Gene
| Gene Model ID | habu1_s8317_g18615 |
|---|---|
| Locus | habu1_scaffold8317 : 5635 ... 95005 : - |
| To GenomeBrowser | habu1_scaffold8317:5635..95005 |
| Genes list of scaffold | habu1_scaffold8317 |
Annotation by Blast2GO
| Annotation | GO |
|---|---|
| cytosolic phospholipase a2 isoform x1 | GO:0005509 GO:0005544 GO:0005783 GO:0005794 GO:0005829 GO:0009395 GO:0042127 GO:0046456 GO:0047498 GO:0050482 GO:0071236 |
Hmmer Search for Pfam
| query | Total | ID | Target | From | To | Eval | Score | cEval | iEval | Score |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| habu1_s8317_g18615.t2 | 1 | 1 | C2 | 42 | 126 | 1.2e-15 | 57.0 | 4.2e-19 | 3.1e-15 | 55.7 |
| habu1_s8317_g18615.t2 | 1 | 1 | PLA2_B | 206 | 710 | 0.0 | 455.2 | 0.0 | 0.0 | 451.0 |
Expression profile
| Libraries | FPKM |
|---|---|
| >Adult | |
| Venom fang forming tissue | 3.1 |
| Venom grand-1 | 9.5 |
| Pit, infrared sensing | 4.2 |
| Nose | 3.2 |
| Brain-1 | 0.5 |
| Eye | 2.6 |
| fetal fibroblast | 8.5 |
| venom gland-2 | 9.2 |
| Brain-2 | 0.4 |
| Spleen | 1.9 |
| Lung | 15.3 |
| Liver | 0.8 |
| Kidney | 0.7 |
| Pancreas | 2.6 |
| Small intestine | 2.5 |
| Large intestine | 1.8 |
| Stomach | 4.2 |
| heart | 0.4 |
| ovary | 11.6 |
| cheek muscle | 0.5 |
Transcript
| Transcript ID | habu1_s8317_g18615.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>habu1_s8317_g18615.t1 tcgcggcattaaaaaggttgagaaccactgctctaattcctctttcaggccctagtacttctccagcttctcattctcct tcttcctgatgttgtcatttgtcacatgtatcaccaccattatcttctggtccatgcatattatcacaatgtctgggttg ttggccagtgtctactcagccactgaatctacaatgtccagtatagatccatttcagcagattatggtggaacatcagta ttcacacaaattcattgtgacggttaagcaagctaaaaatgtcaccaaaggggcttttggagatatgctagacactcctg acccctatgtggagctctttattcccacagcaccagacagcagaaagaaaacaaagtatatcaacaacaatgtgaatccc gagtggaatgaaacttttgaaataattttggatcccaaccaggaaaatattctggagattactcttatggatgcaaatta tgtgatggatgagactattggtacagcaacgttttccatttcatctctgaaaattggggagaagaaacaagttccattta tcattaatagagttacagaagtcatattggaggtatctcttgaagtttgctcttcaacagacctccgtttcagcatggct ctgtgtgatgaagagaagcacttccgacagcagcggaaaactagagtaatgcatcatctgaacaagttattgggagctga tttggcctccattcgtgatgtgccagtgatagcagtcttgggatctggaggtggatttcgggcaacagtgggattttctg gagtaatgaaagcactgtatgaatctggaattttagactgtgcaacatatattggtggtttatctggatccacatggtac atgtcaaccctgtattctcatccagacttcccagcaaaagggccaaaggatataaatgttgagttgatgaacagtattag tcacaccccactgaaactacttacaccccagaaagtgaagcgatacattgaagtactgtggaaaaagaagagagctgggc agcctgtgacatttacagatatcttcggaatgttgataggagaaacactgattcaaaacagaatggatatcactttatct catatgagggaaaaaatcaacaaagcgcagtcagctttgccactttttacctgtcttcatgttaaacctgatgtgtcaga actgatgtttgcagattgggtggagttcagtccctatgagattggaatggctaaatatgggaccttcatgactcccaatc tgtttggcagcaagttttttatgggcacagtagtgaaaaactacaaagagaaccctctgcatttcttaatgggtgtatgg ggaagtgcatttgctatactgatcaacagagtgcttggcctttccaatagccacaataaaggacccacaatggaagaaga