Gene
| Gene Model ID | pfu_aug2.0_10.1_00033 |
|---|---|
| Locus | scaffold10.1 : 670829 ... 685633 : + |
| To GenomeBrowser | scaffold10.1:670829..685633 |
| Genes list of scaffold | scaffold10.1 |
| Synonym | pfu_aug1.0_30755.1_19380 |
Manual annotation
Annotation by Blast2GO
| Annotation | GO |
|---|---|
| dna polymerase beta | GO:0005615 GO:0006461 GO:0008584 GO:0021987 GO:0030294 GO:0030308 GO:0030502 GO:0031012 GO:0031100 GO:0043234 GO:0045780 GO:0046627 GO:0061099 |
Blast Hit to nr / sp
| query | Subject ID | Subject Name | evalue |
|---|---|---|---|
| pfu_aug2.0_10.1_00033.t1 | gi|696963588|ref|XP_009569789.1| | PREDICTED: DNA polymerase beta [Cuculus canorus] | 0.0 |
| pfu_aug2.0_10.1_00033.t1 | gi|699254923|ref|XP_009861551.1| | PREDICTED: uncharacterized protein LOC100176125 [Ciona intestinalis] | 0.0 |
| pfu_aug2.0_10.1_00033.t1 | gi|676489021|ref|XP_009064803.1| | hypothetical protein LOTGIDRAFT_176940, partial [Lottia gigantea] | 0.0 |
| pfu_aug2.0_10.1_00033.t1 | gi|565385993|ref|XP_006358829.1| | PREDICTED: extensin-like [Solanum tuberosum] | 2.00386e-43 |
| pfu_aug2.0_10.1_00033.t1 | gi|688618197|ref|XP_009294630.1| | PREDICTED: histone H3.v1-like [Danio rerio] | 2.0e-39 |
Transcript
| Transcript ID | pfu_aug2.0_10.1_00033.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>pfu_aug2.0_10.1_00033.t1 atgacatcttgtaacattaccgttaaaccaggggaaatttactatgaatccaaaatcacatcttttgtcacacaaacacc agaatgtatctctccgtttacagctttgacatttaagtccaaaaatgatgtttctgtgtttgaaatgtttgccctgccga gtgtcaactcttgcggacaaagtccattcctatatggttcaaaaacaggattgtcaatagtcagagtatcatctaggcac caagaaataccaacgagacatttaaaatcaaaaatcaaaatcaaaaacttttggagagttttggataatgttttattcca aaactctgctgatgtatgtataaaccctggtgatttatgtttagaccctggtgatgtatgtataaaccctggtaatgtat gtaaagaccctggtgatttatgtttagactctgctgatgtatgtatagaccctggtgatttatgtttagaccctggtgat gtatgtagagaccctgatgatgtatgtacagacactggtgatgtatgtttacacaaaggtgatgtatctatagaccctgg tgaagtatgtttaggccaagattatggatgtatagaccctggcgatgtaagtaaagaccctggtgaattatgtttagacc ccggtgatgtatgtatagacactggtgatgtatgtataggccatggtgatatatgtataggccatggtgatctatgtaca gaccctgctgatgcatgtatagaccctggtgatttatgtttggaccctggtgatgtatgtacagacactggtgatgtatt tatacaacgaggtggtggcatttatatagaccctggcgatgccctggtgatatatgtatgggccattgatgatatatgct tagaccaaggttatgtacgtatggaccctggtgatgtatgtatagaccctggtgatttatgtttagaccctggtgatgta tgtatgggccctgatgatatatgtttagaccctggtgatgtatatatagaccctggtgatgtatgtatgggccctgatga tatatgtttagaccctggtgatgtatgtatggaccctggtgatgtatgtatagaccctggtgatgtatgtatggaccctg gtgatgtatgtatggaccctggtgatctatgtatggaccctggtgatgtatgtatagaccctggtgatgtatgtatggac cctggtgatgtatgtatagaccctggtgatgtatgtatggaccctggtgataccctggtgatatatgtatgggccattga tgatatatgcttagaacaaggttatgtacgtatggaccctggtgatgtatgtatagaccctggtgatttatgtttagacc ctggtgatgtatgtatgggccctgatgatatatgtttagaccaagaacctggtgatgaatgtatagaccctggtgatgta tgtatagaccatcgtgttgtatgtatagaccctggtgatttatgtttagaccaaggtaatgtatgtatggaccctggtga tgtatgtatagaccctggtgatgtatatatagaccctgcttatgtatgtatagaccatggtgatttatgtttagaaactg gtgatgtatgtatagaccctggtaatgtatgtctagaccctagtgatgtgtgtatagaccctggtgatgaatgtttcgag cctggtgatgcatgtatagaccctggtgatatatgtttagaacctggtgatgtatgtttagacactggtgatgtgtgtat agacccttgcgatgtgtgtatagaccctagtgatgtgtatatacaccctagtgatgtattccgagaccctggtgatgtat gtataaacccgggtgatgtatgtataggtcctggtgatatatgtcaagaaccttgtgatgtatgtatagactctggtgat gtatgtatagaccctgatgatgtatgtataaacactggtgatgtatgtatggaccattctgatatatgtttagaccctgg tgatgtatgtatagaccctgatgattaa |
|
Protein
| Protein ID | pfu_aug2.0_10.1_00033.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>pfu_aug2.0_10.1_00033.t1 MTSCNITVKPGEIYYESKITSFVTQTPECISPFTALTFKSKNDVSVFEMFALPSVNSCGQSPFLYGSKTGLSIVRVSSRH QEIPTRHLKSKIKIKNFWRVLDNVLFQNSADVCINPGDLCLDPGDVCINPGNVCKDPGDLCLDSADVCIDPGDLCLDPGD VCRDPDDVCTDTGDVCLHKGDVSIDPGEVCLGQDYGCIDPGDVSKDPGELCLDPGDVCIDTGDVCIGHGDICIGHGDLCT DPADACIDPGDLCLDPGDVCTDTGDVFIQRGGGIYIDPGDALVIYVWAIDDICLDQGYVRMDPGDVCIDPGDLCLDPGDV CMGPDDICLDPGDVYIDPGDVCMGPDDICLDPGDVCMDPGDVCIDPGDVCMDPGDVCMDPGDLCMDPGDVCIDPGDVCMD PGDVCIDPGDVCMDPGDTLVIYVWAIDDICLEQGYVRMDPGDVCIDPGDLCLDPGDVCMGPDDICLDQEPGDECIDPGDV CIDHRVVCIDPGDLCLDQGNVCMDPGDVCIDPGDVYIDPAYVCIDHGDLCLETGDVCIDPGNVCLDPSDVCIDPGDECFE PGDACIDPGDICLEPGDVCLDTGDVCIDPCDVCIDPSDVYIHPSDVFRDPGDVCINPGDVCIGPGDICQEPCDVCIDSGD VCIDPDDVCINTGDVCMDHSDICLDPGDVCIDPDD |
|