Genome browser

OIST Marine Genomics Unit since 2008

Gene
Gene Model IDpfu_aug2.0_64.1_13528
Locus scaffold64.1 : 544725 ... 582221 : -
To GenomeBrowser scaffold64.1:544725..582221
Genes list of scaffold scaffold64.1
Synonym pfu_aug1.0_4321.1_01698

Manual annotation
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Transcript IDpfu_aug2.0_64.1_13528.t1
Definition-
>pfu_aug2.0_64.1_13528.t1
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Transcript IDpfu_aug2.0_64.1_13528.t2
Definition-
>pfu_aug2.0_64.1_13528.t2
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cataggagtgtaa
Transcript IDpfu_aug2.0_64.1_13528.t3
Definition-
>pfu_aug2.0_64.1_13528.t3
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gatccaaacaacatgccacagtctcctatatatacctggaattgtgcaaaggagtcggagcccaaccttcctgtgtatgt
gacggtgaataacgagaggaggatgttagaggagtatgtcagacccgcatcagactccgataactctataaccataccgg
aaaatactctacctctgggaaggtatatttggacaataaagatgttgaaagacattcggtctgtctctatgtccaccatt
atggaggttgtagataaccgagcaccccgcatagacctctccgtgattgaggtgaccttgaactcccaagatcctttacg
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aacagcttttgacaccatgtttatgttag

