgcaatgaacagcagctactacagcagtggtaatcgtgcatccatgggggtgaatggcatggctggaat
gtctaacatgtccaacatgagtggtggctggggaatgtaacttgtcacctgatttttttgtcaacttttttaagaaaaca
aaaaactaagtttaacagttttgcaatacaagcttgtgatttatgctttacttgtaagtgaaatcaggatcattttaaaa
cattcaggttcagtatttttgaatatgctgaaacattcatctagggtataagtccagtaaagaagttcctgttaaacaac
tctcagctttttccagtttttgttgtaggaatgtatttgagcagtaagtgtatttaggttaaagctgtttcaattatgtt
aaatgttgctcttataccacataacaccaaacactgttttcagtgcatgttcaggaacatgctttttgtacaaacaagtt
ataggagctgtgttggaaattcaagtgaacctttggcatgttagttctagtttttcttttaatatcttgtaaggcacatt
tacgctttttaagttaatagggaaatgtgaggtgcaatacagcttacctttaggatttgggtcttagtattcagatgaca
actgagaccttggtttaatctttcattgtgttgtgatttatttttaggtgtattgcgctaagtgaaacttgttcaaataa
aacttccttttaaaaactgggaacatctcttgatttaagtgagcattatatttcctggcaacaattctgtctctgcattt
tgctttaacagtttttaatctgctaatttaacagtttttaatctgctaaaccagtataaccacactgaaatcagatcacg
aggaaaatatcctagcaatttagtcaaactgcagacaaaatgaacctgcatagaaaataaatgttactaaaatggtaatt
gtatattgattatcaataggaagtatactttgtgtatgaaattggtttgcatagtttaaggaaagcagataatgattata
atttgtaaaacattttttgcccagctagtagttttttaaattgtcctttaagagtaccaaaatacatggagactatggtt
ttttttaaagtaagagatgttgtatgaaatgtagggtgcacttccacttgatgcagacttacacattttctgttcaaaaa
aatgtagggcatggaatctttaacaattattttgaaatactcatttcatagtacttccccacagggtatgaagtacatgt
actggtactcatttaacatttgctcattcagcaactgcttaaagttatggtgctgaatgaggagtacttaagacagttcc
ttgtacttacagccattttagggtaccatagtcatatttatcactattgtgatctt
Transcript IDhabu1_s4907_g14943.t6
Definition-
>habu1_s4907_g14943.t6
gtgtgagcacataaagcttgttggaatgtattgatgggttaaatttctggcggaggctagctttttaaccttcctctcaa
attgccacatgagcaaaacatgggtcctgttgagtggacatgtttccctccagagcattttctgtttgctgtccttaacc
cttaaggttgggatagcttaattagcacatatttcaaactatttttttaaaatcagccttggataattcttactaaaaac
tggcctataattgccagttccaaggctgcagggtttaaatgtactgtttcttgttatttagtgtgtgtgtttattaaaaa
aaactcaactatttttatgtatgtaaacctcctaggtacattgaaatcttcaagagtagcagagcagaagtgcgcactca
ttatgatcctccccgcaaattaatggccatgcagcggcctggtccttatgaccggccaggtgtgggaagaggctataaca
gccttggtagaggcagtggttttgaaagaatgagacgtggtgcttatggtggaggctatggtggctatgatgaatacaat
ggatataatgatggctatggctttggatctgataggtttggaagagggatgtcagatcatagatatggtgatggaacctc
tactttccaaagtacaactggtcattgtgtacatatgagaggattaccttatagagctactgagaatgatatttataatt
tcttttcgcctcttaatccggtaagagtacacattgaaattggacctgatggcagagtcactggagaggcagatgttgag
