Genome browser

OIST Marine Genomics Unit since 2008

Gene
Gene Model IDpfu_aug2.0_103.1_10268
Locus scaffold103.1 : 329652 ... 379044 : +
To GenomeBrowser scaffold103.1:329652..379044
Genes list of scaffold scaffold103.1
Synonym pfu_aug1.0_19.1_57917

Manual annotation
Transcript
Transcript IDpfu_aug2.0_103.1_10268.t1
Definition-
>pfu_aug2.0_103.1_10268.t1
atgatagtggacagtcttgaggaggcccttgattacttgcttcttttaagggttcatgaaattatgaacatcagtgttgg
agatatcgaaaatgtgaccgccaatcagagcactcagtggccatatttgttagccaattggcaccaaaaaacctttgtag
aggaccttgagtacttacttcctgtggtggagaacgtgataaatcctggtctttatgaagcagtccttacgtgttatgat
gtagctgggaatcaccgcagtgccaggaggattatccttgtggacgatctgtctgtcatagaaaccatagaatctaatcc
aattacagtccaaggtgcaagctcgaatgcaacaaactggtttgttcagcctgttaccatggtaacagtgtcttggacca
atcattttgagaatacaagacatataggcagtggctggctagaggcagtaggagattatcctggtattgagagaacatct
aaatatgatgacatcttctggactaggactgttgacgcaatgacacacgttaggggcattttggaattttccgtcaaata
tgaaatccggaattcatccggtgcagttaaacaatatcaggactaccaagtgacgcccgatcttaacgttcagacggaaa
ctttaatgggacttacgtggacagacggagatacgctggagatcacaatacaagccatggatgtcatgggtgagaaagca
caggaaggtatcacggtgtacagggacagcaccccaccgattatagaggacatatggctgatcaaggataatgtgtcaca
gatatatgttcacagcgtagaggaatttagtgaaatgacgattgaatggacggcatacgatgaacacagtctacttgata
taatggagtggaggttatatgatcatgcaaatgatacaatagaattcggacgggaagacatagctattccatatacgaat
gacagcgactgctccagtttatcaacaacgtatagctggacgtgttattgctcagctcaatggggctgtcagcataaaaa
cttccagataaaaccagaggtcaagctgtccggaggattgtacatggggatggacaaaggaattcatgattccgactact
acattgaggtcatagctaccaacaaggccaatttggtggcaacagccaggacaaagataaccatcgacacaacaggacca
catccgggatctgtgaatgacggaatggcgagtcaggacgaagtagattatcaacagacattagatctgaatggttattg
gagtggattctttgacagagaaagctctgtgatattctaccaatatggatttgccaacagatgtctagaggcttctgaat
tttcatccaatatttcagagaccacaaatattgaacagactacaacaaccaccgcaacaaccacaacagcagacggacca
ggaacctactatctgaccgtagtggccttcaacaaggcattgactccatcaattccggcctgttctgacggcgtcaccat
tgataatagtacctcatctataaaagaaatcagcatatcaaatgttagagtaaaaggtggactgataacggatgtcagtc
agacggatttttggatcctggatgagacttggagcagaaggaaagttgacggcccgacatcagactgcagttcaaaagct
acaacaatatcttatattgaccttataccggtagagagggatagaaatgataacatggttctcgtaaatggttccgtctt
ctgtaccaactcttctgctgctcctacaactttaagacccatcctaaccgtgtcgtctatgatcgatatagagtggatag
gagtggaaggtagtagcggtgtccatgactacgaggttggcatagcaactactgccgatagccctgcacctgacattatg
ggtttcaaatctacgaagcagcatccaaacataagatttccgcatgcagatcttcctacaggaagtctgttctatttcac
gtttaatacaattacgaaaactggaatacaaaccatacagagtattcagtgcataacggatactacagcacctgtgtttt
ctggtgccctaactctggatatgtctgggagctatctcatagccagctggacaataggggatttcaccgacccagaggac
ccgaatgactttgaatatgaatttgcgtttggaacttcccaatacagagctgacatgatgccatggcaaccccttacaac
aggaggcacgtgcgtcctgaccacgcccccttcctgtacagctatacagatatcagcattgaagtggtcacttcaaggtg
gtcattcttattacgcaacaatcaaagccacaaactttgcaggacttgtgacttctgttgtttccggaccttatacatat
gattttgggctgccatcagaaggggttgttatcgacatagatacgattagtgtgtcctctacaattccctataaagtagc
gggtgcggctagccaaacaggggactcttactcctcctgggcacctggtcccacttgtagcttgctagggaaccgtcggt
actctgttgtgagtgttgttgagattgttgtcaggatcttctttatctcattctattacctcttcccttcaaaggacata
gaagatatggactttcagacggataggacttctttggctgctcgttggtggggatttacacatcagtatctttcagttac
ttatgacgtcacaatcggtacgacgcctggagcagatgatgttctcactaggactagtgtaggaattaatttacaatatc
