Gene
| Gene Model ID | pfu_aug2.0_589.1_30947 |
|---|---|
| Locus | scaffold589.1 : 98686 ... 125902 : + |
| To GenomeBrowser | scaffold589.1:98686..125902 |
| Genes list of scaffold | scaffold589.1 |
| Synonym | pfu_aug1.0_20326.1_40226 |
Manual annotation
Hmmer Search for Pfam
| query | Total | ID | Target | From | To | Eval | Score | cEval | iEval | Score |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| pfu_aug2.0_589.1_30947.t1 | 2 | 1 | Y_phosphatase | 1763 | 1993 | 0.0 | 381.1 | 0.0 | 0.0 | 270.3 |
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| pfu_aug2.0_589.1_30947.t1 | 2 | 2 | Y_phosphatase | 2066 | 2268 | 0.0 | 381.1 | 1.3e-35 | 2.4e-32 | 112.1 |
| pfu_aug2.0_589.1_30947.t1 | 2 | 2 | DSPc | 2202 | 2258 | 3.6e-10 | 39.5 | 5.7e-07 | 0.0011 | 18.6 |
Blast Hit to nr / sp
| query | Subject ID | Subject Name | evalue |
|---|---|---|---|
| pfu_aug2.0_589.1_30947.t1 | gi|390342759|ref|XP_001181407.2| | 0.0 |
Transcript
| Transcript ID | pfu_aug2.0_589.1_30947.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>pfu_aug2.0_589.1_30947.t1 atgacttgcaattctggttgtgacagttctggttgtaacagaaccactggttattgttctgggtcgtgtgacatcggtcg atttgggaacatgtgcgacatgaattgtaacattaattgtgatgactctggatgtggtaggagtaatggttattgtacag gtaactgcgatgctgggcattatggtccagactgtagtcaagattgtagccaatactgtaaaactggaacctgtgataga aatgcggggacttgtgctgagtgtatagtcggttattatggcgccttctgtaattctacatgtgacaaatgtgacagtag tggctgtaaccaagcacaaggcaagtgtattggttcatgcttagctggttatcacggtgagaaatgcgacaaaacttgca gtaataattgcgctactgtagtttgtgataaggcggcaggggcttgctcttcatgtaaagagggatttttcggttctcag tgtcaatcatcttgtagctcgttttgtatttcgaatcgatgtgaacaggatgatggtgtgtgtacgtatgactgccccaa ttccttttttggcgatttctgcaacaaatcttgtgataccaactgtgcgagcaacaaatgcgatcgtacttctggcgcat gcgttgatggatgtgatgatgggtatttcggtcagttttgtcagcagctttgtaatgctaattgtgacacgggcacctgt gataaggtcacaggagattgtcgaggcgattgcaagctcggattttacggatcacaatgtgatgtcgtgtgtagcaatca atgccaaactggttgtgataaaactagtggttactgtattggtaattgtaaaatcggaagatatggtttcttctgcgagg taatgtgtcctcaaggttgtagtgatgccgattctacatgcgaacgccaaactggtacatgtctcggtggttgtgacttt 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gagccatcctgccaccgaacgtctggtgcctgttttagcggttgtcagattggctactttggtgaaaaatgcactggtgt gtgtagcaccaactgctttcgacagaattgtgttggaataagcacaaactgctcagaaggttgtgtcattggaaagtatg gatctgactgcgcgtcagagtgttcgaaaaattgtgtcggtaatgtttgtgaacgcgaatctggaagatgttcgtccggt tgtttaccaggatattacggatctctctgtgacagatcatgcacgaatattggatgtatcaacggtccatgtgaaagaga aacaggtgcatgtgtagctaattgtataattggttactatggtgattactgtaatatcacatgtatgacatgtgacaatg atggatgtgacagacagtcaggtcgatgtcttgccggatgtcaggatggctggtacggggagcagtgtgaccgccaatgt aacgtcctttgtcacatgaaaaagtgtgaaccaaactcaggagattgtttgggatgcaacgctggattgtacgggaccaa ttgccaattgtcatgcagcgcatgccttagcttcagtaatggaagttctaattgcttacagagcaacgggaattgtctga atggttgcattacaggatactttggactgagctgttctggaatatgtaatcaaaactgcaagggaagtagatgtgggaca