actagaaaatatcaggttgcgacagattgtaagcaatgattcagatagtgatgatgaatcacaggggccgaaaggctcag aaaacccccaggctgacatatctcacgaacagaccagccaggaaagctgggttcagaggatgtttatggcgctggtgggc gagagtgctcttttcaccacccgagagggccgtgctggcaaagtccacaatttcatgttgggtttgaatctcaatacttg ctacccattatcccctttcgttggtgtcagtacccaggaatctgtggaggatgatgaaatggatactgctgtaacagatc ctgatgaatttgacaggatatatgagcctctggatgtaaagagtaaaaaaattcatgttgtggacagtggacttactttt aatttgccatatccacttatcttaagaccacagcgaggagttgatcttattatctcatttgatttttctgctcgccccag tgattccagtcctccttttaaggaaattttacttgccgaaaaatgggccaaaatgaacaaccttccttttccgaaaatag acccaaatgtgtttgatcgtgaagggttaaaagagtgttatgtcttcaagcccaaaaatcctgcatctgaaatagattgt cccacgattattcattttgttttggccaatatcaacttcagaaattacaaaacaccaggtgttccaagagaaactcaaga agagaaagactttgctgattttgatatttttgatgatcccgacacacctttctccactttcaacttccagtattcaaagg aggctttcagcagattgcatgatctgatggagttcaataccctgaacaacttagaaataatcaaagaagcaataacagac agtattgaatatagaaggcagaacccatcacgctgttctgtatcactcagcaatgttgaagcaaggagatacttcaacaa agctaaaagcaatagccgtacataaggataaataccagctttgctacttagaaccaagaattgttgcattgatcaaacag actttatgcagaaaagaatcactaggaattaatcattacaaaataaaggaatacaattgcatccctgatgatgatgaaaa tgagagcaggtttatttacagctagataccatataacacgtatagtatacattccaaaataagacataaaggaagaagga gaaaaaagaacaaagtaaaatacttaatacagcagaattcataaacattatagtagacagtaatgttaaaataaagtaaa attaaaaaatggttaatctggtttttcttcagatcatataaatctgccccagttattcttgtatattctcctcattcctt taaaacacttatccccagcaaggctttctccaaatatattgatttatttaacatgttggaagttgtaatcttagtgtagc tagagactgagttggggaatggttgttttaaaaatactctaatttttgatgtgaaaatgctgtattgtaagtaaattgtt tcttgaaagtatattcttcccaggcaattatataaaaatatttgtatcactgtgaaatgaatgttaaaagtataaatcca tctccatgctcctttgatttaacaatatcaaaaacaaatgaggtggataataacattgcttgcttttatttttgttttgt tgaatttttatataattgaacatagtagaaccttgatttactttaacttaggtaaaggacaggaactttttatagaaaaa aatgtttgttttcaagtaaagttaacattctatacattctacaaagggacttaaaccatcaaaacaaagagtggcttcct ttcccagttatggacatgttcacagttatttatgttgccaattgacaccggaaaatataggaaaccattctgcataaaag ttattttttgcaaactactagttattacgagcccctttccccttccatcacactgctatctcatgcaaacatctgtcatt gttgcaatctgtgcataattctaaatcctaatgggggatgcttgttttgcgcataacctgattgcatgaatctacacctt atgataaaggaatatgtaaggctgttatggcttgttgaatacttccagtttggtattgtgtgtgagccacactatgaaat catttgtcaatatttaatttatggaacatgtgagatatttcagagccaaactagagccaatcctttccaggtcatgctcc catcccttttctttgttccttggtaaatatagctatctattttagttatggagtggccttctcaaacaaaacagaaaatc tctttatatttcccttgctggtttgtgcttataattgtaaaatattgacaagatgggctatgctactgcttggtagaaaa attaaatttggatgagcaattcagtctagcacgcaggaaaaacacagagtaaatgcttaaaaaaaggacattgagttgag tgggtatagaaattgaataaataaataaaattacttgtggatatttcttagtgagggtgtttgccttcaaattaacattt gattcctggtgagtgtctggataagtccttgcagttttcttgggaagttttttcagaagttgctgtccattgtctccttc ttagggctgaaagtgactggcatgaggtcacttaaatgttgacttcatgttgaagatgggattgaaactcatgacatttt gatttctagattggtctcttaaccatctcatatagtttagaaaccaaactatatccaccgaaccagacatttaatccaat