aagctacaggactgacgttatcagcaagaactacctactatttcacagtaacagctttgacatcattgaacaatgtaaca
gtaacttcagatggagtcacagcattggatgacacagagacaatagctatgaccataaatgatggagacaactgtagcat
gatagtggatacaacaaactccttattcacacaccatgatcaggataataggtttggctgtgctgcagacattgactatc
aaccgtctaccagctctgtccacgctcactggaccgttccagcgggatggacagatatcatccatgacgtgttcctatct
gtagaagaagaagatagttcgggtggaggcacttggaacacaatatatgactatgagtatctgtataacaaggactcaca
cagcgttaacaacttaaatctttctccgggcaaaacatatcgtgttaacttaaaaccgtgtgctggcacgacctgctttc
ctacactacagagtgacggggtgaccgtgctctcgtcaagaccagtgactggagccttgaatgttactcacttagatacc
agtgcaactggtacaaatgaaaaggttgaggttacatttacacgattcttcgacccggatgtaagcagtcttacgacgcg
atataccatgatagatcattatgaatatacaataacagacaactcgttactaggcaacactcatgtcacgtggacaacag
tctcgccaacattttcctccgatgtgggcacttttgacgttacattaagtggaacaatggacttctccaaatgtcgacgg
tttgttataaggggatataataaagccaggatatggtcaagcattagcgccgacattcaggactgtcaagcttttgaccc
catactcatctcgccaagatttatcgttgatgcaaggggacagtcagacagcactgatgacacaaaaggcagcggtgttt
acctagaggaaaacgctatatggtaccctgatgacgttgactacacaccgttcaaaaacgttctttccgccgtatggcat
tctgggagatattcatggtacacgtgggcagtggttaacgcccacacacttgatgtcaccacctactacgaacagctagt
acagctgaacttaacagatccatgttcacatcccgatgtagtacataacaaatgtgggaacacaacaaatgaatatatca
atgtattcttcaacgcaaatgaatacctggttcacggcgagcgatactccatctgtatccatgccaacgccgaaattctg
agactggaattatgggataatgttctaccagaaataagcatatgtacagacggagtcatggttgatttaacaagaccagt
ggcaggaaaagtatggataggaaacgttcaaggcattgaatatcagtcccatacctctgacatgtatgtgaactgggaat
cctacaaagatgtagagacgtttggcaccacacgtcacagcacagggatctcatactacactgtggcaataggtattatt
attaaaattattcaagattctaataaatctaatgagtctttaacttgtaaaggaacatcagagggaggaaatgacgtcat
tgatttcacagatgttggtgttgtaaaccacgcccatttcggcggtttaaccttgatgtcaggacggaagtactacgcct
cggttgtaggatacgattttgcgggtagaagtacaacaaaaacaacagatcctgtgatggtcgacgatagtgtgcctttg
aagtcaaacagtccgattacattgtcatatggaaggcatctgatctccaaatctgagatttcagcttgctggacaggtgt
attcacggatcctgagagcggggtcgcatactatgaatgggctataggttccagaccgggttataatgacaaaatggcgt
ccaccgttgtctacacgtcatgtgcgacatcgactgtgaattcttctctagacctagaagaagggcatgcctattacatc
aatgtcagggctttcaatcgagctggtctttcatcattggcatcctcatgggcatacatcctcgacctatcaccgcctgt
ccccggtcgtgtctatgatggagaaagagcagttaacagctcgtcatactttgatgaagattacaaaaatcacacaaatt
tcttggcagcgttttggacgggcttccatgatcctcattctaccattacggactattacgtcagcattggcacctgcaaa
acgtgtcaaaacatcctggctagacaacctatgggaataactgaagattttaagctgacaaaattcaacctggcttttgg
ggtaatttattatacaacagtatccgcatgcaatactgcagacttgtgttccagcactacatccgatggtgttatgatag
atgtaagtccgccttcacctggaagagtgttcgatgggatgagtaccgatgatattgaatatcagggttcagggtcctac
attggagcaagatggtatggattctctgattcacagtctggtatcgagagatatgtatggaaagtcggtacaacagaggg
tggagaagacatagtagaacagacagacctacacttggatacgtacgtcctcagcacaaatgtgactcttcctgcaggtg
aaaggttgtttacaacgattggatgctataacatggcagctaaaacactaatgagagattatttgttaaagataaatgga
attttgcggtactacatctttagtggcctagatctccatgatggcgtggcttactatgtaagtctgatatgctgtaacgg
ggctggcttgtgttcaaatgctacatctccctcaattataatggactcgtcctctccttcaagaggtatgtttgcagtac
aaaccgaacacgctgctgatcttacccggtatctcactacatggatgacttggacgttagagagtttaagtctcgcttgg
ctgggttttagcgatctacataccggaatagattactatggcatcaatgtgggttctacattcattggaaatgacttgaa
tgagataacagaccaagcgtacaccgtttaccataacaacactggtgtagacagaggtgatgagggcattcttcagacca