agttcctcagattgtgtagatgggtgtgaaaatggataccacggcgagaattgtcagttggcatgcggtgtcaactgtgc atcgaatgtctgcagtcagtcagatggacgatgtctcacgggatgtaagagtggatattacggttcttcatgtcagaata catgtagtacaagttgcatatctggagtctgtgaccagagtaccggcgattgcagtgcttgtgcgatgagttactatgga ccaacctgtgcaaacaggtgcaacagcaactgcattaaccgagactgtgatcaggaaggaacatgcaaacagggatgcat gaatggatattggggtgacatgtgtgataaagattgtggcggttgtgataactgcgagagagactttgggtgcacaggat gtcctgacggaaaatgggggtctacctgccaaagtgactgtagtacaaactgtctgcgttctaccacgggacagcttacg tgtaacagagatgatggctcatgcgcatgtgttgaaggttactacggatcattgtgtaatatggcttgcaataacaacgc taattgtgttggcaacgcttgtctccagattgctggtacatgtgcaggtaattgtgttaacggatactacaggccaaact gtgacgaaagttgccctacgcaatgcaaaaaccgagcatgtgaccgtatctctggtgactgcacccttggatgcaataat ggatactatggatctaaatgtgatttctcctgtgtcaatggttgtggcgtatgtaattttcagactggggcctgtgaatc gtgtgggacaaatcgttacggagatcaatgtcagtacacttgtagtgtaaattgtaattcaccttcgaactcagtaaaga tatgtcatgggcagactggtcactgtaattacaactgcaaagcaggttggtatggactgacttgcgacaccagatgtgaa ggatattgcaaggacaatacttgtgataggaatactggaaggtgtccgggtgattgcctcctcggttggtatggtgtaaa tgtttgtaaccaatcttgtgcaaattgtgttgctgtcggaggaactgcttgtgaaaaggacacaggacgttgtatccacg gctgtgccgatggcttccacggacagcgttgtacagatagctgcagtagtgcagcggcggtaacaggagacgatacgtca tctagtaacttagtcctaattgtgggcgtatcttgcgccggaggagtggttctcttgatcatcattataggcgtggcttg ctgtcagagacgtcaatcaaggcaccaacacaaaaagcgaatgatcttggaaatgggaaacggtaatggatggacctttg acgacgaacgaatgtctgacccgaatcaaatacgttacgagaaaatgagtgccttgaactactctgtcaatggaagttct caacattataatggtatttctcttgaccagaacttcgactctgatggcaacgaatctaatagaaatctaggagcatacaa agtcaaagacgatgtgtatgtgacagttagcgcggaggtggttccagttgaccagtttccaaaatatgtagccagactga ccgcaacggatatggcatttcaaaatcaacacgagagtcttccaactggactgacggatacacacgaagaagctctgaaa ctagaaaaccatagtaaaaacagatacaaaaacatatatccatatgacaatagcagggtaatactagagacagatgagga tcaagtggattctggcatggattacattaatgcttctagaatagaagggtttgaatcttcaaaaacatatattgcagccc aaggtccgacagaacatacagtggacgatttctggcgcatgatctggcaggaagtatgcagtaatattgtcatgctcact aactcagtagagggaggggtcatgaaatgtaagaaatattggccagaagagaaacagatggagacgtatggaaaaattac cgtcacaaataattataaggaggaatacgctgacttcaccattacgaatcttactgtgatgaatagcggagggaagttgg aggtacgtcatcttcactttacgtcatggcccgacaaggacgttccgcagtacgtcacgcccatggttgagtttagtcaa aaagttcgtagctacatcgacgataccccgcttcttgtgcattgcagtgctggtattggtagatcgggaacttttatagc gctggacaaactcttagatcaagctgcatcagaagatagggtatcagtgtatcaatgtgtattaaatatgaggaaagaga gagtcaatatgatacaaacagcggaacagtacaagtttcttcatgaggctttattagaagcgatccaatcaaggaatata acggtgactcgggaggagttccgtcaatattttgattcaatgatggagtacactccgggttcttccgaaagaaaactcga caaacagttcaagagaattaaatcatcatcggaccacattaacacagaggcagcattgttgccggagaattcccacaaaa atagaaatcaaaatattttagcatcggatgattgtagaaattaccgtaatagatatgcctatataataactgagatgccc cagtacaggactttgattgacttctgtcgtctggttcaccaggaggagtgtcgtaccattataaatatggatctggaaga aggagatgagtctgaggacagcggtaaatattggacagagaccaatcagatgtctgaggacagcggtaaatactggacgg aaaccaatcagagtgtagggtgtggtccgttccagatgatcgtcactgataccaaaactaaagggaactttatatgtaga tctatagacttcaagtataacgttgggtaccaggtcacgtgttggccacgtgaatgccctgccccctcgtccgcggaggc tctcattgatctcatacatgacgtagcagggtggcaggacctgtccgggaaccacccaattcttgttcattgcatgaatg gtgcttatagaagtgggcttatgtgccttgccctgacttgctgtgatcgtctaaggacggacggggacgtgtgtgtccct cacgccctcagtcatctccgtgcccgcaggccacaggtggtgccctactttccacaatacaaattttgccatgaagtcat aaccaagttcatagagaaaggggaatga |