atgtaattattccttttgtacgtactctttgctgggaattgtaaaaatcttaagtccagggaacatgagaagttacagta actgcattccttttccctggaatgttgtaaaatgatctcatatttggccaatattcattcgaaaagtgacatgattgtct ttgccaagttgaagcagtttgcaatggcaactattgcaaatatgtatgatcagaccttctctgcttttatatcgtttcaa aagtaatgatccttggctgttaaaatgctttgtttcaaagcttgggtcaatctcagaacaaaaatattaatgcctctgga gactggaacaaaagatcaactgaagggtcatgcttagagctttgttttcaggacagattgaacgagatagcattcctaat agatgtagctacttccatggttgatcataatttcactttatcaggagagtttatgatgacccatgtacagccggtttgct ctttaactggtgcccttctccctcttccccaatagtctctggttctaagaatgttttcaggatgtttttgctagaaattt attctagttgatttttgttgatctatgcaaatttgtattgtatttttcttgtggggcaagctatttttgttaaatttggt ttgcataagtcgtatattaaaaaaaactataatccttctattttgaaagactgtttattcaatagttgctgaatttttaa aataattatttcattatttcatttttctttctataaaaatgtaagttgcttacttcatttaataactagtctatcctcta ttgtactagtaagggtttactaaaagatctgtcgtactgattaatctgttttatgataatgtgaattagatgtttaaaat catgacaggattttatatatttttttaaaaaaactttctgtgaaaacaaaggatgtgatacaatcttttttttaatacat atattttaagtaaaaccatcaacatgttaaatcattcaattttcttttgtttaggatgtttaattgtttcacaggattaa atgaagaaatgtcccttaaaaatatttcatatctctttcttaaaatacttggaatatcatctgttttgtcccatgacatt attattaatgttttaaataaatgttactgtatggttacattat |
|
| Transcript ID | habu1_s8317_g18615.t2 |
| Definition | - |
>habu1_s8317_g18615.t2 tcgcggcattaaaaaggttgagaaccactgctctaattcctctttcaggccctagtacttctccagcttctcattctcct tcttcctgatgttgtcatttgtcacatgtatcaccaccattatcttctggtccatgcatattatcacaatgtctgggttg ttggccagtgtctactcagccactgaatctacaatgtccagtatagatccatttcagcagattatggtggaacatcagta ttcacacaaattcattgtgacggttaagcaagctaaaaatgtcaccaaaggggcttttggagatatgctagacactcctg acccctatgtggagctctttattcccacagcaccagacagcagaaagaaaacaaagtatatcaacaacaatgtgaatccc gagtggaatgaaacttttgaaataattttggatcccaaccaggaaaatattctggagattactcttatggatgcaaatta tgtgatggatgagactattggtacagcaacgttttccatttcatctctgaaaattggggagaagaaacaagttccattta tcattaatagagttacagaagtcatattggaggtatctcttgaagtttgctcttcaacagacctccgtttcagcatggct ctgtgtgatgaagagaagcacttccgacagcagcggaaaactagagtaatgcatcatctgaacaagttattgggagctga tttggcctccattcgtgatgtgccagtgatagcagtcttgggatctggaggtggatttcgggcaacagtgggattttctg gagtaatgaaagcactgtatgaatctggaattttagactgtgcaacatatattggtggtttatctggatccacatggtac atgtcaaccctgtattctcatccagacttcccagcaaaagggccaaaggatataaatgttgagttgatgaacagtattag tcacaccccactgaaactacttacaccccagaaagtgaagcgatacattgaagtactgtggaaaaagaagagagctgggc agcctgtgacatttacagatatcttcggaatgttgataggagaaacactgattcaaaacctgatcggcagctggtgggaa atcctgccagttcagttaacatggcagctatcggaggaaataagaatggatatcactttatctcatatgagggaaaaaat caacaaagcgcagtcagctttgccactttttacctgtcttcatgttaaacctgatgtgtcagaactgatgtttgcagatt gggtggagttcagtccctatgagattggaatggctaaatatgggaccttcatgactcccaatctgtttggcagcaagttt tttatgggcacagtagtgaaaaactacaaagagaaccctctgcatttcttaatgggtgtatggggaagtgcatttgctat actgatcaacagagtgcttggcctttccaatagccacaataaaggacccacaatggaagaagaactagaaaatatcaggt tgcgacagattgtaagcaatgattcagatagtgatgatgaatcacaggggccgaaaggctcagaaaacccccaggctgac