Protein
Protein IDpfu_aug2.0_64.1_13528.t1
Definition-
>pfu_aug2.0_64.1_13528.t1
MDSAVELAIPLAEMMEDAGNNNTQKIGEVINDVAYNFLSSSSAEFDRDQASNILSTAVSILESAAKTGVLAPKVITEAQS
KAFQLAALVLGVVDSGSGNRRRKRAVDDSNTKTSMTKAEAESILSTYSVTFSGQAEADIAKPDVDDYLTAIDNIRMGLCA
EVVYGEVATVAESSMETVRVVKTTVDTIATEVIDVTCQNCAVTQTAKITYGASIQSDYTQWNCTSTENCNGACFTSSQLN
KDLVTATSSQRFTMDLTRRSDIISIKMVNPSTHDIMTVENLTSPIMITVPINGDVNETEYMLQCKRWSVDTWTDTGCDSS
TPYLSNDTYYVHCSCNSLGIFSVFEGTIMEATTQVAMTTNADIETVSMVTSDLDMTSDYTDTTEDMMTETMTTSPVVNTT
VMSTTLATTTLASRVSVPKDTDKVYIMFKVHGVYDTVVENDKDAFLEHLHRDLATYMRIAESRINNLKVTKGSIIINFEL
LSRTRTTELTLGEVVYILLQGVQTGSLPLTDLQGNSLVLDIHSFMWSINQLEPPSESSSKMTVYIVGGAIGAFVLLVFLT
GAFLYIFKVKAGKAHQVSQSPQPLYGPNMQGVDVPRPSGKQTGVVGNWVRNESETAASSCSGTIKVQEKDAPPGDEDSDP
PPRYSALSPPTIDQEKSPQTTRAPLPPIGV
Protein IDpfu_aug2.0_64.1_13528.t2
Definition-
>pfu_aug2.0_64.1_13528.t2
MFCLAKRRCVYVDQDCNDYPYTPDNTHHCGDNEMFCLAKRRCVYVDQDCNDYPYTPHNTHHCGDNEMFCLTERRCVHVDQ
DCNDYPYTPDNTHHCGDDEMFCLTERRCVHVDGDCTDNHPYTPDNTHHCGDDEMFCLTERRCVHVDGDCTDNYPYTPDNT
HHCGDDEMFCLSTKECVATECAQTKSIECPPSQVYCHTTGRCSDIVSCSDDFTHMTSTMDSNEFTHLTNSRDPTYVTGET
DTMPTEHTVTGKTLPAEHTVTGETDTMPMEHTVTGETDTMPMEHTVTGKTNTMPAEHTVTGKTLPAEHSVTGETDTKPTE
HTTVVYTFAGNRVLLLDEPISVGDSSDFSLGDIDSGTLSQVDSVTIDCDSSAQTGVNLYKGRMMLDNSHLIHRDDRLTWT
TQGMADGLVTCMLKNIPTHIAMGYHYHIGVLAIPRSLPPPLVTMKYNRTTITEGTTVLKLHDPWDMFDVRYEDHEPVIDS
SLEIITNKSYAMHNYKMKVHYMQQNMPLVGHLAFHQMPLDPTGLPLADIQSWSGSDQQWTRIPYTGLKIDMTQKPSDMRV
VFKDSYSGELDIAFNLKSGELSYDFVFKIEVLSVNDAPELISGDRLISIIEDTMVLPYSGNREFLVSKDITSKLLHDKDG
STELGLAVLGAFTDRAGYWSYHDGENYTEIMADSRLRSVLTQGMSVNMTAILLRPQHKLMFTPTISYLWSQREAWAETRL
LVLGWDMSNVDGTDTDSHVMDIEMMPCGFSMLCGPGGSSPFSAEIIPLFVGKAGCDGIPGSQMEEDSCDVCGGHDDCIDC
NGDVKGDAVTNICDHCVGGTTGLALDHGIDCRQKCEEYTTIDIPMIGVSMCLPTSTDISSILSVYLSCDGQFISDAFINQ
CNHCVLGNTSLPADHGMNACGSCHGDTFCIDCNGEPYGLSMLDNCNNCLLPTDPTFNTGCQKLGSVNPSVMGASGTRKLR
VSGAQLNNYHTADCRLQDISDTSRIIPMEIEAGDFLPDQNVIMGKINDLMSAHAGVYHVFCIFDGNNGTELELVDHDVTL
FDFPILEELHPQEMTLKEQPVVLVQGSGFIDTSYISCALRCLYVDPAINCFTDKLEPSGLVLFPAKRLNDSYVECDLAKM
SHVRRAMGYHMTVLLERPAMVNINSLTFKEFGVLAPAPRLLSARFSSSYCFITLTFNMAVEGTEGHLFTPNTMAALGSGA
KFSFRGNQLVIIVQRGNLQLKPGDNMTLLAEKIRPLNSHVNYTEFASGSVMVEEPHSSFPLDGTLSGPNDVGSCDQFSLT
LKLGKMGCAVLEYNWTVTVNHSSPSQAMLNDAQAVQHRLNNNNRGRTFTIQEDEVLPGSTYIFTITLARHMDSTYTELSV
PVTRSLADKPISVQLLMMSLSPDPGQPIRFVASLTTSNCSGINIQETTFLYNWQGNSADFSIMSFMQFAIVKGGSLRGGT
TYTISVTVFVQDDDSITDTASVTFTTISRPLQLLVPPLIQTLPYLATTLTVTGVDPNNMPQSPIYTWNCAKESEPNLPVY
VTVNNERRMLEEYVRPASDSDNSITIPENTLPLGRYIWTIKMLKDIRSVSMSTIMEVVDNRAPRIDLSVIEVTLNSQDPL
RIGCKITTYSKSPVLLYWDCASEENCFDLYQYSNTLIFESDVSLSDYDYSLYLPGNLPTSGQLDLAITAVAGEELLTTTE
AVTVIINSPPMIGSVQITPENGTAFDTMFMLEMDEGWIDPEGDTVLFYIYTQKVGTNTRKRLNARGLQDVMSHNLMLPSD
MDSAVELAIPLAEMMEDAGNNNTQKIGEVINDVAYNFLSSSSAEFDRDQASNILSTAVSILESAAKTGVLAPKVITEAQS
KAFQLAALVLGVVDSGSGNRRRKRAVDDSNTKTSMTKAEAESILSTYSVTFSGQAEADIAKPDVDDYLTAIDNIRMGLCA
EVVYGEVATVAESSMETVRVVKTTVDTIATEVIDVTCQNCAVTQTAKITYGASIQSDYTQWNCTSTENCNGACFTSSQLN
KDLVTATSSQRFTMDLTRRSDIISIKMVNPSTHDIMTVENLTSPIMITVPINGDVNETEYMLQCKRWSVDTWTDTGCDSS
TPYLSNDTYYVHCSCNSLGIFSVFEGTIMEATTQVAMTTNADIETVSMVTSDLDMTSDYTDTTEDMMTETMTTSPVVNTT
VMSTTLATTTLASRVSVPKDTDKVYIMFKVHGVYDTVVENDKDAFLEHLHRDLATYMRIAESRINNLKVTKGSIIINFEL
LSRTRTTELTLGEVVYILLQGVQTGSLPLTDLQGNSLVLDIHSFMWSINQLEPPSESSSKMTVYIVGGAIGAFVLLVFLT
GAFLYIFKVKAGKAHQVSQSPQPLYGPNMQGVDVPRPSGKQTGVVGNWVRNESETAASSCSGTIKVQEKDAPPGDEDSDP
PPRYSALSPPTIDQEKSPQTTRAPLPPIGV
Protein IDpfu_aug2.0_64.1_13528.t3
Definition-
>pfu_aug2.0_64.1_13528.t3
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