Gene
| Gene Model ID | habu1_s541_g02557 |
|---|---|
| Locus | habu1_scaffold541 : 783955 ... 799650 : - |
| To GenomeBrowser | habu1_scaffold541:783955..799650 |
| Genes list of scaffold | habu1_scaffold541 |
Annotation by Blast2GO
| Annotation | GO |
|---|---|
| beta- -galactosyltransferase 3-like isoform x1 | GO:0005975 GO:0016757 |
Hmmer Search for Pfam
| query | Total | ID | Target | From | To | Eval | Score | cEval | iEval | Score |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| habu1_s541_g02557.t3 | 1 | 1 | Glyco_transf_7N | 7 | 152 | 2.3e-39 | 133.8 | 4.49957e-42 | 3.3e-38 | 130.1 |
| habu1_s541_g02557.t3 | 1 | 1 | Glyco_transf_7C | 155 | 229 | 4.5e-20 | 70.8 | 1.4e-23 | 1.0e-19 | 69.7 |
Expression profile
| Libraries | FPKM |
|---|---|
| >Adult | |
| Venom fang forming tissue | 4.7 |
| Venom grand-1 | 7.1 |
| Pit, infrared sensing | 5.8 |
| Nose | 5.0 |
| Brain-1 | 0.9 |
| Eye | 3.4 |
| fetal fibroblast | 4.7 |
| venom gland-2 | 11.5 |
| Brain-2 | 0.9 |
| Spleen | 8.8 |
| Lung | 5.8 |
| Liver | 6.4 |
| Kidney | 5.1 |
| Pancreas | 11.6 |
| Small intestine | 5.7 |
| Large intestine | 5.2 |
| Stomach | 6.4 |
| heart | 8.1 |
| ovary | 8.7 |
| cheek muscle | 10.6 |
Transcript
| Transcript ID | habu1_s541_g02557.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
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|
| Transcript ID | habu1_s541_g02557.t2 |
| Definition | - |
>habu1_s541_g02557.t2 gaaaggcgcttatgcaaaagccctttcttccagtctctgattcccagcatatcatgctttaactcgggatggcctacata ttgcattgcatcttggtacatgtagtcctaaataatccttcgtttaaaaaaaagaaaagggggcgtggtcccactgcggc cgcttctaggaagtgcctcgtgtgcgttttgaaggcgggctggtgggtggtttcgcttccccgctttgaagctcttcgct ggtgtgacttctgagattggataatggaagaattgattcaccaaagatggttaaaatataaagcatttgatctagagcat cgtgtgagttgcaagaaatcatgctgagaatgacaagaatgacaatttctgtgctgtactcagttacctcaaagagttat ttactgaaactttagttaaaacactggaaagttctgaagaactaaagaagtaaattctttatgaagaaaatgaatttttc tcgagcagaaaattcatgctttctgcttctcttgttggactgttaaccatcacctttgatacactacacagtgaaaaaac aattatccacaaaaatccatatgtccaattgggtggctgttatagcccacctcattgtctagcccattacaaaactgcta taattgtaccatgcaggaagtgtgaacagcagttgcaccaatttctctattaccttcatccctttctccaacgtcaacag cttagctattgtatctacttgattcatcagtctaatgttacacccgccagtacatcctctcttcttccggctggaactgg tccatttaacagagcaaaactccttaatgttggtgtccatgaggccatgaaagacaatgattgggactgtctgcttctac ataatatggatcttattccagaaaatgactataatctttatgtctgtgacaaatattatcccaaacacttgtccactgct attgacaagttatattaccgcctgccatattcatccttttttggtggtgttactgctttgaccccagaccactacatgaa gataaatgggtttccaaacacatactgggagcgtcttgatgaagatgatgacattgcagaaaggatccatatagcaggaa tgaaaataattcaggttcctctacatgttggacgttacaaaaagatgggttatggacaaacagttagccctttactgagg ctaaaaaggcctgctgaattgcatacttcccaaacatggaaagatgatggaacaaattcccttgtcttcaaactcttaga aaagaagaaaaaatacctttatacacacattatggtagacattggagccacaccagcattaccacctccaagtagaagaa aaaggaataacacttgacttgcgcatcatctgaagctttcaaatcttcgagctttttacaaactaaactcaccaggaaaa ggaggggaaagaaaacattgcttttgcatgcaagcaggagcctaacacagggtactaaagaaatcatatctggggtagaa tggttttgcttcattgacatagaaatatgtagaaattacatattctatcttgttctgcagtaaaccgccaggagctagaa gctatagttctgctataggaattgtcaagtaccattaacaaattagtctataaacaattgcaaaataactactggatcct gtgctcttttctaacttgcacaagtcttctgcatagtaaatatttaaaaagttacattaatggtatgaccagtttttcag taattgtatgaatttggaattgacttacaggtctccttttgaaaggcttttcattagaaaattaagttttctatacacac atttaaagaaagctaattttaattatatttcagggtgttaatttttaaaacattttagtgaattttaataaacatcttat gtaagtttttggatgaaatgattgtctgcttttttaattaacacatttcattggagtctcatgttatttaaaaaagtttg aaacatttctgtagacaaactgatgagacagagcagctgtttatgtatttgctgtattaaaaatctggaattaatggata tggagatttaccctgttatatcccacatatatagctcactgaatcatcatagaacccttcctatagaaagagtaggaaat ctgtaaatatttaagcaagattgctgtttgttcaaagcaccaatgttgaatcttatttccctctgtccatttgtaaatct ggagaaaataaggagtgtttgcttttcaagcctattatgtggtttgctggtagccaccttgaaaatacaaaaataatttg actttgggtagctggaatactattgttctggctcattttttaaaaaatatagtgagggttcacatttttccataggacta aagcaatggtatatgctttaatttaatatcaatttatctacttgtgtactctatgcaaataagtttggctgttatccttt aaaaaatgaaaagcacagcataatcaatttcttttaataataaattctcacacattctttaacaga |
|
| Transcript ID | habu1_s541_g02557.t3 |
| Definition | - |
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|
Protein
| Protein ID | habu1_s541_g02557.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
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|
| Protein ID | habu1_s541_g02557.t2 |
| Definition | - |
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| Protein ID | habu1_s541_g02557.t3 |
| Definition | - |
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