Gene
| Gene Model ID | pfu_aug1.0_20319.1_47376 |
|---|---|
| Locus | scaffold20319.1 : 837 ... 15755 : - |
| To GenomeBrowser | scaffold20319.1:837..15755 |
| Genes list of scaffold | scaffold20319.1 |
| Synonym | pfu_aug2.0_1108.1_28064 |
Manual annotation
Hmmer Search for Pfam
| query | Total | ID | Target | From | To | Eval | Score | cEval | iEval | Score |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| pfu_aug1.0_20319.1_47376.t1 | 1 | 1 | NACHT | 101 | 262 | 5.3e-07 | 29.4 | 1.1e-09 | 4.2e-06 | 26.5 |
Transcript
| Transcript ID | pfu_aug1.0_20319.1_47376.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>pfu_aug1.0_20319.1_47376.t1 atgctcaatttggtggtctattataaaaaatatgaaacaaaggcggacgcgtcgtcacagcgtaagaaagacttaaccag acagactaaacaaacattgcatactgcaaggcaggcaactcagcaaacgccagactttgacataggaagctttaattatg atatgcctaaacatattgaagtcacacaaccaaaagacataattgatttcaagatagatggttatattactgaggaatat aacatgagagaagtaacagacccaaatgacatatttaaaaaagatggtaaatatgccagaaggatatacatgttaggaga tgctgcacacggtaaaaccacttactgtttatggctcttgcggaaatggtgtgatgctaaggaaaaggaaaggatgggac aggtagatttcgataagtgggaagaagaaatgagaagatttgattttgtctttctgattaagtttcgtaatattcatgac ccaaatctagtttcagttaaagatatgatctgccaggacgcatttgagagtgacatacactgtcatgatgccatacgttg cgtattatcatctgacgagtatcaaagttttataatcatggacggactggatgaatggtactcaaatagtgaaagcaaca tgccaaatattgacgtatctgggagtgtaacgtgctttatttcaatgagaccatgggtttttccgttattgttaaagaaa ccacaacacagtgacagagtaatagaaatccttggcttaagtgaaagtggaatggaaaatgttatcaagaatgtactgat aaaccgttatgaattgaatgaggactctccaaaatatacacatataaatgataaaatactgaaatatttagaagatgaca atgtaaaatctttgatgcagattcctttgttagctgttgtttgtgttcagatatggtatgaagggaaacaggttggggac ggtatgacaagtttttatgccgagatgttaaatatgttaatagagagagcacatgaaaaacatagaattgatataaaaca acatagaacagtaggtttcaattcccctgaaatcttttctgaacatgaaaatattgaaagctgtttttctgtgctgttaa agttagcgaaagtagcttatgaaggattgctatcttctgaaaccaacttagtatttcagaaaagaaaattagaaagagaa ataggagagagagaattgcagtttgccctagatgttggattgattagccaaaaagaagcacgcagtctcacaacgaagaa cgtaagtgttaatttctttcataaatccatacaagaattcttggctgtaatctacattgtgacaaacaaagatgttagtg actcattctgtaaaagaatgtccaatgttaactttattatggagttgtctaatgttattatgtttatatgtggtatgtgt ccgtctatgggtactgttatttcacagcgtgttgtaagtgttatagacagtgacacagagatctgtaaatacaggcaatc ggcaggaataaacattatattgagagaactttatagactgcaggtacgttgctataaagaattgaagtacagatggactg acagtccattgacatgccacgtatcagatatttatgttgatgaaaactgtgacatagaagcagcggtggtgacaagggaa ctcttttctgaccagagtgtagatataaggtcgctcgtgttattgtacgtacccactaacggaacgttgggtatcccaaa taaagagctaaatgagttcttgtctaacaaacacaacaacacaaggtcacttgttatggttgaaatcaatggtgatgaca ccgagaggtcacttcatcacatatctatacccacattaaagactttgtatctacataacgttaaaataaatattgacctt gacgttgctgctcggcctcctctgttaaaagacatggaatcactacaagtgtttggtcttgtgagaattactttagataa cagagaacttggaatgtcaaaattgacatcactacgtgtgttagtacttgatacggtaacattagttgacagagaactta ctttttccggtttgaaatcactacgtgagttacggctgtcacgtatgaccctgggtaagacaggacttgatctgtctgac gtgccttcattacatttgttaaatctatatatggtggacctgggcaacataggacttgatctgtcaccgttgacatcact gcgggagttactgctaaccgatgtgacactgggttacaaaggactgaatttgtctaacatgacacaattacgtgtgttac aactacgtgaggtgcttcttgttgacagaggactggatctaattgacttaacatcacttcgagagttacggctatatcat atagctctgggtaaaataggattagacctttcttatatgacatcacttcgtaaattactggtgtctcatgtgacccttga tgtccgaggtttgatgcttcatgcttgcatggttcatttagatgaggtacgattggtattcgttgatatgtcagcggaac aatggcaacagttcattctgtctgtgcttaacatacggcataaatttaatgttgtactgcgtgactccgtaattgattat gagtccaaaacaaagatccggtcagctcaagactacaatttaacacgggatggtgttggtaagcatggtaagtatatgtt tgatttcacaagagtatggccattgtaa |
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Protein
| Protein ID | pfu_aug1.0_20319.1_47376.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>pfu_aug1.0_20319.1_47376.t1 MLNLVVYYKKYETKADASSQRKKDLTRQTKQTLHTARQATQQTPDFDIGSFNYDMPKHIEVTQPKDIIDFKIDGYITEEY NMREVTDPNDIFKKDGKYARRIYMLGDAAHGKTTYCLWLLRKWCDAKEKERMGQVDFDKWEEEMRRFDFVFLIKFRNIHD PNLVSVKDMICQDAFESDIHCHDAIRCVLSSDEYQSFIIMDGLDEWYSNSESNMPNIDVSGSVTCFISMRPWVFPLLLKK PQHSDRVIEILGLSESGMENVIKNVLINRYELNEDSPKYTHINDKILKYLEDDNVKSLMQIPLLAVVCVQIWYEGKQVGD GMTSFYAEMLNMLIERAHEKHRIDIKQHRTVGFNSPEIFSEHENIESCFSVLLKLAKVAYEGLLSSETNLVFQKRKLERE IGERELQFALDVGLISQKEARSLTTKNVSVNFFHKSIQEFLAVIYIVTNKDVSDSFCKRMSNVNFIMELSNVIMFICGMC PSMGTVISQRVVSVIDSDTEICKYRQSAGINIILRELYRLQVRCYKELKYRWTDSPLTCHVSDIYVDENCDIEAAVVTRE LFSDQSVDIRSLVLLYVPTNGTLGIPNKELNEFLSNKHNNTRSLVMVEINGDDTERSLHHISIPTLKTLYLHNVKINIDL DVAARPPLLKDMESLQVFGLVRITLDNRELGMSKLTSLRVLVLDTVTLVDRELTFSGLKSLRELRLSRMTLGKTGLDLSD VPSLHLLNLYMVDLGNIGLDLSPLTSLRELLLTDVTLGYKGLNLSNMTQLRVLQLREVLLVDRGLDLIDLTSLRELRLYH IALGKIGLDLSYMTSLRKLLVSHVTLDVRGLMLHACMVHLDEVRLVFVDMSAEQWQQFILSVLNIRHKFNVVLRDSVIDY ESKTKIRSAQDYNLTRDGVGKHGKYMFDFTRVWPL |
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