|
Protein
| Protein ID | pfu_aug2.0_589.1_30947.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>pfu_aug2.0_589.1_30947.t1 MTCNSGCDSSGCNRTTGYCSGSCDIGRFGNMCDMNCNINCDDSGCGRSNGYCTGNCDAGHYGPDCSQDCSQYCKTGTCDR NAGTCAECIVGYYGAFCNSTCDKCDSSGCNQAQGKCIGSCLAGYHGEKCDKTCSNNCATVVCDKAAGACSSCKEGFFGSQ CQSSCSSFCISNRCEQDDGVCTYDCPNSFFGDFCNKSCDTNCASNKCDRTSGACVDGCDDGYFGQFCQQLCNANCDTGTC DKVTGDCRGDCKLGFYGSQCDVVCSNQCQTGCDKTSGYCIGNCKIGRYGFFCEVMCPQGCSDADSTCERQTGTCLGGCDF KKYGSFCNMTCDNCDDSECDDTNGICKADCLVGYYGSKCEDRCNIACLDGCNKQTGNCNRCPVGKFGSTCSKSCSTCGNG CNIISGLCNGGCQVGHHGLYCSNPCNQNCDSTGCIQTTGRCLKCRDGFHGDDCQQQCNGNCVGLVCDRSTGSCINPCVTG RFGPFCTDICGSTCIGVCERVGGTCSACQDGYHGRYCNESCPVNCLTGVCTIDDGFCAGACTVGYYGEYCSLKCSSYCSS VCNKTTAYCIGDCKVGRYGNLCEEACSGNCLGNVCNRTNGVCSTGCNSGYYGNYCNQTCLNCDSQGCVRNSGLCKGSCKT GYHGDMCNNQCSSTCDGQLCSKATGTCQACLVGWYGDRCTMQCSPYCVDSICLQSSGACTKGCATGFYGSKCDRACVGCA QCAADSGICSSCPVGKYGSNCSLNCSPNCNLSPSGSLLCNQNDGTCAYQCKNGWWGPQCDKTCNNSPNCNGIACDTYTRS CVGSCVAGWHGDFCTLSCNANCRNSACNQTNGACADGCNLGYYGNQCELRCHDGCQACERAVGQCLQCLPSKYGNTCQFD CNSNCIDLSDGSNVCNKDNGTCNAGCVMGWYGSSCSEKCVGFCHDSSCNRNAGVCDVKCKVGYFGIYCNESCNNCIATSF EPSCHRTSGACFSGCQIGYFGEKCTGVCSTNCFRQNCVGISTNCSEGCVIGKYGSDCASECSKNCVGNVCERESGRCSSG CLPGYYGSLCDRSCTNIGCINGPCERETGACVANCIIGYYGDYCNITCMTCDNDGCDRQSGRCLAGCQDGWYGEQCDRQC NVLCHMKKCEPNSGDCLGCNAGLYGTNCQLSCSACLSFSNGSSNCLQSNGNCLNGCITGYFGLSCSGICNQNCKGSRCGT SSSDCVDGCENGYHGENCQLACGVNCASNVCSQSDGRCLTGCKSGYYGSSCQNTCSTSCISGVCDQSTGDCSACAMSYYG PTCANRCNSNCINRDCDQEGTCKQGCMNGYWGDMCDKDCGGCDNCERDFGCTGCPDGKWGSTCQSDCSTNCLRSTTGQLT CNRDDGSCACVEGYYGSLCNMACNNNANCVGNACLQIAGTCAGNCVNGYYRPNCDESCPTQCKNRACDRISGDCTLGCNN GYYGSKCDFSCVNGCGVCNFQTGACESCGTNRYGDQCQYTCSVNCNSPSNSVKICHGQTGHCNYNCKAGWYGLTCDTRCE GYCKDNTCDRNTGRCPGDCLLGWYGVNVCNQSCANCVAVGGTACEKDTGRCIHGCADGFHGQRCTDSCSSAAAVTGDDTS SSNLVLIVGVSCAGGVVLLIIIIGVACCQRRQSRHQHKKRMILEMGNGNGWTFDDERMSDPNQIRYEKMSALNYSVNGSS QHYNGISLDQNFDSDGNESNRNLGAYKVKDDVYVTVSAEVVPVDQFPKYVARLTATDMAFQNQHESLPTGLTDTHEEALK LENHSKNRYKNIYPYDNSRVILETDEDQVDSGMDYINASRIEGFESSKTYIAAQGPTEHTVDDFWRMIWQEVCSNIVMLT NSVEGGVMKCKKYWPEEKQMETYGKITVTNNYKEEYADFTITNLTVMNSGGKLEVRHLHFTSWPDKDVPQYVTPMVEFSQ KVRSYIDDTPLLVHCSAGIGRSGTFIALDKLLDQAASEDRVSVYQCVLNMRKERVNMIQTAEQYKFLHEALLEAIQSRNI TVTREEFRQYFDSMMEYTPGSSERKLDKQFKRIKSSSDHINTEAALLPENSHKNRNQNILASDDCRNYRNRYAYIITEMP QYRTLIDFCRLVHQEECRTIINMDLEEGDESEDSGKYWTETNQMSEDSGKYWTETNQSVGCGPFQMIVTDTKTKGNFICR SIDFKYNVGYQVTCWPRECPAPSSAEALIDLIHDVAGWQDLSGNHPILVHCMNGAYRSGLMCLALTCCDRLRTDGDVCVP HALSHLRARRPQVVPYFPQYKFCHEVITKFIEKGE |
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