Genome browser

OIST Marine Genomics Unit since 2008

Gene
Gene Model IDpfu_aug1.0_30755.1_19380
Locus scaffold30755.1 : 14 ... 7123 : +
To GenomeBrowser scaffold30755.1:14..7123
Genes list of scaffold scaffold30755.1
Synonym pfu_aug2.0_10.1_00033

Manual annotation
Blast Hit to nr / sp
query Subject ID Subject Name evalue
pfu_aug1.0_30755.1_19380.t1 gi|156365725|ref|XP_001626794.1| predicted protein [Nematostella vectensis] 9.0e-24

Expression profile
(Color code: FPKM>10&<50, blue; FPKM>50, pink)

Libraries EST count
>Embryonic/Larval stages
mix 1
>Adult tissues

Transcript
Transcript IDpfu_aug1.0_30755.1_19380.t1
Definition-
>pfu_aug1.0_30755.1_19380.t1
atggtgatggatgccctggtgatatatgtatgggccattgatgatatatgcttagaccaaggttatgtacgtatggaccc
tggtgatgtatgtatagaccctggtgatttatgtttagaccctggtgatgtatgtatgggccctgatgatatatgtttag
accctggtgatgtatatatagaccctggtgatgtatgtatgggccctgatgatatatgtttagaccctggtgatgtatgt
atggaccctggtgatgtatgtatagaccctggtgatgtatgtatggaccctggtgatgtatgtatggaccctggtgatct
atgtatggaccctggtgatgtatgtatagaccctggtgatgtatgtatggaccctggtgatgtatgtatagaccctggtg
atgtatgtatggaccctggtgatcaatttcaaatatgcaaacttgccatggacacttcagtgttgaaatatacaaggaaa
actaaagagcactataaaaaaaacaattag

Protein
Protein IDpfu_aug1.0_30755.1_19380.t1
Definition-
>pfu_aug1.0_30755.1_19380.t1
MVMDALVIYVWAIDDICLDQGYVRMDPGDVCIDPGDLCLDPGDVCMGPDDICLDPGDVYIDPGDVCMGPDDICLDPGDVC
MDPGDVCIDPGDVCMDPGDVCMDPGDLCMDPGDVCIDPGDVCMDPGDVCIDPGDVCMDPGDQFQICKLAMDTSVLKYTRK
TKEHYKKNN

  • MGU Home
  • Genome Projects
  • Information
  • Genome Browser
  • Blast Search
  • Keyword Search
  • Downloads

Gene ID:



Keyword:



  • Login

copyright © Marine Genomics Unit 2015
Okinawa Institute of Science and Technology
1919-1 Tancha, Onna-son, Kunigami-gun, Okinawa, Japan 904-0495