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OIST Marine Genomics Unit since 2008

Gene
Gene Model IDpfu_aug2.0_7.1_23207
Locus scaffold7.1 : 293057 ... 401783 : +
To GenomeBrowser scaffold7.1:293057..401783
Genes list of scaffold scaffold7.1
Synonym pfu_aug1.0_6334.1_09322

Manual annotation
Hmmer Search for Pfam
query Total ID Target From To Eval Score cEval iEval Score
pfu_aug2.0_7.1_23207.t1 2 1 WAP 3837 3881 4.9e-17 61.6 1.2e-11 3.5e-08 33.2
pfu_aug2.0_7.1_23207.t1 2 2 WAP 4204 4248 4.9e-17 61.6 2.6e-11 7.6e-08 32.1
pfu_aug2.0_7.1_23207.t1 1 1 YHYH 4445 4496 6.5e-09 35.6 6.2e-12 1.8e-08 34.2

Blast Hit to nr / sp
query Subject ID Subject Name evalue
pfu_aug2.0_7.1_23207.t1 gi|527245974|ref|XP_005141321.1| PREDICTED: uncharacterized protein LOC101879048 [Melopsittacus undulatus] 1.0e-06
pfu_aug2.0_7.1_23207.t1 gi|543263680|ref|XP_005422262.1| PREDICTED: WAP four-disulfide core domain protein 2-like isoform X1 [Geospiza fortis] 1.0e-06
pfu_aug2.0_7.1_23207.t1 gi|683920414|ref|XP_009091265.1| PREDICTED: WAP four-disulfide core domain protein 2-like [Serinus canaria] 1.0e-06
pfu_aug2.0_7.1_23207.t1 gi|675410792|ref|XP_008918332.1| PREDICTED: WAP four-disulfide core domain protein 2-like [Manacus vitellinus] 2.0e-06
pfu_aug2.0_7.1_23207.t1 gi|686602967|ref|XP_009277836.1| PREDICTED: WAP four-disulfide core domain protein 2 [Aptenodytes forsteri] 2.0e-06

Transcript
Transcript IDpfu_aug2.0_7.1_23207.t1
Definition-
>pfu_aug2.0_7.1_23207.t1
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Protein
Protein IDpfu_aug2.0_7.1_23207.t1
Definition-
>pfu_aug2.0_7.1_23207.t1
MGADRATDSWRNATVCVEDTMRRMDPYYHCSPTDMLTFYRAQLPYIQAIVPSGVDLSACLVTPGDVCGDYSIVMGYNRSM
QCLQDFAMVAASRTSLPHDITPQEFCGSLTTLLGCIEFHFAKMSQYYRCNRNAIARALNGSKDWFLQEFGLNITGCNATK
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LESKVMDGTFMIMDMNNNTLMLDQDSLYYEESYAGDIVPTMSPVTRACSNITIVEYIMNANSCLDTSSIMMVAKEADFCR
YIIDSLYCLERGIWSMFKEGCMANEYEKIAYYYNDMIKQLTSNKFEPTRCLYLLTTTTDMPMTTVRPSIYIPPGTLSVNV
TFMLYADYDVITQNDPGFQDRLKKNIAMSISVNESRIINMHLRPGSIYVTFDILPLPAGSSGVPLPDAVRKLESLIKFSS
LQVYSSNGVRIQVEPYSFQYIPNFQVCRNSTWLQENMREKCSEVVNYFEANSYAQNCNIDTTEWHVILYLRDSYICVNDT
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LYQHPGRCMQQSLLRRGVSCTPKSIGDLMQYYITYSAGRKDEFTNCSGIATLDYCQDPSAIMANAFPTCRYYFPYISDGA
SICSSARSLMVMCMNSTTPSNRYYSCTPEDYGGAILKDPSMLNKIRPGLGDRVSNCSFDSDTNTTRPTTPVVIPPVSQSV
NVRIRLDVAYSIAANDPDFVNRFKQAIANKLGISSSRITNMKIWNGSIIVSFDLEQPAPGSSEPSLTTAVQTLQTSIQSG
TFIIVDSKGVSLPIDSSYFLYIPDMTDCGNSTWVYMNVRSLCPDALHHFERNLTNDKCMVYKDIVGCMYVSLTLGRKKQC
DLGQLAMAMSQGISRLRSSRGFNATECFDSGDALPTAAPISGSMCHHPDIVRYVSKYQMFKTKMACLNMTLQMADPPSMC
AFADYRMVVDSHLETVMPGVGSEVRQYLNNTCQAPATDRCEDFMYDDSTVVRKCMYQYAMALNLTRMSGIDVLTCGGIGE
SFECIVRESYSRGLNCNRTELAAATAKWLRHWHFILQESHHFNISNVADVSETYMMACLDSVIDYAPLGKRPPCNQTGSL
ALIGGHCLVNMAKMYPHEIHLCSGVANTVMGCWNETYTHLTGQYCKPADFYNALKDQDQIINPVIKRNITRCAGIPSDCT
ADIIYKKHKKDVEMCVGGLWTVESQSGYVNGIMYSGWERCDMYNLVVSCVDGILKRNYTFCKREALFSESHNFFIYTPAN
FTGCSDKNISGDICTNGRAIAMTTFPSCGYLFNYSMHHDFCSRTLYHDLPACMNTSSNYMCPTVQYREAIHAARDFYGRK
DSRLVGIIDSCFMSGKVTTTMMPQYGICSNLTIVDSIIHSQGCFDTDSYRRAMSQQQFCLMLKSGADCLSSILWSSYRAV
CNRDQVSAILKFYVPLLRNYTIYDPVSCLDVLTGTGVNTTTTTTTVIPTISPTFPANTDAVNISFRIEADFDRVRGDQRF
LDSLKYNLSDSADVPLSRITNLQLTPGSIIVSFDLLPAMPGSNQVSLSKAISNLWSDIHYGKFDVYDSSGNYLYVVPSSF
YFMPVHYVCKNATLVHKYMRDNCSEAVYYFETNPNADKCSVYKDLIGCVYTGIAVWHSMGMKRCSLDDVIMSMAKNFSST
LKNAQGLNTTACIAPGEILPTTAPLETKMCLNPDVYRYYSKYSCGDDLMNFPANRTPEELCRMYHAKQQCIKSSLDINMP
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GASETYECIYRESLARNLSCDKETVLQQTMHVLKYTHWIIQGLQYFRVRNMSTVNFAALETFMRAESQGASFGLGSQCED
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