gtcgcattacaactcagtcgctcttgacagtcaacgatattttcattcatctgtgggcagtcaataaggctggtctgagc
agtccaatcatccataatcagtttacaaaagcagcagatggctcattggtattggtccgaaggtgctccgcccacacatg
tgacggtcactgcgtctgcgcaccacaggatcaacgatgtcaaataacaactacctgtaataatgatacagcagcaagat
caaattcatatatagaagtaactgacatattgggaacaggacttgttgatgctacctatacaccttccgttaccgttctt
agagcatcatgggaaattatactgatacagaatcttcaaccactttggtatgagtggagtgttggactggaatcaggtac
ctcacctcttggccttatagatatgtcagaggagagagtgtggcacgatgtaggaagagaaacaaaaataaccttcataa
cttctaaagacatacctatggtcgaggggatgaagtacagtgtatttgtaagagtttggtatagtactaacacttttggc
gatttcaagtcagatggggtgattgtgcagactgaagagccaaggacaactgtattggctggtgcagctattacggaggt
tgagcgttatagcagacgtaaggacatggattatatgacctaccaggctccaatcactatatcctggacaaacaaattcc
taaatgtaaatactgacatctcagaattcagggtctatatcagctctttccaaggaggacacgacagtggtttaccagag
gctagtctggggcagcaagtgtcaacctacaccttgataaatcataatttacctacccggaagcgtttctatagtaacgt
gatagccttcaatcacgtgggaatgtatgtcacagaatcatctgatggattcacttttgatggagatgctcccgtggctg
gctcagtaattgacggactaggtcttcaagatatcgactttcaaaatgacgtcacgtttgttggagcgcgttggcatgga
ttcgtagatctaggatcaagtatacatttctacacatggtgcgtcggctccacttcagtaacaactggtggcgacgtgtg
tgatattgtcaatgcgacaaacgttggtttacacacgtcataccaggcaaacctgccccccggttctcctacttgcatgt
acaataaagttaatgcaacagacgttactggatatacatcagccatggttgtgtcgaacggtatgtgcatcgatacaagc
gtaccgattcctgagtttcaaactgttgtccatgataatgtgctcgaaaactcaaacttcactgaagctgttaatacgat
accctacaacgatcttaactcaactgatacctgtcaaatgtcagcaagctacaatccaggcatgtggactgaaaacaccg
gaagttgcgctgtagttgtagaatccggttttgcgaaatccggaagtaattttttgtatgttataggatcgttttctcaa
gttgtagcacttgatgaaggattgtacaaactgactttcgtcacaagtcatggattaattgatgtggcagagcatgctaa
caaagaaggattcgtgcaactaggagaacaaaaccacgtgtttttgatatacacaaaagcctatcgttcagacgaagcaa
caacggcaagtggtagagactcagtggtgtggcacaaccacacgttctatttcaggaccgattctgccagctcatacaat
gtgacaataggctccgtcgacttctcaacaggtttcttcgttgacgatattcaactccattttgtaaatacaagcaactc
tggtacgcagactgatcacgtgatgggtcacatggtattcctacatgaatggtcgtctatccacgggtcgtggagtttta
tttcggatggtcatgtggacataattgattattcctgggctataggttatgtaccatatggaacccagctccaggactac
accagtacaggactgaaacagtatggatgtaataataatgtaacattggtacaaaacagtagtttatatattaccgtcgt
tgccaccaatagcttgggtaatagaggcatagcagtgtctgagagagtcttcattgatatgacacctcctacgatctctg
aagtcaatgatggcacggggctggatgaagattatagtgaaataactacagtatttgtcaactaccaagcggaagacttt
gattcagcaatagacttttgtgaatgggccattggatactcatcgaatggaattgaaattcagccatttatgaccatttc
atcctattctggtgccgtgaccatcgggattgatcaagctgagggtcacaccatatacagcaccatacgatgcaccaaca
aggccggtttggttgcttccaactcctcagatggtatcaagatcagccatatggcacccaatgcttcacaagcacagata
acacatatacctttatcgactactcaataccgacctttggacgggtttcagggagtaaataataccattaagctctactg
gtcaggatttacagatactctaggaatcacgcaacatgtgatttatgttgatctcagtaacgtttcaactcacataacca
aagggatgaccttctccgagaatcaaatagtaaaatattctttattttctaaccttacactatatcaaggagttcaggct
atagatctgtatgcaagaaatattcttgggattccaagtgataccgtctcatacaactttacattacttttggagaggcc
agaaattcaagctaatagcacaccaaatataacctggaatcaagcggccacagagttcacagtagattggacagatattt
ttacatcgccgtatgaactaagatacgaagtttctgcaggactcgcagaaggtggcgccgaaatattacaatggcaggaa
acaacaaattctactctagtgtttggaatgccgtcacacgttgacgattattccggatccgttgtttacatgcatattcg
tgctatagcagcaggtggtttttataatgatataaaaggaacagtgacgttaccgtaa

