Gene
| Gene Model ID | pfu_aug1.0_465.1_00315 |
|---|---|
| Locus | scaffold465.1 : 11071 ... 15545 : - |
| To GenomeBrowser | scaffold465.1:11071..15545 |
| Genes list of scaffold | scaffold465.1 |
| Synonym | pfu_aug2.0_1299.1_31601 |
Manual annotation
| Study field | Biomineralization |
|---|---|
| Gene name | Aspein |
| Description | Blast best hit to ddbj AB094512 |
| mRNA evidence |
Blast Hit to nr / sp
| query | Subject ID | Subject Name | evalue |
|---|---|---|---|
| pfu_aug1.0_465.1_00315.t1 | gi|37991666|dbj|BAD00044.1| | shell matrix protein [Pinctada fucata] | 4.0e-13 |
Expression profile
(Color code: FPKM>10&<50, blue; FPKM>50, pink)| Libraries | EST count |
|---|---|
| >Embryonic/Larval stages | |
| mix | 1 |
| >Adult tissues | |
| mantle | 3 |
Transcript
| Transcript ID | pfu_aug1.0_465.1_00315.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>pfu_aug1.0_465.1_00315.t1 atgaaggggatagccattcttatgtgtcttgccgcgcttgtggcagtaagcgttactttcccagtggctgaccagacaac aaatgaactaggatcatcaggcgcagctgccgctggtgctgtagtatcggagcccagtgatgctggagatgctgcagacg caggagacgccgatgctgcagacgccgatgcagatgcggacgccgatgctgacgcagataatgatgacggagatgatgat gatgacgacgatgatgatagtggagatgatgatagcggagatgatgatgatagcggagatgatgatgatagcggagatga cgatgattctggagatgacgatagtggagatgacgatgacagtggagatgatgatggtgatgatgatagtggagacgatg atgatagtggagatgacgacagtggtgatggtgatgatggcgacagtggtgacgatgatgatgatgatgacagcggagat gatgatgatgatgatgatgatgacgatagcggagatgatgatagcggagatgacgatgatggtgatagtggagatgatga tagtggagatgacgacggtgacgatgatgacagtggagatgatgatagcggagatgacgatgatagcggagatgatgata gtggagatgacgatgatagcggaaatgacgatagtggagatgacgaaagcggagatgacgatagcggagatgacgatgat agtggagacgatgatagcggagatgatgatagtggagatgatggtgatgatgacgacagtggtgatgatgatgatagcgg tgatgatgatgatagcggagatgatgatgatgatgatgatgatgatagcggagatgacgatgatggtgatagtggagatg atgatagtggagatgacgatggtgacgatgatgacagcggagacgatgatagtggagatgatgaaagcggagatgatgat agcgaagatgatgacagcggagatgatgatagtgaagacgatgatagtggagacgatgatagtgatagtggagatgatga tagtggagatgatgacagtggagacgatgacagtggtgatgatgatggtgatgatggcgatgatgatgctgacagtggcg atgatgatgacgatgacgatgacgatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttaacctttcaatag |
|
Protein
| Protein ID | pfu_aug1.0_465.1_00315.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>pfu_aug1.0_465.1_00315.t1 MKGIAILMCLAALVAVSVTFPVADQTTNELGSSGAAAAGAVVSEPSDAGDAADAGDADAADADADADADADADNDDGDDD DDDDDDSGDDDSGDDDDSGDDDDSGDDDDSGDDDSGDDDDSGDDDGDDDSGDDDDSGDDDSGDGDDGDSGDDDDDDDSGD DDDDDDDDDSGDDDSGDDDDGDSGDDDSGDDDGDDDDSGDDDSGDDDDSGDDDSGDDDDSGNDDSGDDESGDDDSGDDDD SGDDDSGDDDSGDDGDDDDSGDDDDSGDDDDSGDDDDDDDDDSGDDDDGDSGDDDSGDDDGDDDDSGDDDSGDDESGDDD SEDDDSGDDDSEDDDSGDDDSDSGDDDSGDDDSGDDDSGDDDGDDGDDDADSGDDDDDDDDDXXXXXXXXXXXXXXXXXX XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXLTFQ |
|