tttgctactcatgaggatgctgttgctgcaatgtccaaagacaaagcaaatatgcaacatcgatatgtagaactcttctt
gaattctacagctggaggaagtggtggtgcatatggaagtcaaatgatgggagcaatggttaaggaaaccgaaggggtag
ttcaagattggaacactaacacattggcaggaagccaatccagttatggtggtccagctaaccagcagttaagtgggggt
tatggaggaggctacggtggtcaaagcagcatgagtggatatggtaaccagagtgcaatgaacagcagctactacagcag
tggtaatcgtgcatccatgggggtgaatggcatggctggaatgtctaacatgtccaacatgagtggtggctggggaatgt
aacttgtcacctgatttttttgtcaacttttttaagaaaacaaaaaactaagtttaacagttttgcaatacaagcttgtg
atttatgctttacttgtaagtgaaatcaggatcattttaaaacattcaggttcagtatttttgaatatgctgaaacattc
atctagggtataagtccagtaaagaagttcctgttaaacaactctcagctttttccagtttttgttgtaggaatgtattt
gagcagtaagtgtatttaggttaaagctgtttcaattatgttaaatgttgctcttataccacataacaccaaacactgtt
ttcagtgcatgttcaggaacatgctttttgtacaaacaagttataggagctgtgttggaaattcaagtgaacctttggca
tgttagttctagtttttcttttaatatcttgtaaggcacatttacgctttttaagttaatagggaaatgtgaggtgcaat
acagcttacctttaggatttgggtcttagtattcagatgacaactgagaccttggtttaatctttcattgtgttgtgatt
tatttttaggtgtattgcgctaagtgaaacttgttcaaataaaacttccttttaaaaactgggaacatctcttgatttaa
gtgagcattatatttcctggcaacaattctgtctctgcattttgctttaacagtttttaatctgctaatttaacagtttt
taatctgctaaaccagtataaccacactgaaatcagatcacgaggaaaatatcctagcaatttagtcaaactgcagacaa
aatgaacctgcatagaaaataaatgttactaaaatggtaattgtatattgattatcaataggaagtatactttgtgtatg
aaattggtttgcatagtttaaggaaagcagataatgattataatttgtaaaacattttttgcccagctagtagtttttta
aattgtcctttaagagtaccaaaatacatggagactatggttttttttaaagtaagagatgttgtatgaaatgtagggtg
cacttccacttgatgcagacttacacattttctgttcaaaaaaatgtagggcatggaatctttaacaattattttgaaat
actcatttcatagtacttccccacagggtatgaagtacatgtactggtactcatttaacatttgctcattcagcaactgc
ttaaagttatggtgctgaatgaggagtacttaagacagttccttgtacttacagccattttagggtaccatagtcatatt
tatcactattgtgatctt
Transcript IDhabu1_s4907_g14943.t7
Definition-
>habu1_s4907_g14943.t7
gtgtgagcacataaagcttgttggaatgtattgatgggttaaatttctggcggaggctagctttttaaccttcctctcaa
attgccacatgagcaaaacatgggtcctgttgagtggacatgtttccctccagagcattttctgtttgctgtccttaacc
cttaaggttgggatagcttaattagcacatatttcaaactatttttttaaaatcagccttggataattcttactaaaaac
tggcctataattgccagttccaaggctgcagggtttaaatgtactgtttcttgttatttagtgtgtgtgtttattaaaaa
aaactcaactatttttatgtatgtaaacctcctaggtacattgaaatcttcaagagtagcagagcagaagtgcgcactca
ttatgatcctccccgcaaattaatggccatgcagcggcctggtccttatgaccggccaggtgtgggaagaggctataaca