Protein
Protein IDpfu_aug2.0_103.1_10268.t1
Definition-
>pfu_aug2.0_103.1_10268.t1
MIVDSLEEALDYLLLLRVHEIMNISVGDIENVTANQSTQWPYLLANWHQKTFVEDLEYLLPVVENVINPGLYEAVLTCYD
VAGNHRSARRIILVDDLSVIETIESNPITVQGASSNATNWFVQPVTMVTVSWTNHFENTRHIGSGWLEAVGDYPGIERTS
KYDDIFWTRTVDAMTHVRGILEFSVKYEIRNSSGAVKQYQDYQVTPDLNVQTETLMGLTWTDGDTLEITIQAMDVMGEKA
QEGITVYRDSTPPIIEDIWLIKDNVSQIYVHSVEEFSEMTIEWTAYDEHSLLDIMEWRLYDHANDTIEFGREDIAIPYTN
DSDCSSLSTTYSWTCYCSAQWGCQHKNFQIKPEVKLSGGLYMGMDKGIHDSDYYIEVIATNKANLVATARTKITIDTTGP
HPGSVNDGMASQDEVDYQQTLDLNGYWSGFFDRESSVIFYQYGFANRCLEASEFSSNISETTNIEQTTTTTATTTTADGP
GTYYLTVVAFNKALTPSIPACSDGVTIDNSTSSIKEISISNVRVKGGLITDVSQTDFWILDETWSRRKVDGPTSDCSSKA
TTISYIDLIPVERDRNDNMVLVNGSVFCTNSSAAPTTLRPILTVSSMIDIEWIGVEGSSGVHDYEVGIATTADSPAPDIM
GFKSTKQHPNIRFPHADLPTGSLFYFTFNTITKTGIQTIQSIQCITDTTAPVFSGALTLDMSGSYLIASWTIGDFTDPED
PNDFEYEFAFGTSQYRADMMPWQPLTTGGTCVLTTPPSCTAIQISALKWSLQGGHSYYATIKATNFAGLVTSVVSGPYTY
DFGLPSEGVVIDIDTISVSSTIPYKVAGAASQTGDSYSSWAPGPTCSLLGNRRYSVVSVVEIVVRIFFISFYYLFPSKDI
EDMDFQTDRTSLAARWWGFTHQYLSVTYDVTIGTTPGADDVLTRTSVGINLQYQATGLTLSARTTYYFTVTALTSLNNVT
VTSDGVTALDDTETIAMTINDGDNCSMIVDTTNSLFTHHDQDNRFGCAADIDYQPSTSSVHAHWTVPAGWTDIIHDVFLS
VEEEDSSGGGTWNTIYDYEYLYNKDSHSVNNLNLSPGKTYRVNLKPCAGTTCFPTLQSDGVTVLSSRPVTGALNVTHLDT
SATGTNEKVEVTFTRFFDPDVSSLTTRYTMIDHYEYTITDNSLLGNTHVTWTTVSPTFSSDVGTFDVTLSGTMDFSKCRR
FVIRGYNKARIWSSISADIQDCQAFDPILISPRFIVDARGQSDSTDDTKGSGVYLEENAIWYPDDVDYTPFKNVLSAVWH
SGRYSWYTWAVVNAHTLDVTTYYEQLVQLNLTDPCSHPDVVHNKCGNTTNEYINVFFNANEYLVHGERYSICIHANAEIL
RLELWDNVLPEISICTDGVMVDLTRPVAGKVWIGNVQGIEYQSHTSDMYVNWESYKDVETFGTTRHSTGISYYTVAIGII
IKIIQDSNKSNESLTCKGTSEGGNDVIDFTDVGVVNHAHFGGLTLMSGRKYYASVVGYDFAGRSTTKTTDPVMVDDSVPL
KSNSPITLSYGRHLISKSEISACWTGVFTDPESGVAYYEWAIGSRPGYNDKMASTVVYTSCATSTVNSSLDLEEGHAYYI
