Gene
| Gene Model ID | pfu_aug1.0_2276.1_44305 |
|---|---|
| Locus | scaffold2276.1 : 61719 ... 64765 : - |
| To GenomeBrowser | scaffold2276.1:61719..64765 |
| Genes list of scaffold | scaffold2276.1 |
| Synonym | NA |
Manual annotation
Hmmer Search for Pfam
| query | Total | ID | Target | From | To | Eval | Score | cEval | iEval | Score |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| pfu_aug1.0_2276.1_44305.t1 | 6 | 1 | DUF948 | 37 | 86 | 3.0e-11 | 43.0 | 0.00014 | 1.1 | 9.1 |
| pfu_aug1.0_2276.1_44305.t1 | 6 | 2 | DUF948 | 109 | 155 | 3.0e-11 | 43.0 | 0.002 | 15.0 | 5.5 |
| pfu_aug1.0_2276.1_44305.t1 | 6 | 3 | DUF948 | 139 | 183 | 3.0e-11 | 43.0 | 0.0027 | 20.0 | 5.0 |
| pfu_aug1.0_2276.1_44305.t1 | 6 | 4 | DUF948 | 205 | 261 | 3.0e-11 | 43.0 | 6.1e-06 | 0.045 | 13.5 |
| pfu_aug1.0_2276.1_44305.t1 | 6 | 5 | DUF948 | 287 | 329 | 3.0e-11 | 43.0 | 0.009 | 67.0 | 3.4 |
| pfu_aug1.0_2276.1_44305.t1 | 6 | 6 | DUF948 | 341 | 361 | 3.0e-11 | 43.0 | 0.14 | 1000.0 | -0.4 |
Blast Hit to nr / sp
| query | Subject ID | Subject Name | evalue |
|---|---|---|---|
| pfu_aug1.0_2276.1_44305.t1 | gi|224083177|ref|XP_002189670.1| | 4.0e-37 |
Transcript
| Transcript ID | pfu_aug1.0_2276.1_44305.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>pfu_aug1.0_2276.1_44305.t1 atgctgtacatgtatgtgatgatatttgataatgtatgttatgatgttgatgatgtatgtcatgatgttgatattgtatg ttatgatgttgttgatgtatgttatgatgttgatgatgtatatcatgatgttgataatgtatgttatgatgttgatgatg tatgtcatgatgttgatattgtatgttatgatgttgttgatgtatgtgatgatgttgatgatgtatgtgatgatgttgat gatgtatgtgatgatgttgattatgcatgttatcatattgatgatgtatgttatgatgatgatgatgatgatgatgatga tgtatgtcatgatgttgatgatgtatgtcatgatgttgatgatgtatgtcatgatgttgatagtgtatgttatgatgttg atgatgtattttatgttgatgatgtatgtcatgatgttgttgatgtatgccatgatgttgatgatatatgttatgatgtt gatgatgtatgttatgatgttgatgatgtatcttattatattgatgatgtatgtgaggatgttaattatgtatgttatga tgatgatgtattttgtgatattgatgacgaatgttatgatgatatcgatgatgtttgttactatgttgctgatctgtgtt atgatgttaatgatgtttgttatgttgttgatgatgtatgtcatgatgttgatgatgtatgtcatgatgttgatgatgta tgtcatgatgttgatgatgtatgtcatgatgttgatgatgtatgtcatgatgttgatgatgtatgtcatgatgttgataa agatgatgtttgttattatgttgctgatgatgatgaagtatgttatgatgttgatgatgtatgttatgatgttgatgtat gttataatgatattgatgatgtttgttattatgttgatgatttgtgttatgatgttgatgatgtatgttatgatgttgat gatgtatgttatgatgttgatgatgtattttatgttgttgatgtatgttatgatgttgatgatgtatgttatgatgttga taatgtatgttatgatgttgatgatgtatgttatgatgttgatgatgtatgttatgatgttgttgatgtatgtttagatg aagatttatttcattatgatgatgtatattatgaggatgatgatgatgtgtattaa |
|
Protein
| Protein ID | pfu_aug1.0_2276.1_44305.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>pfu_aug1.0_2276.1_44305.t1 MLYMYVMIFDNVCYDVDDVCHDVDIVCYDVVDVCYDVDDVYHDVDNVCYDVDDVCHDVDIVCYDVVDVCDDVDDVCDDVD DVCDDVDYACYHIDDVCYDDDDDDDDDVCHDVDDVCHDVDDVCHDVDSVCYDVDDVFYVDDVCHDVVDVCHDVDDICYDV DDVCYDVDDVSYYIDDVCEDVNYVCYDDDVFCDIDDECYDDIDDVCYYVADLCYDVNDVCYVVDDVCHDVDDVCHDVDDV CHDVDDVCHDVDDVCHDVDDVCHDVDKDDVCYYVADDDEVCYDVDDVCYDVDVCYNDIDDVCYYVDDLCYDVDDVCYDVD DVCYDVDDVFYVVDVCYDVDDVCYDVDNVCYDVDDVCYDVDDVCYDVVDVCLDEDLFHYDDVYYEDDDDVY |
|