gccttggtagaggcagtggttttgaaagaatgagacgtggtgcttatggtggaggctatggtggctatgatgaatacaat
ggatataatgatggctatggctttggatctgataggtttggaagagggatgtcagatcatagatatggtgatggaacctc
tactttccaaagtacaactggtcattgtgtacatatgagaggattaccttatagagctactgagaatgatatttataatt
tcttttcgcctcttaatccggtaagagtacacattgaaattggacctgatggcagagtcactggagaggcagatgttgag
tttgctactcatgaggatgctgttgctgcaatgtccaaagacaaagcaaatatgcaacatcgatatgtagaactcttctt
gaattctacagctggaggaagtggtggtgcatatggaagtcaaatgatgggagcaatggttaaggaaaccgaaggggtag
ttcaagattggaacactaacacattggcaggaagccaatccagttatggtggtccagctaaccagcagttaagtgggggt
tatggaggaggctacggtggtcaaagcagcatgagtggatatgtttggcaaatgccgagtgatcaagatttggatccaat
ccacatgaaactagttctgacatctcatggtaaccagagtgcaatgaacagcagctactacagcagtggtaatcgtgcat
ccatgggggtgaatggcatggctggaatgtctaacatgtccaacatgagtggtggctggggaatgtaacttgtcacctga
tttttttgtcaacttttttaagaaaacaaaaaactaagtttaacagttttgcaatacaagcttgtgatttatgctttact
tgtaagtgaaatcaggatcattttaaaacattcaggttcagtatttttgaatatgctgaaacattcatctagggtataag
tccagtaaagaagttcctgttaaacaactctcagctttttccagtttttgttgtaggaatgtatttgagcagtaagtgta
tttaggttaaagctgtttcaattatgttaaatgttgctcttataccacataacaccaaacactgttttcagtgcatgttc
aggaacatgctttttgtacaaacaagttataggagctgtgttggaaattcaagtgaacctttggcatgttagttctagtt
tttcttttaatatcttgtaaggcacatttacgctttttaagttaatagggaaatgtgaggtgcaatacagcttaccttta
ggatttgggtcttagtattcagatgacaactgagaccttggtttaatctttcattgtgttgtgatttatttttaggtgta
ttgcgctaagtgaaacttgttcaaataaaacttccttttaaaaactgggaacatctcttgatttaagtgagcattatatt
tcctggcaacaattctgtctctgcattttgctttaacagtttttaatctgctaatttaacagtttttaatctgctaaacc
agtataaccacactgaaatcagatcacgaggaaaatatcctagcaatttagtcaaactgcagacaaaatgaacctgcata
gaaaataaatgttactaaaatggtaattgtatattgattatcaataggaagtatactttgtgtatgaaattggtttgcat
agtttaaggaaagcagataatgattataatttgtaaaacattttttgcccagctagtagttttttaaattgtcctttaag
agtaccaaaatacatggagactatggttttttttaaagtaagagatgttgtatgaaatgtagggtgcacttccacttgat
gcagacttacacattttctgttcaaaaaaatgtagggcatggaatctttaacaattattttgaaatactcatttcatagt
acttccccacagggtatgaagtacatgtactggtactcatttaacatttgctcattcagcaactgcttaaagttatggtg
ctgaatgaggagtacttaagacagttccttgtacttacagccattttagggtaccatagtcatatttatcactattgtga
tctt

Protein
Protein IDhabu1_s4907_g14943.t1
Definition-
>habu1_s4907_g14943.t1
MCTWATEGETETTLASSMMLNTEGGEGYVVKVRGLPWSCSADEVQRFFSECKILNGSSGVRFIYTREGRPSGEAFVELET
EEDVKLALKKDRETMGHRYVEVFKSNNVEMDWVLKHTGPNSPDTANDGFVRLRGLPFGCSKEEIVQFFSGLEIVPNGITL