atatctcacgaacagaccagccaggaaagctgggttcagaggatgtttatggcgctggtgggcgagagtgctcttttcac cacccgagagggccgtgctggcaaagtccacaatttcatgttgggtttgaatctcaatacttgctacccattatcccctt tcgttggtgtcagtacccaggaatctgtggaggatgatgaaatggatactgctgtaacagatcctgatgaatttgacagg atatatgagcctctggatgtaaagagtaaaaaaattcatgttgtggacagtggacttacttttaatttgccatatccact tatcttaagaccacagcgaggagttgatcttattatctcatttgatttttctgctcgccccagtgattccagtcctcctt ttaaggaaattttacttgccgaaaaatgggccaaaatgaacaaccttccttttccgaaaatagacccaaatgtgtttgat cgtgaagggttaaaagagtgttatgtcttcaagcccaaaaatcctgcatctgaaatagattgtcccacgattattcattt tgttttggccaatatcaacttcagaaattacaaaacaccaggtgttccaagagaaactcaagaagagaaagactttgctg attttgatatttttgatgatcccgacacacctttctccactttcaacttccagtattcaaaggaggctttcagcagattg catgatctgatggagttcaataccctgaacaacttagaaataatcaaagaagcaataacagacagtattgaatatagaag gcagaacccatcacgctgttctgtatcactcagcaatgttgaagcaaggagatacttcaacaaagctaaaagcaatagcc gtacataaggataaataccagctttgctacttagaaccaagaattgttgcattgatcaaacagactttatgcagaaaaga atcactaggaattaatcattacaaaataaaggaatacaattgcatccctgatgatgatgaaaatgagagcaggtttattt acagctagataccatataacacgtatagtatacattccaaaataagacataaaggaagaaggagaaaaaagaacaaagta aaatacttaatacagcagaattcataaacattatagtagacagtaatgttaaaataaagtaaaattaaaaaatggttaat ctggtttttcttcagatcatataaatctgccccagttattcttgtatattctcctcattcctttaaaacacttatcccca gcaaggctttctccaaatatattgatttatttaacatgttggaagttgtaatcttagtgtagctagagactgagttgggg aatggttgttttaaaaatactctaatttttgatgtgaaaatgctgtattgtaagtaaattgtttcttgaaagtatattct tcccaggcaattatataaaaatatttgtatcactgtgaaatgaatgttaaaagtataaatccatctccatgctcctttga tttaacaatatcaaaaacaaatgaggtggataataacattgcttgcttttatttttgttttgttgaatttttatataatt gaacatagtagaaccttgatttactttaacttaggtaaaggacaggaactttttatagaaaaaaatgtttgttttcaagt aaagttaacattctatacattctacaaagggacttaaaccatcaaaacaaagagtggcttcctttcccagttatggacat gttcacagttatttatgttgccaattgacaccggaaaatataggaaaccattctgcataaaagttattttttgcaaacta ctagttattacgagcccctttccccttccatcacactgctatctcatgcaaacatctgtcattgttgcaatctgtgcata attctaaatcctaatgggggatgcttgttttgcgcataacctgattgcatgaatctacaccttatgataaaggaatatgt aaggctgttatggcttgttgaatacttccagtttggtattgtgtgtgagccacactatgaaatcatttgtcaatatttaa tttatggaacatgtgagatatttcagagccaaactagagccaatcctttccaggtcatgctcccatcccttttctttgtt ccttggtaaatatagctatctattttagttatggagtggccttctcaaacaaaacagaaaatctctttatatttcccttg ctggtttgtgcttataattgtaaaatattgacaagatgggctatgctactgcttggtagaaaaattaaatttggatgagc aattcagtctagcacgcaggaaaaacacagagtaaatgcttaaaaaaaggacattgagttgagtgggtatagaaattgaa taaataaataaaattacttgtggatatttcttagtgagggtgtttgccttcaaattaacatttgattcctggtgagtgtc tggataagtccttgcagttttcttgggaagttttttcagaagttgctgtccattgtctccttcttagggctgaaagtgac tggcatgaggtcacttaaatgttgacttcatgttgaagatgggattgaaactcatgacattttgatttctagattggtct cttaaccatctcatatagtttagaaaccaaactatatccaccgaaccagacatttaatccaatatgtaattattcctttt gtacgtactctttgctgggaattgtaaaaatcttaagtccagggaacatgagaagttacagtaactgcattccttttccc