NVRAFNRAGLSSLASSWAYILDLSPPVPGRVYDGERAVNSSSYFDEDYKNHTNFLAAFWTGFHDPHSTITDYYVSIGTCK
TCQNILARQPMGITEDFKLTKFNLAFGVIYYTTVSACNTADLCSSTTSDGVMIDVSPPSPGRVFDGMSTDDIEYQGSGSY
IGARWYGFSDSQSGIERYVWKVGTTEGGEDIVEQTDLHLDTYVLSTNVTLPAGERLFTTIGCYNMAAKTLMRDYLLKING
ILRYYIFSGLDLHDGVAYYVSLICCNGAGLCSNATSPSIIMDSSSPSRGMFAVQTEHAADLTRYLTTWMTWTLESLSLAW
LGFSDLHTGIDYYGINVGSTFIGNDLNEITDQAYTVYHNNTGVDRGDEGILQTSRITTQSLLTVNDIFIHLWAVNKAGLS
SPIIHNQFTKAADGSLVLVRRCSAHTCDGHCVCAPQDQRCQITTTCNNDTAARSNSYIEVTDILGTGLVDATYTPSVTVL
RASWEIILIQNLQPLWYEWSVGLESGTSPLGLIDMSEERVWHDVGRETKITFITSKDIPMVEGMKYSVFVRVWYSTNTFG
DFKSDGVIVQTEEPRTTVLAGAAITEVERYSRRKDMDYMTYQAPITISWTNKFLNVNTDISEFRVYISSFQGGHDSGLPE
ASLGQQVSTYTLINHNLPTRKRFYSNVIAFNHVGMYVTESSDGFTFDGDAPVAGSVIDGLGLQDIDFQNDVTFVGARWHG
FVDLGSSIHFYTWCVGSTSVTTGGDVCDIVNATNVGLHTSYQANLPPGSPTCMYNKVNATDVTGYTSAMVVSNGMCIDTS
VPIPEFQTVVHDNVLENSNFTEAVNTIPYNDLNSTDTCQMSASYNPGMWTENTGSCAVVVESGFAKSGSNFLYVIGSFSQ
VVALDEGLYKLTFVTSHGLIDVAEHANKEGFVQLGEQNHVFLIYTKAYRSDEATTASGRDSVVWHNHTFYFRTDSASSYN
VTIGSVDFSTGFFVDDIQLHFVNTSNSGTQTDHVMGHMVFLHEWSSIHGSWSFISDGHVDIIDYSWAIGYVPYGTQLQDY
TSTGLKQYGCNNNVTLVQNSSLYITVVATNSLGNRGIAVSERVFIDMTPPTISEVNDGTGLDEDYSEITTVFVNYQAEDF
DSAIDFCEWAIGYSSNGIEIQPFMTISSYSGAVTIGIDQAEGHTIYSTIRCTNKAGLVASNSSDGIKISHMAPNASQAQI
THIPLSTTQYRPLDGFQGVNNTIKLYWSGFTDTLGITQHVIYVDLSNVSTHITKGMTFSENQIVKYSLFSNLTLYQGVQA
IDLYARNILGIPSDTVSYNFTLLLERPEIQANSTPNITWNQAATEFTVDWTDIFTSPYELRYEVSAGLAEGGAEILQWQE
TTNSTLVFGMPSHVDDYSGSVVYMHIRAIAAGGFYNDIKGTVTLP

  • MGU Home
  • Genome Projects
  • Information
  • Genome Browser
  • Blast Search
  • Keyword Search
  • Downloads

Gene ID:



Keyword:



  • Login

copyright © Marine Genomics Unit 2015
Okinawa Institute of Science and Technology
1919-1 Tancha, Onna-son, Kunigami-gun, Okinawa, Japan 904-0495