PVDFQGRSTGEAFVQFASQEIAEKALKKHKERIGHRWGWMVGWICRSSYGKLLLNPYSLFLSAHFTIYTFIF
Protein IDhabu1_s4907_g14943.t2
Definition-
>habu1_s4907_g14943.t2
MCTWEGETETTLASSMMLNTEGGEGYVVKVRGLPWSCSADEVQRFFSECKILNGSSGVRFIYTREGRPSGEAFVELETEE
DVKLALKKDRETMGHRYVEVFKSNNVEMDWVLKHTGPNSPDTANDGFVRLRGLPFGCSKEEIVQFFSGMWGISPSCKYG
Protein IDhabu1_s4907_g14943.t3
Definition-
>habu1_s4907_g14943.t3
MCTWATEGETETTLASSMMLNTEGGEGYVVKVRGLPWSCSADEVQRFFSECKILNGSSGVRFIYTREGRPSGEAFVELET
EEDVKLALKKDRETMGHRYVEVFKSNNVEMDWVLKHTGPNSPDTANDGFVRLRGLPFGCSKEEIVQFFSGMWGISPSCKY
G
Protein IDhabu1_s4907_g14943.t4
Definition-
>habu1_s4907_g14943.t4
MCTWATEGETETTLASSMMLNTEGGEGYVVKVRGLPWSCSADEVQRFFSECKILNGSSGVRFIYTREGRPSGEAFVELET
EEDVKLALKKDRETMGHRYVEVFKSNNVEMDWVLKHTGPNSPDTANDGFVRLRGLPFGCSKEEIVQFFSGMWGISPSCKY
G
Protein IDhabu1_s4907_g14943.t5
Definition-
>habu1_s4907_g14943.t5
MIGLVMLILPPTGVICPWVEGLEIVPNGITLPVDFQGRSTGEAFVQFASQEIAEKALKKHKERIGHRYIEIFKSSRAEVR
THYDPPRKLMAMQRPGPYDRPGVGRGYNSLGRGSGFERMRRGAYGGGYGGYDEYNGYNDGYGFGSDRFGRGMSDHRYGDG
TSTFQSTTGHCVHMRGLPYRATENDIYNFFSPLNPVRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEDAVAAMSKDKANMQHRYVEL
FLNSTAGGSGGAYGSQMMGAMVKETEGVVQDWNTNTLAGSQSSYGGPANQQLSGGYGGGYGGQSSMSGYVWQMPSDQDLD
PIHMKLVLTSHGNQSAMNSSYYSSGNRASMGVNGMAGMSNMSNMSGGWGM
Protein IDhabu1_s4907_g14943.t6
Definition-
>habu1_s4907_g14943.t6
MAMQRPGPYDRPGVGRGYNSLGRGSGFERMRRGAYGGGYGGYDEYNGYNDGYGFGSDRFGRGMSDHRYGDGTSTFQSTTG
HCVHMRGLPYRATENDIYNFFSPLNPVRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEDAVAAMSKDKANMQHRYVELFLNSTAGGS
GGAYGSQMMGAMVKETEGVVQDWNTNTLAGSQSSYGGPANQQLSGGYGGGYGGQSSMSGYGNQSAMNSSYYSSGNRASMG
VNGMAGMSNMSNMSGGWGM
Protein IDhabu1_s4907_g14943.t7
Definition-
>habu1_s4907_g14943.t7
MAMQRPGPYDRPGVGRGYNSLGRGSGFERMRRGAYGGGYGGYDEYNGYNDGYGFGSDRFGRGMSDHRYGDGTSTFQSTTG
HCVHMRGLPYRATENDIYNFFSPLNPVRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEDAVAAMSKDKANMQHRYVELFLNSTAGGS
GGAYGSQMMGAMVKETEGVVQDWNTNTLAGSQSSYGGPANQQLSGGYGGGYGGQSSMSGYVWQMPSDQDLDPIHMKLVLT
SHGNQSAMNSSYYSSGNRASMGVNGMAGMSNMSNMSGGWGM

  • MGU Home
  • Genome Projects
  • Information
  • Genome Browser
  • Blast Search
  • Chromosome
  • Keyword Search
  • Downloads

Gene ID:



Keyword:



  • Login

copyright © Marine Genomics Unit 2015
Okinawa Institute of Science and Technology
1919-1 Tancha, Onna-son, Kunigami-gun, Okinawa, Japan 904-0495