tggaatgttgtaaaatgatctcatatttggccaatattcattcgaaaagtgacatgattgtctttgccaagttgaagcag tttgcaatggcaactattgcaaatatgtatgatcagaccttctctgcttttatatcgtttcaaaagtaatgatccttggc tgttaaaatgctttgtttcaaagcttgggtcaatctcagaacaaaaatattaatgcctctggagactggaacaaaagatc aactgaagggtcatgcttagagctttgttttcaggacagattgaacgagatagcattcctaatagatgtagctacttcca tggttgatcataatttcactttatcaggagagtttatgatgacccatgtacagccggtttgctctttaactggtgccctt ctccctcttccccaatagtctctggttctaagaatgttttcaggatgtttttgctagaaatttattctagttgatttttg ttgatctatgcaaatttgtattgtatttttcttgtggggcaagctatttttgttaaatttggtttgcataagtcgtatat taaaaaaaactataatccttctattttgaaagactgtttattcaatagttgctgaatttttaaaataattatttcattat ttcatttttctttctataaaaatgtaagttgcttacttcatttaataactagtctatcctctattgtactagtaagggtt tactaaaagatctgtcgtactgattaatctgttttatgataatgtgaattagatgtttaaaatcatgacaggattttata tatttttttaaaaaaactttctgtgaaaacaaaggatgtgatacaatcttttttttaatacatatattttaagtaaaacc atcaacatgttaaatcattcaattttcttttgtttaggatgtttaattgtttcacaggattaaatgaagaaatgtccctt aaaaatatttcatatctctttcttaaaatacttggaatatcatctgttttgtcccatgacattattattaatgttttaaa taaatgttactgtatggttacattat |
|
Protein
| Protein ID | habu1_s8317_g18615.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>habu1_s8317_g18615.t1 MHIITMSGLLASVYSATESTMSSIDPFQQIMVEHQYSHKFIVTVKQAKNVTKGAFGDMLDTPDPYVELFIPTAPDSRKKT KYINNNVNPEWNETFEIILDPNQENILEITLMDANYVMDETIGTATFSISSLKIGEKKQVPFIINRVTEVILEVSLEVCS STDLRFSMALCDEEKHFRQQRKTRVMHHLNKLLGADLASIRDVPVIAVLGSGGGFRATVGFSGVMKALYESGILDCATYI GGLSGSTWYMSTLYSHPDFPAKGPKDINVELMNSISHTPLKLLTPQKVKRYIEVLWKKKRAGQPVTFTDIFGMLIGETLI QNRMDITLSHMREKINKAQSALPLFTCLHVKPDVSELMFADWVEFSPYEIGMAKYGTFMTPNLFGSKFFMGTVVKNYKEN PLHFLMGVWGSAFAILINRVLGLSNSHNKGPTMEEELENIRLRQIVSNDSDSDDESQGPKGSENPQADISHEQTSQESWV QRMFMALVGESALFTTREGRAGKVHNFMLGLNLNTCYPLSPFVGVSTQESVEDDEMDTAVTDPDEFDRIYEPLDVKSKKI HVVDSGLTFNLPYPLILRPQRGVDLIISFDFSARPSDSSPPFKEILLAEKWAKMNNLPFPKIDPNVFDREGLKECYVFKP KNPASEIDCPTIIHFVLANINFRNYKTPGVPRETQEEKDFADFDIFDDPDTPFSTFNFQYSKEAFSRLHDLMEFNTLNNL EIIKEAITDSIEYRRQNPSRCSVSLSNVEARRYFNKAKSNSRT |
|
| Protein ID | habu1_s8317_g18615.t2 |
| Definition | - |
>habu1_s8317_g18615.t2 MHIITMSGLLASVYSATESTMSSIDPFQQIMVEHQYSHKFIVTVKQAKNVTKGAFGDMLDTPDPYVELFIPTAPDSRKKT KYINNNVNPEWNETFEIILDPNQENILEITLMDANYVMDETIGTATFSISSLKIGEKKQVPFIINRVTEVILEVSLEVCS STDLRFSMALCDEEKHFRQQRKTRVMHHLNKLLGADLASIRDVPVIAVLGSGGGFRATVGFSGVMKALYESGILDCATYI GGLSGSTWYMSTLYSHPDFPAKGPKDINVELMNSISHTPLKLLTPQKVKRYIEVLWKKKRAGQPVTFTDIFGMLIGETLI QNLIGSWWEILPVQLTWQLSEEIRMDITLSHMREKINKAQSALPLFTCLHVKPDVSELMFADWVEFSPYEIGMAKYGTFM TPNLFGSKFFMGTVVKNYKENPLHFLMGVWGSAFAILINRVLGLSNSHNKGPTMEEELENIRLRQIVSNDSDSDDESQGP KGSENPQADISHEQTSQESWVQRMFMALVGESALFTTREGRAGKVHNFMLGLNLNTCYPLSPFVGVSTQESVEDDEMDTA VTDPDEFDRIYEPLDVKSKKIHVVDSGLTFNLPYPLILRPQRGVDLIISFDFSARPSDSSPPFKEILLAEKWAKMNNLPF PKIDPNVFDREGLKECYVFKPKNPASEIDCPTIIHFVLANINFRNYKTPGVPRETQEEKDFADFDIFDDPDTPFSTFNFQ YSKEAFSRLHDLMEFNTLNNLEIIKEAITDSIEYRRQNPSRCSVSLSNVEARRYFNKAKSNSRT |
|